Cette page a été traduite automatiquement et l'exactitude de la traduction n'est pas garantie. Veuillez vous référer au version anglaise pour un texte source.

Développement d'une base de données suisse de surveillance pour l'épidémiologie moléculaire des agents pathogènes hypervirulents et multirésistants

13 mai 2025 mis à jour par: University Hospital, Basel, Switzerland
Les infections hypervirulentes et multirésistantes sont associées à des coûts de soins de santé importants, à une morbidité et une mortalité substantielles. Par conséquent, la reconnaissance rapide des épidémies et des transmissions avec des agents pathogènes hypervirulents et multirésistants est une priorité essentielle pour le contrôle des infections et la santé publique. L'objectif principal est de mettre en place une base de données partagée, reliant les laboratoires de microbiologie humaine et vétérinaire, qui permettrait une -épidémiologie moléculaire temporelle à haute résolution spatio-temporelle des pathogènes bactériens tels que la transmission et la surveillance des épidémies entre différents compartiments incluant l'homme, l'animal et l'environnement en Suisse. L'investigateur vise à analyser les ensembles de données rétrospectives codées déjà collectées de divers agents pathogènes en combinant des données épidémiologiques et des séquences génomiques entières d'agents pathogènes.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

Les infections hypervirulentes et multirésistantes sont associées à des coûts de soins de santé importants, à une morbidité et une mortalité substantielles. Par conséquent, la reconnaissance rapide des épidémies et des transmissions par des agents pathogènes hypervirulents et multirésistants est une priorité essentielle pour le contrôle des infections et la santé publique. Pour les épidémiologistes hospitaliers, les experts en maladies infectieuses et en santé publique et les microbiologistes, l'identification d'une source d'épidémie est une première étape importante pour établir des contre-mesures efficaces. En Suisse, la charge de transmission des agents pathogènes entre l'homme, l'animal et l'environnement est importante. L'objectif principal est de mettre en place une base de données partagée, reliant les laboratoires de microbiologie humaine et vétérinaire, qui permettrait une épidémiologie moléculaire en temps quasi réel avec une résolution spatio-temporelle élevée des pathogènes bactériens tels que la transmission et la surveillance des épidémies entre différents compartiments, y compris les humains, les animaux et l'environnement dans Suisse. L'investigateur vise à analyser les ensembles de données rétrospectives codées déjà collectées de divers agents pathogènes en combinant des données épidémiologiques et des séquences génomiques entières d'agents pathogènes.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

10000

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Sauvegarde des contacts de l'étude

Lieux d'étude

  • Suisse
      • Basel, Suisse, 4031
        • Recrutement
        • University Hospital Basel
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Hans Hirsch, Prof. Dr.
      • Bern, Suisse, 3012
        • Recrutement
        • University of Bern
        • Contact:
          • Vincent Perreten, Prof.
        • Contact:
          • Stephen Leib, Prof.
        • Chercheur principal:
          • Vincent Perreten, Prof.
        • Chercheur principal:
          • Stephen Leib, Prof.
      • Geneva, Suisse, 1205
        • Recrutement
        • University Hospital Geneva
        • Contact:
          • Jacques Schrenzel, Prof.
        • Contact:
          • Laurent Kaiser, Prof.
        • Chercheur principal:
          • Laurent Kaiser, Prof.
        • Chercheur principal:
          • Jacques Schrenzel, Prof.
        • Chercheur principal:
          • Aitana Lebrand, Dr.
      • Lausanne, Suisse, 1011
        • Recrutement
        • University Hospital Lausanne CHUV
        • Contact:
          • Gilbert Greub, Prof.
        • Contact:
          • Dominique Blanc, PD Dr.
        • Chercheur principal:
          • Gilbert Greub, Prof.
        • Chercheur principal:
          • Dominique Blanc, PD Dr.
      • Zurich, Suisse, 8057
        • Recrutement
        • University of Zurich
        • Contact:
          • Michael Huber, Dr.
        • Contact:
          • Roger Stephan, Prof.
        • Chercheur principal:
          • Michael Huber, Dr.
        • Chercheur principal:
          • Roger Stephan, Prof.
        • Chercheur principal:
          • Adrian Egli, Prof.

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Enfant
  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon de probabilité

Population étudiée

• Tous les patients atteints de colonisations ou d'infections par des agents pathogènes bactériens ou viraux, y compris les agents pathogènes énumérés ci-dessous, des centres participants en Suisse.

La description

Critère d'intégration:

  • Tous les patients atteints de colonisations ou d'infections par un agent pathogène bactérien ou viral, pour lesquels les données de séquençage du génome entier et les données épidémiologiques, démographiques et cliniques minimales disponibles
  • Les agents pathogènes inclus dans l'analyse sont : Les bactéries multirésistantes comprennent : Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM), les entérobactéries productrices de carbapénémase et/ou de bêtalactamase à spectre étendu (BLSE) et les bactéries non fermentantes, y compris Pseudomonas aeruginosa et Acinetobacter baumannii, Enterococcus faecium résistant à la vancomycine , et d'autres; les bactéries virulentes comprennent : Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, Campylobacter spp., Salmonella spp., Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes et Streptococcus pneumoniae, et d'autres ; Les virus comprennent : virus de la grippe, virus de la rougeole, entérovirus E68, virus respiratoire syncytial et autres.

Critère d'exclusion:

  • Refuser de signer un consentement général ou toute autre déclaration de refus contre l'utilisation des données à des fins de recherche.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Patients colonisés ou infectés par un agent pathogène
Tous les patients atteints de colonisations ou d'infections par un agent pathogène bactérien ou viral, pour lesquels les données de séquençage du génome entier et les données épidémiologiques, démographiques et cliniques minimales disponibles
Test diagnostique: Analyse du génome bactérien
assemblage du génome ; prédiction du type de séquence (MLST); arborescence MLST du génome de base pour comparer rapidement les souches au sein d'un projet ; arbre de polymorphisme mononucléotidique (SNP) du génome central pour comparer toutes les souches de la plateforme suisse de surveillance des pathogènes (SPSP) appartenant à une même espèce ; arbre SNP du génome entier pour comparer toutes les souches SPSP au sein de la même espèce et ST ;; prédiction des facteurs de résistance et de virulence dans les génomes soumis à des agents pathogènes ; arbres temporels et calcul des taux de transmission, y compris le nombre de reproduction de base ; analyse des données épidémiologiques classiques avec des méthodes statistiques avancées, y compris l'apprentissage automatique.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Identification des clusters de transmission basée sur la similarité génétique.
Délai: Identification unique au départ
Identification des clusters de transmission basée sur la similarité génétique. En mettant l'accent sur le séquençage du génome entier.
Identification unique au départ

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Détection de la résistance génotypique
Délai: Identification unique au départ
Détection de la résistance génotypique (test de sensibilité antibiotique in vitro (AST) basé sur la mesure de la concentration minimale inhibitrice (MIC) ou du diamètre de zone (ZD))
Identification unique au départ

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

University Hospital, Basel, Switzerland

Collaborateurs

Swiss National Science Foundation

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Hans Hirsch, Prof. Dr., Biozentrum, University of Basel

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

30 septembre 2019

Achèvement primaire (Estimé)

31 décembre 2029

Achèvement de l'étude (Estimé)

31 décembre 2029

Dates d'inscription aux études

Première soumission

19 novembre 2019

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

19 novembre 2019

Première publication (Réel)

21 novembre 2019

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

14 mai 2025

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

13 mai 2025

Dernière vérification

1 mai 2025

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Autres numéros d'identification d'étude

  • 2019-01291; qu19Egli5

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

S'abonner