Impact de la qualité des prescriptions, du contrôle des infections et de la gestion des antimicrobiens sur la domination du microbiote intestinal par les agents pathogènes associés aux soins de santé (PILGRIM)

La prévalence des agents pathogènes résistants aux antimicrobiens a considérablement augmenté chez les patients hospitalisés dans le monde entier. Alors que diverses stratégies de gestion ont efficacement réduit le fardeau causé par le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline, les pathogènes résistants ayant une préférence pour la colonisation intestinale sont actuellement en augmentation. Par exemple, les entérocoques résistants à la vancomycine (ERV) et les entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu (EPE) constituent désormais une menace importante pour les patients hospitalisés dans le monde entier, car les infections dues à ces organismes nécessitent des traitements prolongés et entraînent des résultats inférieurs. De même, la charge de morbidité causée par l'infection à Clostridium difficile (ICD), la principale cause de diarrhée infectieuse nosocomiale, a augmenté en raison de l'émergence de souches hypervirulentes telles que les ribotypes 027 et 078. Des études moléculaires ont démontré qu'une exposition accrue à l'échelle de la population aux antibactériens à large spectre est une étape cruciale dans le déclenchement d'épidémies par sélection et expansion de C. difficile résistant.

Il s'agit d'une étude clinique globale, multinationale et multicentrique visant à évaluer l'impact d'une prescription antibactérienne inappropriée sur la domination intestinale par l'EPE ou l'ERV ou l'infection à C. difficile. Pour atteindre cet objectif, l'étude suivra de près la progression de la première acquisition d'organismes résistants aux médicaments à l'infection par ces bactéries au niveau d'un patient individuel.

Dans cette étude, nous établirons la séquence et les facteurs impliqués dans l'acquisition, la colonisation, la pression sélective, la prolifération/la domination/l'infection bactériennes pour l'EPE, l'ERV et le C. difficile. Nous émettons l'hypothèse que les mesures IC (Contrôle des infections ; prévention de l'acquisition d'agents pathogènes) et AMS (Gestion des antimicrobiens ; prévention de l'expansion clonale) conduisant à une part plus élevée d'utilisation appropriée d'anti-infectieux sont des stratégies efficaces pour prévenir ce développement. Le programme d'étude permettra une estimation précise de la part évitable de la colonisation et de l'infection nosocomiales par les ERV, les EPE et C. difficile.

Aucune intervention directe ne sera effectuée auprès des patients de l'étude. Au lieu de cela, les centres d'étude évalueront les indicateurs de qualité pour la mise en œuvre des mesures IC et AMS par l'observation active et l'agrégation des données. Les patients remplissant tous les critères d'inclusion et aucun critère d'exclusion seront invités à donner leur consentement pour être recrutés de manière prospective dans une étude de cohorte. Pendant la phase d'observation, les participants seront surveillés pour recevoir un traitement antibactérien et des échantillons de selles réguliers seront obtenus et stockés. Un comité interdisciplinaire et international de l'AMS évaluera de manière approfondie le traitement antibiotique par le biais d'un examen par un groupe d'experts. Une fois l'observation terminée, des échantillons de selles seront testés par lots pour la domination intestinale par les agents pathogènes cibles de cette étude. Des analyses statistiques seront effectuées pour étudier une association entre l'utilisation inappropriée d'antibiotiques par opposition à l'utilisation appropriée ou à l'absence d'antibiotiques et la domination intestinale. Si une domination est détectée, d'autres analyses de phénotype, de quantité, de résistance et de biologie moléculaire seront effectuées. Enfin, l'échantillon de référence sera testé pour la présence de l'espèce dominante afin de comprendre la source de l'agent pathogène, c'est-à-dire l'acquisition nosocomiale par rapport à l'acquisition ambulatoire.