非免疫性胎儿/新生儿水肿的全外显子组测序和全基因组测序
2023年11月21日 更新者：Huda Al-Kouatly、Thomas Jefferson University
简要概述：非免疫性胎儿水肿 (NIHF) 是一种可能致命的疾病，其特征是在两个或多个胎儿隔室中异常积液。
许多病因可能导致 NIHF，而根本原因通常仍不清楚 (1)。
当前的基因诊断测试标准包括胎儿核型和染色体微阵列 (CMA)，可选择对通过羊膜穿刺术收集的羊水细胞进行单基因测试 (2)。
NIHF 病因的一大子组包括未通过水肿的标准遗传检查诊断的单基因疾病。
目前，近五分之一的 NIHF 病例被定义为特发性，这意味着没有明确的病因 (2)。
研究人员认为这是因为 NIHF 的原因尚未完全调查清楚，特别是单基因疾病。
我们的研究旨在通过在标准基因检测呈阴性时对产前和新生儿 NIHF 病例进行全外显子组测序 (WES) 和全基因组测序 (WGS) 来提高诊断率，识别已知和新基因，从而为家庭提供重要信息具体诊断和未来怀孕的风险。
研究人员计划执行 WES 作为初始诊断测试。
如果 WES 为阴性，则研究人员将继续进行 WGS。
研究概览
详细说明
这是一项针对受 NIHF 影响的胎儿或新生儿的前瞻性队列研究设计。
将确定并发特发性非免疫性胎儿水肿的母亲-父亲-胎儿三重奏。
按照惯例，这些患者将接受母胎医学专家的咨询。
作为常规检查的一部分，将推荐羊膜穿刺术进行核型、CMA 和感染性检查。
羊膜穿刺术将由转诊机构的母胎医学专家进行。
还将为患者提供遗传咨询（常规）。
当符合纳入标准时，受试者将被录取。
登记后，将收集以下样本：(1) 母血 (2) 父血，(3) 从羊水细胞中分离的胎儿 DNA (4) 产后转诊时的新生儿血液。
WES 结果将报告给专门负责该研究的遗传咨询师。
遗传咨询师将联系父母，并就结果是阳性还是阴性提供咨询。
结果也将传达给患者的主要 MFM 提供者或儿科医生，并且主要提供者将适当转介给儿科遗传学专家。
在未发现遗传病的情况下，样本将被储存，随后将进行全基因组测序。
研究类型
观察性的
注册 (估计的)
55
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习联系方式
- 姓名：Huda B Al-Kouatly, MD
- 电话号码：215-955-9200
- 邮箱：Huda.Al-kouatly@jefferson.edu
研究联系人备份
- 姓名：Stephanie M Rice, MS
- 邮箱：stephanie.rice@jefferson.edu
学习地点
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia、Pennsylvania、美国、19107
- 招聘中
- Thomas Jefferson University
-
-
参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
14年 至 53年 (孩子、成人)
接受健康志愿者
不
取样方法
非概率样本
研究人群
患者将从 MFM 医生、儿科医生和新生儿科医生中招募。
描述
以下纳入标准将适用：
- 妊娠早期后随时发现胎儿水肿
- 父母正计划将羊膜穿刺术作为水肿的常规检查。
- 父母双方都可以采集血样
- 如果执行正常 CMA 和正常核型
- 细小病毒 B19、巨细胞病毒、弓形体病和梅毒的阴性检查
- 胎儿母体出血检查阴性是水肿的原因 对于新生儿水肿病例，不需要侵入性产前检测的标准，因为来自水肿婴儿的产后血液样本将是先证者 DNA 的来源。
以下排除标准将适用：
- 芯片异常或核型异常
- 先天性感染引起的积水
- 胎母出血是水肿的一个有记载的病因
- 无法获得父母任何一方的父母 DNA
- 供体卵子或供体精子被用于受孕
- 被诊断患有溶酶体贮积病的胎儿/婴儿
- 孕妇或 16 岁以下婴儿的父亲
- 水肿被诊断为宫内胎儿死亡
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
- 观测模型：队列
- 时间观点：预期
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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胎儿
从羊水样本中获得的DNA
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全外显子组测序 (WES) 通过更高的分辨率提供更详细的信息，识别单个碱基对变化和小的插入和缺失。
WES 对蛋白质编码外显子进行测序，这些外显子占基因组的 1-2%，但占所有已知致病突变的 85% 以上。
全基因组测序 (WGS) 近年来作为一种诊断工具出现，它可以对整个基因组进行测序，并可以检测碱基的插入或缺失、结构变异和内含子单核苷酸变异。
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新生儿
从新生儿血液样本中获得的 DNA
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全外显子组测序 (WES) 通过更高的分辨率提供更详细的信息，识别单个碱基对变化和小的插入和缺失。
WES 对蛋白质编码外显子进行测序，这些外显子占基因组的 1-2%，但占所有已知致病突变的 85% 以上。
全基因组测序 (WGS) 近年来作为一种诊断工具出现，它可以对整个基因组进行测序，并可以检测碱基的插入或缺失、结构变异和内含子单核苷酸变异。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
大体时间 |
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通过执行全外显子组测序 (WES)，确定已知的单基因疾病，这些疾病不会被微阵列检测为非免疫性胎儿水肿的原因
大体时间：5年
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5年
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确定与非免疫性水肿相关的新型遗传病
大体时间：5年
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5年
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次要结果测量
结果测量 |
大体时间 |
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评估WES阴性时全基因组测序（WGS）在胎儿水肿评估中的增量价值
大体时间：5年
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5年
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更好地向父母咨询水肿的病因，特别是如果他们希望再次怀孕
大体时间：5年
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5年
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
调查人员
- 首席研究员：Huda B Al-Kouatly, MD、Thomas Jefferson University
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
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研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2019年1月15日
初级完成 (估计的)
2024年6月30日
研究完成 (估计的)
2024年12月31日
研究注册日期
首次提交
2019年4月9日
首先提交符合 QC 标准的
2019年4月9日
首次发布 (实际的)
2019年4月11日
研究记录更新
最后更新发布 (估计的)
2023年11月22日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2023年11月21日
最后验证
2023年11月1日
更多信息
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