Séquençage de l'exome entier et séquençage du génome entier pour l'hydrops fœtal/néonatal non immunisé
13 juillet 2026 mis à jour par: Huda Al-Kouatly, Thomas Jefferson University
Bref résumé : L'hydrops fœtal non immun (NIHF) est une affection potentiellement mortelle caractérisée par une accumulation anormale de liquide dans deux compartiments fœtaux ou plus.
De nombreuses étiologies peuvent conduire à une NIHF, et la cause sous-jacente reste souvent incertaine (1).
La norme actuelle des tests de diagnostic génétique comprend un caryotype fœtal et un microréseau chromosomique (CMA), avec une option pour poursuivre les tests de gène unique sur les amniocytes collectés par amniocentèse (2).
Un grand sous-groupe des causes du NIHF comprend des troubles monogéniques qui ne sont pas diagnostiqués avec le bilan génétique standard pour l'hydrops.
Actuellement, près de 1 cas de NIHF sur 5 est défini comme idiopathique, ce qui signifie qu'il n'y a pas d'étiologie identifiée (2).
Les enquêteurs pensent que cela est dû au fait que les causes de la NIHF ne sont pas complètement étudiées, en particulier les maladies monogéniques.
Notre étude de recherche vise à augmenter le rendement diagnostique en effectuant le séquençage de l'exome entier (WES) et le séquençage du génome entier (WGS) sur les cas prénataux et néonataux de NIHF lorsque le test génétique standard est négatif, en identifiant les gènes connus et nouveaux, fournissant ainsi des informations vitales aux familles concernant le diagnostic spécifique et le risque pour les futures grossesses.
Les enquêteurs prévoient d'effectuer WES comme test de diagnostic initial.
Si WES est négatif, les enquêteurs procéderont à la réalisation de WGS.
Aperçu de l'étude
Statut
Complété
Intervention / Traitement
Description détaillée
Il s'agit d'une conception d'étude de cohorte prospective pour les fœtus ou les nouveau-nés atteints de NIHF.
Des trios mère-père-fœtus de grossesses compliquées d'hydrops fœtal idiopathique non immunisé seront identifiés.
Ces patients seront conseillés par un spécialiste en médecine maternelle et fœtale, comme c'est la routine.
Dans le cadre du bilan de routine, une amniocentèse sera recommandée pour le caryotype, le CMA et un bilan infectieux.
L'amniocentèse sera réalisée par le spécialiste en médecine maternelle et fœtale de l'établissement référent.
Le patient se verra également proposer un conseil génétique (de routine).
Les sujets se verront proposer une inscription lorsque les critères d'inclusion seront remplis.
Après l'inscription, les échantillons suivants seront prélevés : (1) sang maternel (2) sang paternel, (3) ADN fœtal isolé à partir d'amniocytes (4) sang néonatal lorsque la référence est effectuée après la naissance.
Les résultats du WES seront rapportés au conseiller en génétique dédié à l'étude.
Les parents seront contactés par le conseiller en génétique et conseillés sur les résultats, qu'ils soient positifs ou négatifs.
Le résultat sera également communiqué au principal fournisseur de MFM ou au pédiatre du patient et les références appropriées aux spécialistes en génétique pédiatrique seront faites par le fournisseur principal.
Dans les cas où aucune maladie génétique n'est identifiée, l'échantillon sera stocké, puis un séquençage du génome entier sera effectué.
Type d'étude
Observationnel
Inscription (Réel)
55
Contacts et emplacements
Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.
Lieux d'étude
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, États-Unis, 19107
- Thomas Jefferson University
-
-
Critères de participation
Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
12 ans à 51 ans (Enfant, Adulte)
Accepte les volontaires sains
Non
Méthode d'échantillonnage
Échantillon non probabiliste
Population étudiée
Les patients seront recrutés parmi les médecins MFM, les pédiatres et les néonatologistes.
La description
Les critères d'inclusion suivants s'appliqueront :
- Hydrops fœtal identifié à tout moment de la grossesse après le premier trimestre
- Les parents prévoient de procéder à l'amniocentèse comme bilan de routine pour l'hydrops.
- Les deux parents sont disponibles pour le prélèvement sanguin
- CMA normal et caryotype normal si effectué
- Bilan négatif pour le parvovirus B19, le cytomégalovirus, la toxoplasmose et la syphilis
- Bilan d'hémorragie fœto-maternelle négatif comme cause d'hydrops Pour les cas d'hydrops néonatal, les critères de test prénatal invasif ne seront pas requis car un échantillon de sang postnatal du nourrisson hydropique sera la source de l'ADN probant.
Les critères d'exclusion suivants s'appliqueront :
- Le microréseau était anormal ou le caryotype était anormal
- Hydrops causé par une infection congénitale
- L'hémorragie fœto-maternelle était une étiologie documentée de l'hydrops
- L'ADN parental ne peut être obtenu pour aucun des parents
- L'ovule du donneur ou le sperme du donneur ont été utilisés pour la conception
- Fœtus / Nourrisson diagnostiqué avec une maladie de surcharge lysosomale
- Femme enceinte ou père du bébé de moins de 16 ans
- L'hydrops a été diagnostiqué en même temps que la mort fœtale intra-utérine
Plan d'étude
Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Éventuel
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
|---|---|
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Fœtus
ADN obtenu à partir d'échantillons de liquide amniotique
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Le séquençage de l'exome entier (WES) fournit des informations plus détaillées grâce à une plus grande résolution, en identifiant les modifications d'une seule paire de bases et les petites insertions et suppressions.
WES effectue un séquençage sur les exons codant pour les protéines, qui sont contenus dans 1 à 2 % du génome mais représentent plus de 85 % de toutes les mutations pathogènes connues.
Le séquençage du génome entier (WGS) est apparu ces dernières années comme un outil de diagnostic qui séquence le génome entier et peut détecter les insertions ou la suppression de bases, les variantes structurelles et les variations introniques d'un seul nucléotide.
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Nouveau-nés
ADN obtenu à partir d'échantillons de sang néonatal
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Le séquençage de l'exome entier (WES) fournit des informations plus détaillées grâce à une plus grande résolution, en identifiant les modifications d'une seule paire de bases et les petites insertions et suppressions.
WES effectue un séquençage sur les exons codant pour les protéines, qui sont contenus dans 1 à 2 % du génome mais représentent plus de 85 % de toutes les mutations pathogènes connues.
Le séquençage du génome entier (WGS) est apparu ces dernières années comme un outil de diagnostic qui séquence le génome entier et peut détecter les insertions ou la suppression de bases, les variantes structurelles et les variations introniques d'un seul nucléotide.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Délai |
|---|---|
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Identifier les troubles monogéniques connus qui ne seraient pas détectés par microréseau comme cause d'hydrops fœtal non immun en effectuant un séquençage de l'exome entier (WES)
Délai: 5 années
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5 années
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Identifier de nouveaux troubles génétiques associés aux hydrops non immuns
Délai: 5 années
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5 années
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Délai |
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Évaluer la valeur supplémentaire du séquençage du génome entier (WGS) dans l'évaluation de l'hydrops fœtal lorsque le WES est négatif
Délai: 5 années
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5 années
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Mieux conseiller les parents sur l'étiologie de l'hydrops, surtout s'ils souhaitent une grossesse ultérieure
Délai: 5 années
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5 années
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Collaborateurs et enquêteurs
C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Huda B Al-Kouatly, MD, Thomas Jefferson University
Publications et liens utiles
La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.
Publications générales
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
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- Rice SM, Varotsis DF, Wodoslawsky S, Critchlow E, Liu R, McLaren RA Jr, Makhamreh MM, Firman B, Berger SI, Al-Kouatly HB. Prenatal Phenotype of Alkuraya-Kucinskas Syndrome: A Novel Case and Systematic Literature Review. Prenat Diagn. 2024 Oct;44(11):1381-1397. doi: 10.1002/pd.6637. Epub 2024 Sep 3.
Dates d'enregistrement des études
Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
15 janvier 2019
Achèvement primaire (Réel)
30 décembre 2025
Achèvement de l'étude (Réel)
31 décembre 2025
Dates d'inscription aux études
Première soumission
9 avril 2019
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
9 avril 2019
Première publication (Réel)
11 avril 2019
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
14 juillet 2026
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
13 juillet 2026
Dernière vérification
1 juillet 2026
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- IRB18D.728
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
OUI
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Non
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Non
produit fabriqué et exporté des États-Unis.
Non
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