Whole Exome Sequencing en Whole Genome Sequencing voor niet-immune foetale/neonatale hydrops
13 juli 2026 bijgewerkt door: Huda Al-Kouatly, Thomas Jefferson University
Korte samenvatting: Niet-immune hydrops foetalis (NIHF) is een potentieel dodelijke aandoening die wordt gekenmerkt door abnormale vochtophoping in twee of meer foetale compartimenten.
Talrijke etiologieën kunnen tot NIHF leiden en de onderliggende oorzaak blijft vaak onduidelijk (1).
De huidige standaard van genetisch diagnostisch testen omvat een foetaal karyotype en chromosomale microarray (CMA), met een optie om enkelvoudige gentesten uit te voeren op amniocyten verzameld door vruchtwaterpunctie (2).
Een grote subgroep van de NIHF-oorzaken omvat aandoeningen met één gen die niet worden gediagnosticeerd met de standaard genetische opwerking voor hydrops.
Momenteel wordt bijna 1 op de 5 gevallen van NIHF gedefinieerd als idiopathisch, wat betekent dat er geen geïdentificeerde etiologie is (2).
De onderzoekers geloven dat dit komt omdat de oorzaken van NIHF niet volledig zijn onderzocht, met name aandoeningen met één gen.
Onze onderzoeksstudie heeft tot doel de diagnostische opbrengst te verhogen door hele exome sequencing (WES) en hele genome sequencing (WGS) uit te voeren op prenatale en neonatale NIHF-gevallen wanneer standaard genetische tests negatief zijn, bekende en nieuwe genen te identificeren, en zo essentiële informatie te verstrekken aan families over de specifieke diagnose en het risico voor toekomstige zwangerschappen.
De onderzoekers zijn van plan om WES uit te voeren als de eerste diagnostische test.
Als WES negatief is, gaan de onderzoekers over tot het uitvoeren van WGS.
Studie Overzicht
Toestand
Voltooid
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Dit is een ontwerp van een prospectieve cohortstudie voor foetussen of pasgeborenen met NIHF.
Moeder-vader-foetus-trio's van zwangerschappen gecompliceerd door idiopathische niet-immune foetale hydrops zullen worden geïdentificeerd.
Deze patiënten zullen worden begeleid door een specialist in maternale-foetale geneeskunde, zoals de routine zou zijn.
Als onderdeel van het routineonderzoek wordt vruchtwaterpunctie aanbevolen voor karyotype, CMA en een infectieus onderzoek.
De vruchtwaterpunctie wordt uitgevoerd door de specialist Maternale-Fetale Geneeskunde van de verwijzende instelling.
De patiënt krijgt ook erfelijkheidsadvisering (routinematig).
Onderwerpen krijgen inschrijving aangeboden wanneer aan de inclusiecriteria is voldaan.
Na inschrijving worden de volgende monsters afgenomen: (1) moederlijk bloed (2) vaderlijk bloed, (3) foetaal DNA geïsoleerd uit amniocyten (4) neonataal bloed wanneer postnataal wordt doorverwezen.
De WES-resultaten zullen worden gerapporteerd aan de genetisch adviseur die aan de studie is gewijd.
De ouders worden gecontacteerd door de genetisch adviseur en geadviseerd over de bevindingen, of deze nu positief of negatief waren.
Het resultaat zal ook worden meegedeeld aan de primaire MFM-aanbieder of kinderarts van de patiënt, en passende verwijzingen naar pediatrische genetica-specialisten zullen worden gemaakt door de primaire dienstverlener.
In gevallen waarin geen genetische afwijking wordt geïdentificeerd, wordt het monster opgeslagen en vervolgens wordt sequentiebepaling van het hele genoom uitgevoerd.
Studietype
Observationeel
Inschrijving (Werkelijk)
55
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studie Locaties
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Verenigde Staten, 19107
- Thomas Jefferson University
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
12 jaar tot 51 jaar (Kind, Volwassen)
Accepteert gezonde vrijwilligers
Nee
Bemonsteringsmethode
Niet-waarschijnlijkheidssteekproef
Studie Bevolking
Patiënten zullen worden gerekruteerd uit MFM-artsen, kinderartsen en neonatologen.
Beschrijving
De volgende opnamecriteria zijn van toepassing:
- Foetale hydrops geïdentificeerd op elk moment tijdens de zwangerschap na het eerste trimester
- Ouders zijn van plan door te gaan met vruchtwaterpunctie als routineonderzoek voor hydrops.
- Beide ouders zijn beschikbaar voor bloedafname
- Normale CMA en normaal karyotype indien uitgevoerd
- Negatieve opwerking voor Parvovirus B19, cytomegalovirus, toxoplasmose en syfilis
- Onderzoek naar negatieve foetomaternale bloeding als oorzaak van hydrops Voor gevallen van neonatale hydrops zijn de criteria voor invasieve prenatale tests niet vereist, aangezien een postnataal bloedmonster van de hydropische baby de bron van proband-DNA zal zijn.
De volgende uitsluitingscriteria zijn van toepassing:
- Microarray was abnormaal of karyotype was abnormaal
- Hydrops veroorzaakt door aangeboren infectie
- Fetomaternale bloeding was een gedocumenteerde etiologie voor hydrops
- Van beide ouders kan geen ouderlijk DNA worden verkregen
- Voor de bevruchting werden donoreicellen of donorsperma gebruikt
- Foetus/zuigeling gediagnosticeerd met lysosomale stapelingsziekte
- Zwangere vrouw of vader van de baby jonger dan 16 jaar
- Hydrops werd gelijktijdig met intra-uteriene foetale dood gediagnosticeerd
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Cohort
- Tijdsperspectieven: Prospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Foetussen
DNA verkregen uit vruchtwatermonsters
|
Whole exome sequencing (WES) biedt meer gedetailleerde informatie door een grotere resolutie, het identificeren van enkele basenpaarveranderingen en kleine inserties en deleties.
WES voert sequencing uit op de eiwitcoderende exons, die zich in 1-2% van het genoom bevinden, maar meer dan 85% uitmaken van alle bekende pathogene mutaties.
Whole Genome Sequencing (WGS) is de afgelopen jaren naar voren gekomen als een diagnostisch hulpmiddel dat het volledige genoom sequenteert en inserties of deleties van basen, structurele varianten en intronische enkele nucleotidevariaties kan oppikken.
|
|
Neonaten
DNA verkregen uit neonatale bloedmonsters
|
Whole exome sequencing (WES) biedt meer gedetailleerde informatie door een grotere resolutie, het identificeren van enkele basenpaarveranderingen en kleine inserties en deleties.
WES voert sequencing uit op de eiwitcoderende exons, die zich in 1-2% van het genoom bevinden, maar meer dan 85% uitmaken van alle bekende pathogene mutaties.
Whole Genome Sequencing (WGS) is de afgelopen jaren naar voren gekomen als een diagnostisch hulpmiddel dat het volledige genoom sequenteert en inserties of deleties van basen, structurele varianten en intronische enkele nucleotidevariaties kan oppikken.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
Identificeer bekende enkelvoudige genaandoeningen die niet door microarray zouden worden gedetecteerd als een oorzaak van niet-immune foetale hydrops door hele exome sequencing (WES) uit te voeren
Tijdsspanne: 5 jaar
|
5 jaar
|
|
Identificeer nieuwe genetische aandoeningen geassocieerd met niet-immune hydrops
Tijdsspanne: 5 jaar
|
5 jaar
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
Evalueer de incrementele waarde van whole genome sequencing (WGS) bij de evaluatie van foetale hydrops wanneer WES negatief is
Tijdsspanne: 5 jaar
|
5 jaar
|
|
Adviseer de ouders beter over de etiologie van hydrops, vooral als ze een volgende zwangerschap wensen
Tijdsspanne: 5 jaar
|
5 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Huda B Al-Kouatly, MD, Thomas Jefferson University
Publicaties en nuttige links
De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.
Algemene publicaties
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Raymond M, Critchlow E, Rice SM, Wodoslawsky S, Berger SI, Hegde M, Empey PE, Al-Kouatly HB. Fetal pharmacogenomics: A promising addition to complex neonatal care. Mol Genet Metab. 2022 Sep-Oct;137(1-2):140-145. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.08.002. Epub 2022 Aug 12.
- Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM); Norton ME, Chauhan SP, Dashe JS. Society for maternal-fetal medicine (SMFM) clinical guideline #7: nonimmune hydrops fetalis. Am J Obstet Gynecol. 2015 Feb;212(2):127-39. doi: 10.1016/j.ajog.2014.12.018. Epub 2014 Dec 31.
- Rice SM, Varotsis DF, Wodoslawsky S, Critchlow E, Liu R, McLaren RA Jr, Makhamreh MM, Firman B, Berger SI, Al-Kouatly HB. Prenatal Phenotype of Alkuraya-Kucinskas Syndrome: A Novel Case and Systematic Literature Review. Prenat Diagn. 2024 Oct;44(11):1381-1397. doi: 10.1002/pd.6637. Epub 2024 Sep 3.
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
15 januari 2019
Primaire voltooiing (Werkelijk)
30 december 2025
Studie voltooiing (Werkelijk)
31 december 2025
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
9 april 2019
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
9 april 2019
Eerst geplaatst (Werkelijk)
11 april 2019
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
14 juli 2026
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
13 juli 2026
Laatst geverifieerd
1 juli 2026
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- IRB18D.728
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
JA
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Nee
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Nee
product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.
Nee
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .