Helexomsekvensering och helgenomsekvensering för icke-immun fetal/neonatal hydrops
13 juli 2026 uppdaterad av: Huda Al-Kouatly, Thomas Jefferson University
Kort sammanfattning: Noimmun hydrops fetalis (NIHF) är ett potentiellt dödligt tillstånd som kännetecknas av onormal vätskeansamling i två eller flera fosteravdelningar.
Många etiologier kan leda till NIHF, och den bakomliggande orsaken förblir ofta oklar (1).
Den nuvarande standarden för genetisk diagnostisk testning inkluderar en fetal karyotyp och en kromosomal mikroarray (CMA), med möjlighet att utföra enstaka gentestning på amniocyter som samlats in genom fostervattenprov (2).
En stor undergrupp av NIHF-orsakerna inkluderar enstaka genstörningar som inte diagnostiseras med den vanliga genetiska upparbetningen för hydrops.
För närvarande definieras nästan 1 av 5 fall av NIHF som idiopatisk, vilket betyder att det inte finns någon identifierad etiologi (2).
Utredarna tror att detta beror på att orsakerna till NIHF inte är fullständigt utredda, särskilt enstaka genstörningar.
Vår forskningsstudie syftar till att öka det diagnostiska utbytet genom att utföra hel exome-sekvensering (WES) och helgenomsekvensering (WGS) på prenatala och neonatala NIHF-fall när standardgentestning är negativ, identifiera kända och nya gener, vilket ger viktig information till familjer angående den specifika diagnosen och risken för framtida graviditeter.
Utredarna planerar att utföra WES som det initiala diagnostiska testet.
Om WES är negativt kommer utredarna att fortsätta att utföra WGS.
Studieöversikt
Status
Avslutad
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Detta är en prospektiv kohortstudiedesign för foster eller nyfödda som drabbats av NIHF.
Mor-far-foster trios av graviditeter komplicerade av idiopatiska icke-immuna fetala hydrops kommer att identifieras.
Dessa patienter kommer att rådgöras av en specialist på maternal-fostermedicin, vilket skulle vara rutin.
Som en del av den rutinmässiga upparbetningen kommer fostervattenprov att rekommenderas för karyotyp, CMA och en infektiös upparbetning.
Fostervattenprov kommer att utföras av specialisten på mödra-fostermedicin vid den remitterande institutionen.
Patienten kommer även att erbjudas genetisk rådgivning (rutin).
Ämnen kommer att erbjudas registrering när inklusionskriterierna är uppfyllda.
Efter registreringen kommer följande prover att samlas in: (1) moderns blod (2) faderns blod, (3) foster-DNA isolerat från amniocyter (4) neonatalt blod när remissen görs postnatalt.
WES-resultaten kommer att rapporteras till den genetiska rådgivare som är dedikerad till studien.
Föräldrarna kommer att kontaktas av den genetiska rådgivaren och rådfrågas om fynden om de var positiva eller negativa.
Resultatet kommer också att kommuniceras till patientens primära MFM-leverantör eller barnläkare och lämpliga remisser till pediatriska genetikspecialister kommer att göras av den primära leverantören.
I de fall där ingen genetisk störning identifieras kommer provet att lagras och därefter kommer hela genomsekvensering att utföras.
Studietyp
Observationell
Inskrivning (Faktisk)
55
Kontakter och platser
Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.
Studieorter
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Förenta staterna, 19107
- Thomas Jefferson University
-
-
Deltagandekriterier
Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
12 år till 51 år (Barn, Vuxen)
Tar emot friska volontärer
Nej
Testmetod
Icke-sannolikhetsprov
Studera befolkning
Patienter kommer att rekryteras från MFM-läkare, barnläkare och neonatologer.
Beskrivning
Följande inkluderingskriterier kommer att gälla:
- Fetal hydrops identifieras när som helst under graviditeten efter första trimestern
- Föräldrar planerar att fortsätta med fostervattenprov som en rutinmässig upparbetning av hydrops.
- Båda föräldrarna finns tillgängliga för blodprovtagning
- Normal CMA och normal karyotyp om utförd
- Negativ upparbetning för Parvovirus B19, cytomegalovirus, toxoplasmos och syfilis
- Negativ fosterblödning som orsak till hydrops För fall av neonatal hydrops kommer kriterierna för invasiv prenatal testning inte att krävas eftersom ett postnatalt blodprov från det hydropiska barnet kommer att vara källan till proband-DNA.
Följande uteslutningskriterier kommer att gälla:
- Microarray var onormal eller karyotyp var onormal
- Hydrops orsakade av medfödd infektion
- Fosterblödning var en dokumenterad etiologi för hydrops
- Föräldra-DNA kan inte erhållas för någon av föräldrarna
- Donatorägg eller donatorspermier användes för befruktning
- Foster/Spädbarn diagnostiserat med lysosomal lagringssjukdom
- Gravid kvinna eller far till barnet under 16 år
- Hydrops diagnostiserades samtidigt med intrauterin fosterdöd
Studieplan
Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiv: Blivande
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Foster
DNA erhållet från fostervattenprover
|
Whole exome Sequencing (WES) ger mer detaljerad information genom högre upplösning, identifierar förändringar i enstaka baspar och små insättningar och borttagningar.
WES utför sekvensering på de proteinkodande exonerna, som finns i 1-2 % av genomet men utgör över 85 % av alla kända patogena mutationer.
Whole Genome Sequencing (WGS) har dykt upp de senaste åren som ett diagnostiskt verktyg som sekvenserar hela genomet och kan plocka upp insertioner eller deletioner av baser, strukturella varianter och introniska enkelnukleotidvariationer.
|
|
Nyfödda
DNA erhållet från neonatala blodprover
|
Whole exome Sequencing (WES) ger mer detaljerad information genom högre upplösning, identifierar förändringar i enstaka baspar och små insättningar och borttagningar.
WES utför sekvensering på de proteinkodande exonerna, som finns i 1-2 % av genomet men utgör över 85 % av alla kända patogena mutationer.
Whole Genome Sequencing (WGS) har dykt upp de senaste åren som ett diagnostiskt verktyg som sekvenserar hela genomet och kan plocka upp insertioner eller deletioner av baser, strukturella varianter och introniska enkelnukleotidvariationer.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Tidsram |
|---|---|
|
Identifiera kända enstaka genstörningar som inte skulle detekteras av mikroarray som en orsak till icke-immun fetal hydrops genom att utföra hel exome-sekvensering (WES)
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Identifiera nya genetiska störningar associerade med icke-immuna hydrops
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Tidsram |
|---|---|
|
Utvärdera det inkrementella värdet av helgenomsekvensering (WGS) i utvärderingen av fetala hydrops när WES är negativ
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Bättre rådfråga föräldrarna om etiologin för hydrops, särskilt om de önskar en efterföljande graviditet
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
Samarbetspartners och utredare
Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.
Sponsor
Utredare
- Huvudutredare: Huda B Al-Kouatly, MD, Thomas Jefferson University
Publikationer och användbara länkar
Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.
Allmänna publikationer
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Raymond M, Critchlow E, Rice SM, Wodoslawsky S, Berger SI, Hegde M, Empey PE, Al-Kouatly HB. Fetal pharmacogenomics: A promising addition to complex neonatal care. Mol Genet Metab. 2022 Sep-Oct;137(1-2):140-145. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.08.002. Epub 2022 Aug 12.
- Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM); Norton ME, Chauhan SP, Dashe JS. Society for maternal-fetal medicine (SMFM) clinical guideline #7: nonimmune hydrops fetalis. Am J Obstet Gynecol. 2015 Feb;212(2):127-39. doi: 10.1016/j.ajog.2014.12.018. Epub 2014 Dec 31.
- Rice SM, Varotsis DF, Wodoslawsky S, Critchlow E, Liu R, McLaren RA Jr, Makhamreh MM, Firman B, Berger SI, Al-Kouatly HB. Prenatal Phenotype of Alkuraya-Kucinskas Syndrome: A Novel Case and Systematic Literature Review. Prenat Diagn. 2024 Oct;44(11):1381-1397. doi: 10.1002/pd.6637. Epub 2024 Sep 3.
Studieavstämningsdatum
Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
15 januari 2019
Primärt slutförande (Faktisk)
30 december 2025
Avslutad studie (Faktisk)
31 december 2025
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
9 april 2019
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
9 april 2019
Första postat (Faktisk)
11 april 2019
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
14 juli 2026
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
13 juli 2026
Senast verifierad
1 juli 2026
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- IRB18D.728
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
JA
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Nej
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Nej
produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.
Nej
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .