Sekwencjonowanie całego egzomu i całego genomu w przypadku nieodpornego obrzęku płodu/noworodka
13 lipca 2026 zaktualizowane przez: Huda Al-Kouatly, Thomas Jefferson University
Krótkie podsumowanie: Nieimmunologiczny obrzęk płodu (NIHF) jest stanem potencjalnie śmiertelnym, charakteryzującym się nieprawidłowym gromadzeniem się płynu w dwóch lub więcej przedziałach płodowych.
Liczne etiologie mogą prowadzić do NIHF, a podstawowa przyczyna często pozostaje niejasna (1).
Obecny standard diagnostyki genetycznej obejmuje badanie kariotypu płodu i mikromacierzy chromosomowych (CMA) z możliwością wykonania badania pojedynczego genu na amniocytach pobranych w drodze amniopunkcji (2).
Duża podgrupa przyczyn NIHF obejmuje zaburzenia pojedynczego genu, które nie są diagnozowane za pomocą standardowej obróbki genetycznej obrzęku.
Obecnie prawie 1 na 5 przypadków NIHF określa się jako idiopatyczny, co oznacza, że nie ma ustalonej etiologii (2).
Badacze uważają, że dzieje się tak, ponieważ przyczyny NIHF nie zostały w pełni zbadane, w szczególności zaburzenia pojedynczego genu.
Nasze badanie badawcze ma na celu zwiększenie wydajności diagnostycznej poprzez wykonanie sekwencjonowania całego egzomu (WES) i całego genomu (WGS) w przypadkach prenatalnych i noworodkowych NIHF, gdy standardowe testy genetyczne są ujemne, identyfikując znane i nowe geny, dostarczając w ten sposób istotnych informacji rodzinom dotyczącym specyficznej diagnozy i ryzyka dla przyszłych ciąż.
Badacze planują wykonanie WES jako wstępnego testu diagnostycznego.
Jeśli WES jest ujemny, badacze przystąpią do wykonania WGS.
Przegląd badań
Status
Zakończony
Szczegółowy opis
Jest to prospektywny projekt badania kohortowego dla płodów lub noworodków dotkniętych NIHF.
Zidentyfikowane zostaną trio matka-ojciec-płód powikłane idiopatycznym nieimmunologicznym obrzękiem płodu.
Pacjenci ci otrzymają poradę specjalisty medycyny matczyno-płodowej, tak jak to jest rutynowe.
W ramach rutynowych badań zalecana jest amniopunkcja w celu oceny kariotypu, CMA i badań infekcyjnych.
Amniopunkcja zostanie wykonana przez specjalistę medycyny matczyno-płodowej placówki kierującej.
Pacjentowi zostanie również zaproponowane poradnictwo genetyczne (rutynowe).
Uczestnikom zostanie zaoferowana rejestracja po spełnieniu kryteriów włączenia.
Po rejestracji zostaną pobrane następujące próbki: (1) krew matki, (2) krew ojca, (3) DNA płodu wyizolowane z amniocytów, (4) krew noworodka, jeśli skierowanie odbywa się po urodzeniu.
Wyniki WES zostaną przekazane doradcy genetycznemu wyznaczonemu do badania.
Doradca genetyczny skontaktuje się z rodzicami i udzieli porady na temat wyników, niezależnie od tego, czy były one pozytywne, czy negatywne.
Wynik zostanie również przekazany głównemu dostawcy MFM lub pediatrze pacjenta, a główny dostawca skieruje odpowiednie skierowania do specjalistów genetyki dziecięcej.
W przypadkach, w których nie zostanie zidentyfikowana choroba genetyczna, próbka zostanie przechowywana, a następnie zostanie przeprowadzone sekwencjonowanie całego genomu.
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Rzeczywisty)
55
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Lokalizacje studiów
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Stany Zjednoczone, 19107
- Thomas Jefferson University
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
12 lat do 51 lat (Dziecko, Dorosły)
Akceptuje zdrowych ochotników
Nie
Metoda próbkowania
Próbka bez prawdopodobieństwa
Badana populacja
Pacjenci będą rekrutowani spośród lekarzy MFM, pediatrów i neonatologów.
Opis
Obowiązują następujące kryteria włączenia:
- Obrzęk płodu stwierdzony w dowolnym momencie ciąży po pierwszym trymestrze ciąży
- Rodzice planują wykonać amniopunkcję jako rutynowe badanie w przypadku obrzęku.
- Oboje rodzice są dostępni do pobrania krwi
- Prawidłowy CMA i prawidłowy kariotyp, jeśli wykonano
- Negatywne badanie w kierunku parwowirusa B19, wirusa cytomegalii, toksoplazmozy i kiły
- Ujemny wynik badania krwotoku płodowo-matczynego jako przyczyna obrzęku W przypadkach obrzęku u noworodków kryteria inwazyjnych badań prenatalnych nie będą wymagane, ponieważ źródłem DNA probanda będzie próbka krwi pobranej od płodu.
Obowiązują następujące kryteria wykluczenia:
- Mikromacierz była nieprawidłowa lub kariotyp był nieprawidłowy
- Hydrops spowodowany wrodzoną infekcją
- Krwotok płodowo-matczyny był udokumentowaną etiologią obrzęków
- Rodzicielskiego DNA nie można uzyskać dla żadnego z rodziców
- Do poczęcia wykorzystano jajo dawcy lub nasienie dawcy
- U płodu/niemowlęcia zdiagnozowano lizosomalną chorobę spichrzeniową
- Kobieta w ciąży lub ojciec dziecka poniżej 16 roku życia
- Hydrops rozpoznano jednocześnie z wewnątrzmacicznym obumarciem płodu
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Kohorta
- Perspektywy czasowe: Spodziewany
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Płody
DNA uzyskane z próbek płynu owodniowego
|
Sekwencjonowanie całego egzomu (WES) dostarcza bardziej szczegółowych informacji dzięki większej rozdzielczości, identyfikując zmiany pojedynczych par zasad oraz małe insercje i delecje.
WES przeprowadza sekwencjonowanie eksonów kodujących białka, które stanowią 1-2% genomu, ale stanowią ponad 85% wszystkich znanych mutacji patogennych.
Sekwencjonowanie całego genomu (WGS) pojawiło się w ostatnich latach jako narzędzie diagnostyczne, które sekwencjonuje cały genom i może wykrywać insercje lub delecje zasad, warianty strukturalne i intronowe odmiany pojedynczych nukleotydów.
|
|
Noworodki
DNA uzyskane z próbek krwi noworodków
|
Sekwencjonowanie całego egzomu (WES) dostarcza bardziej szczegółowych informacji dzięki większej rozdzielczości, identyfikując zmiany pojedynczych par zasad oraz małe insercje i delecje.
WES przeprowadza sekwencjonowanie eksonów kodujących białka, które stanowią 1-2% genomu, ale stanowią ponad 85% wszystkich znanych mutacji patogennych.
Sekwencjonowanie całego genomu (WGS) pojawiło się w ostatnich latach jako narzędzie diagnostyczne, które sekwencjonuje cały genom i może wykrywać insercje lub delecje zasad, warianty strukturalne i intronowe odmiany pojedynczych nukleotydów.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Ramy czasowe |
|---|---|
|
Zidentyfikuj znane zaburzenia pojedynczego genu, które nie zostałyby wykryte za pomocą mikromacierzy jako przyczyny nieimmunologicznego obrzęku płodu, wykonując sekwencjonowanie całego egzomu (WES)
Ramy czasowe: 5 lat
|
5 lat
|
|
Zidentyfikuj nowe zaburzenia genetyczne związane z obrzękiem nieimmunologicznym
Ramy czasowe: 5 lat
|
5 lat
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Ramy czasowe |
|---|---|
|
Oceń przyrostową wartość sekwencjonowania całego genomu (WGS) w ocenie obrzęku płodu, gdy WES jest ujemny
Ramy czasowe: 5 lat
|
5 lat
|
|
Lepiej doradzić rodzicom o etiologii obrzęku, zwłaszcza jeśli chcą kolejnej ciąży
Ramy czasowe: 5 lat
|
5 lat
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Sponsor
Śledczy
- Główny śledczy: Huda B Al-Kouatly, MD, Thomas Jefferson University
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Publikacje ogólne
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Raymond M, Critchlow E, Rice SM, Wodoslawsky S, Berger SI, Hegde M, Empey PE, Al-Kouatly HB. Fetal pharmacogenomics: A promising addition to complex neonatal care. Mol Genet Metab. 2022 Sep-Oct;137(1-2):140-145. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.08.002. Epub 2022 Aug 12.
- Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM); Norton ME, Chauhan SP, Dashe JS. Society for maternal-fetal medicine (SMFM) clinical guideline #7: nonimmune hydrops fetalis. Am J Obstet Gynecol. 2015 Feb;212(2):127-39. doi: 10.1016/j.ajog.2014.12.018. Epub 2014 Dec 31.
- Rice SM, Varotsis DF, Wodoslawsky S, Critchlow E, Liu R, McLaren RA Jr, Makhamreh MM, Firman B, Berger SI, Al-Kouatly HB. Prenatal Phenotype of Alkuraya-Kucinskas Syndrome: A Novel Case and Systematic Literature Review. Prenat Diagn. 2024 Oct;44(11):1381-1397. doi: 10.1002/pd.6637. Epub 2024 Sep 3.
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
15 stycznia 2019
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
30 grudnia 2025
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
31 grudnia 2025
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
9 kwietnia 2019
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
9 kwietnia 2019
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
11 kwietnia 2019
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
14 lipca 2026
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
13 lipca 2026
Ostatnia weryfikacja
1 lipca 2026
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- IRB18D.728
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
TAK
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Nie
produkt wyprodukowany i wyeksportowany z USA
Nie
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .