Полноэкзомное секвенирование и полногеномное секвенирование при неиммунной водянке плода/неонатального организма
13 июля 2026 г. обновлено: Huda Al-Kouatly, Thomas Jefferson University
Краткое резюме: Неиммунная водянка плода (NIHF) представляет собой потенциально фатальное состояние, характеризующееся аномальным накоплением жидкости в двух или более отделах плода.
Многочисленные этиологии могут привести к NIHF, и основная причина часто остается неясной (1).
Текущий стандарт генетического диагностического тестирования включает кариотип плода и хромосомный микрочип (CMA) с возможностью проведения тестирования одного гена на амниоцитах, собранных с помощью амниоцентеза (2).
Большая подгруппа причин NIHF включает нарушения одного гена, которые не диагностируются стандартным генетическим исследованием водянки.
В настоящее время почти 1 из 5 случаев NIHF определяется как идиопатический, что означает отсутствие установленной этиологии (2).
Исследователи считают, что это связано с тем, что причины NIHF не полностью изучены, в частности, нарушения одного гена.
Наше исследование направлено на повышение диагностической ценности за счет секвенирования всего экзома (WES) и секвенирования всего генома (WGS) в пренатальных и неонатальных случаях NIHF, когда стандартное генетическое тестирование дает отрицательный результат, идентифицируя известные и новые гены, таким образом предоставляя семьям жизненно важную информацию относительно конкретный диагноз и риск будущих беременностей.
Исследователи планируют выполнить WES в качестве начального диагностического теста.
Если WES отрицательный, исследователи приступят к выполнению WGS.
Обзор исследования
Статус
Завершенный
Подробное описание
Это проспективный дизайн когортного исследования для плодов или новорожденных, пораженных NIHF.
Будут выявлены тройные беременности мать-отец-плод, осложненные идиопатической неиммунной водянкой плода.
Эти пациенты будут консультированы специалистом по материнско-фетальной медицине, как обычно.
В рамках планового обследования будет рекомендован амниоцентез для определения кариотипа, CMA и инфекционного обследования.
Амниоцентез будет выполнять специалист по материнско-фетальной медицине направляющего учреждения.
Пациенту также будет предложено генетическое консультирование (плановое).
Субъектам будет предложено зачисление при соблюдении критериев включения.
После регистрации будут взяты следующие образцы: (1) материнская кровь (2) отцовская кровь, (3) ДНК плода, выделенная из амниоцитов (4) неонатальная кровь, если направление делается постнатально.
Результаты WES будут сообщены генетическому консультанту, занимающемуся исследованием.
Генетический консультант свяжется с родителями и проконсультирует их относительно того, были ли они положительными или отрицательными.
Результат также будет сообщен основному медработнику MFM пациента или педиатру, и первичный поставщик направит соответствующие направления к педиатрическим специалистам-генетикам.
В тех случаях, когда генетическое заболевание не выявлено, образец будет сохранен, а затем будет проведено секвенирование всего генома.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Действительный)
55
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Соединенные Штаты, 19107
- Thomas Jefferson University
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
От 12 лет до 51 год (Ребенок, Взрослый)
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Метод выборки
Невероятностная выборка
Исследуемая популяция
Пациенты будут набираться из числа врачей MFM, педиатров и неонатологов.
Описание
Будут применяться следующие критерии включения:
- Водянка плода выявляется в любое время беременности после первого триместра
- Родители планируют провести амниоцентез в качестве рутинного обследования при водянке.
- Оба родителя доступны для забора крови
- Нормальная CMA и нормальный кариотип, если выполняется
- Отрицательный результат исследования на парвовирус В19, цитомегаловирус, токсоплазмоз и сифилис.
- Отрицательный результат исследования плодо-материнского кровотечения как причины водянки. В случае неонатальной водянки критерии инвазивного пренатального тестирования не потребуются, поскольку источником пробандной ДНК будет образец постнатальной крови от водянистого младенца.
Будут применяться следующие критерии исключения:
- Аномальный микрочип или аномальный кариотип
- Водянка, вызванная врожденной инфекцией
- Фетоматеринское кровотечение было задокументированной причиной водянки.
- Родительская ДНК не может быть получена ни для одного из родителей.
- Для зачатия использовались донорская яйцеклетка или донорская сперма.
- У плода/младенца диагностирована лизосомная болезнь накопления
- Беременная женщина или отец ребенка младше 16 лет
- Водянка диагностирована одновременно с внутриутробной гибелью плода.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Когорта
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Плоды
ДНК, полученная из образцов амниотической жидкости
|
Секвенирование всего экзома (WES) предоставляет более подробную информацию за счет большего разрешения, выявления изменений в одной паре оснований, а также небольших вставок и делеций.
WES выполняет секвенирование экзонов, кодирующих белок, которые составляют 1-2% генома, но составляют более 85% всех известных патогенных мутаций.
Секвенирование всего генома (WGS) появилось в последние годы как диагностический инструмент, который секвенирует весь геном и может обнаруживать вставки или делеции оснований, структурные варианты и интронные вариации отдельных нуклеотидов.
|
|
Новорожденные
ДНК, полученная из образцов крови новорожденных
|
Секвенирование всего экзома (WES) предоставляет более подробную информацию за счет большего разрешения, выявления изменений в одной паре оснований, а также небольших вставок и делеций.
WES выполняет секвенирование экзонов, кодирующих белок, которые составляют 1-2% генома, но составляют более 85% всех известных патогенных мутаций.
Секвенирование всего генома (WGS) появилось в последние годы как диагностический инструмент, который секвенирует весь геном и может обнаруживать вставки или делеции оснований, структурные варианты и интронные вариации отдельных нуклеотидов.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Выявить известные нарушения одного гена, которые не могут быть обнаружены с помощью микрочипа, как причину неиммунной водянки плода, выполнив полноэкзомное секвенирование (WES).
Временное ограничение: 5 лет
|
5 лет
|
|
Выявить новые генетические нарушения, связанные с неиммунной водянкой.
Временное ограничение: 5 лет
|
5 лет
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Оценить дополнительную ценность секвенирования всего генома (WGS) в оценке водянки плода, когда WES отрицательный
Временное ограничение: 5 лет
|
5 лет
|
|
Лучше проконсультировать родителей об этиологии водянки, особенно если они желают последующей беременности.
Временное ограничение: 5 лет
|
5 лет
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Huda B Al-Kouatly, MD, Thomas Jefferson University
Публикации и полезные ссылки
Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.
Общие публикации
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Raymond M, Critchlow E, Rice SM, Wodoslawsky S, Berger SI, Hegde M, Empey PE, Al-Kouatly HB. Fetal pharmacogenomics: A promising addition to complex neonatal care. Mol Genet Metab. 2022 Sep-Oct;137(1-2):140-145. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.08.002. Epub 2022 Aug 12.
- Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM); Norton ME, Chauhan SP, Dashe JS. Society for maternal-fetal medicine (SMFM) clinical guideline #7: nonimmune hydrops fetalis. Am J Obstet Gynecol. 2015 Feb;212(2):127-39. doi: 10.1016/j.ajog.2014.12.018. Epub 2014 Dec 31.
- Rice SM, Varotsis DF, Wodoslawsky S, Critchlow E, Liu R, McLaren RA Jr, Makhamreh MM, Firman B, Berger SI, Al-Kouatly HB. Prenatal Phenotype of Alkuraya-Kucinskas Syndrome: A Novel Case and Systematic Literature Review. Prenat Diagn. 2024 Oct;44(11):1381-1397. doi: 10.1002/pd.6637. Epub 2024 Sep 3.
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
15 января 2019 г.
Первичное завершение (Действительный)
30 декабря 2025 г.
Завершение исследования (Действительный)
31 декабря 2025 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
9 апреля 2019 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
9 апреля 2019 г.
Первый опубликованный (Действительный)
11 апреля 2019 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
14 июля 2026 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
13 июля 2026 г.
Последняя проверка
1 июля 2026 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- IRB18D.728
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
ДА
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .