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Sviluppo di una banca dati svizzera di sorveglianza per l'epidemiologia molecolare degli agenti patogeni ipervirulenti e multifarmacoresistenti

13 maggio 2025 aggiornato da: University Hospital, Basel, Switzerland
Le infezioni ipervirulente e multiresistenti sono associate a costi sanitari significativi, morbilità e mortalità sostanziali. Pertanto, il rapido riconoscimento di focolai e trasmissioni con agenti patogeni ipervirulenti e multifarmacoresistenti è una priorità fondamentale per il controllo delle infezioni e la salute pubblica. Epidemiologia molecolare a tempo con elevata risoluzione spaziotemporale di patogeni batterici come la trasmissione e la sorveglianza dei focolai tra diversi comparti tra cui uomo, animali e ambiente in Svizzera. Il ricercatore mira ad analizzare i set di dati retrospettivi codificati già raccolti di vari agenti patogeni combinando dati epidemiologici e intere sequenze di genomi di agenti patogeni.

Panoramica dello studio

Stato

Reclutamento

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

Le infezioni ipervirulente e multiresistenti sono associate a costi sanitari significativi, morbilità e mortalità sostanziali. Pertanto, il rapido riconoscimento di focolai e trasmissioni con agenti patogeni ipervirulenti e resistenti a più farmaci è una priorità fondamentale per il controllo delle infezioni e la salute pubblica. Per epidemiologi ospedalieri, esperti di malattie infettive e sanità pubblica e microbiologi l'identificazione di una fonte di focolaio è un primo passo importante per stabilire contromisure efficaci. In Svizzera l'onere della trasmissione di agenti patogeni tra l'uomo, gli animali e l'ambiente è notevole. L'obiettivo principale è implementare un database condiviso, che colleghi i laboratori di microbiologia umana e veterinaria, che consentirebbe un'epidemiologia molecolare quasi in tempo reale con un'elevata risoluzione spaziotemporale dei patogeni batterici come la trasmissione e la sorveglianza dei focolai tra diversi comparti tra cui gli esseri umani, gli animali e l'ambiente in Svizzera. Il ricercatore mira ad analizzare i set di dati retrospettivi codificati già raccolti di vari agenti patogeni combinando dati epidemiologici e intere sequenze di genomi di agenti patogeni.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Stimato)

10000

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

Luoghi di studio

  • Svizzera
      • Basel, Svizzera, 4031
        • Reclutamento
        • University Hospital Basel
        • Contatto:
        • Investigatore principale:
          • Hans Hirsch, Prof. Dr.
      • Bern, Svizzera, 3012
        • Reclutamento
        • University of Bern
        • Contatto:
          • Vincent Perreten, Prof.
        • Contatto:
          • Stephen Leib, Prof.
        • Investigatore principale:
          • Vincent Perreten, Prof.
        • Investigatore principale:
          • Stephen Leib, Prof.
      • Geneva, Svizzera, 1205
        • Reclutamento
        • University Hospital Geneva
        • Contatto:
          • Jacques Schrenzel, Prof.
        • Contatto:
          • Laurent Kaiser, Prof.
        • Investigatore principale:
          • Laurent Kaiser, Prof.
        • Investigatore principale:
          • Jacques Schrenzel, Prof.
        • Investigatore principale:
          • Aitana Lebrand, Dr.
      • Lausanne, Svizzera, 1011
        • Reclutamento
        • University Hospital Lausanne CHUV
        • Contatto:
          • Gilbert Greub, Prof.
        • Contatto:
          • Dominique Blanc, PD Dr.
        • Investigatore principale:
          • Gilbert Greub, Prof.
        • Investigatore principale:
          • Dominique Blanc, PD Dr.
      • Zurich, Svizzera, 8057
        • Reclutamento
        • University of Zurich
        • Contatto:
          • Michael Huber, Dr.
        • Contatto:
          • Roger Stephan, Prof.
        • Investigatore principale:
          • Michael Huber, Dr.
        • Investigatore principale:
          • Roger Stephan, Prof.
        • Investigatore principale:
          • Adrian Egli, Prof.

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Bambino
  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

No

Metodo di campionamento

Campione di probabilità

Popolazione di studio

• Tutti i pazienti con colonizzazioni o infezioni da agenti patogeni batterici o virali, inclusi gli agenti patogeni elencati di seguito provenienti dai centri partecipanti in Svizzera.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Tutti i pazienti con colonizzazioni o infezioni da un agente patogeno batterico o virale, dove sono disponibili dati sul sequenziamento dell'intero genoma e dati epidemiologici, demografici e clinici minimi
  • Gli agenti patogeni inclusi nell'analisi sono: I batteri multiresistenti includono: Staphylococcus aureus resistente alla meticillina (MRSA), Enterobacteriaceae produttori di carbapenemasi e/o betalattamasi a spettro esteso (ESBL) e batteri non fermentanti tra cui Pseudomonas aeruginosa e Acinetobacter baumannii, Enterococcus faecium resistente alla vancomicina , e altri; batteri virulenti includono: Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, Campylobacter spp., Salmonella spp., Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes e Streptococcus pneumoniae e altri; I virus includono: virus dell'influenza, virus del morbillo, enterovirus E68, virus respiratorio sinciziale e altri.

Criteri di esclusione:

  • Rifiutare di firmare un consenso generale o qualsiasi altra dichiarazione di rifiuto contro l'utilizzo dei dati per scopi di ricerca.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Pazienti con colonizzazione o infezioni da un agente patogeno
Tutti i pazienti con colonizzazioni o infezioni da un agente patogeno batterico o virale, dove sono disponibili dati sul sequenziamento dell'intero genoma e dati epidemiologici, demografici e clinici minimi
Test diagnostico: Analisi del genoma batterico
assemblaggio del genoma; previsione del tipo di sequenza (MLST); core genoma MLST tree per confrontare rapidamente i ceppi all'interno di un progetto; core genome single nucleotide polymorphism (SNP) tree per confrontare tutti i ceppi della Swiss Pathogen Surveillance Platform (SPSP) appartenenti alla stessa specie; intero genoma albero SNP per confrontare tutti i ceppi SPSP all'interno della stessa specie e ST;; predizione di fattori di resistenza e virulenza all'interno di genomi sottoposti a patogeni; alberi temporali e calcolo delle velocità di trasmissione, compreso il numero di riproduzione di base; analisi di dati epidemiologici classici con metodi statistici avanzati incluso il machine learning.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Identificazione di cluster di trasmissione basata sulla somiglianza genetica.
Lasso di tempo: Identificazione una tantum al basale
Identificazione di cluster di trasmissione basata sulla somiglianza genetica. Con particolare attenzione al sequenziamento dell'intero genoma.
Identificazione una tantum al basale

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Rilevazione della resistenza genotipica
Lasso di tempo: Identificazione una tantum al basale
Rilevazione della resistenza genotipica (test di sensibilità agli antibiotici in vitro (AST) basato sulla misurazione della concentrazione minima inibente (MIC) o del diametro della zona (ZD))
Identificazione una tantum al basale

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

University Hospital, Basel, Switzerland

Collaboratori

Swiss National Science Foundation

Investigatori

  • Investigatore principale: Hans Hirsch, Prof. Dr., Biozentrum, University of Basel

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Pubblicazioni generali

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

30 settembre 2019

Completamento primario (Stimato)

31 dicembre 2029

Completamento dello studio (Stimato)

31 dicembre 2029

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

19 novembre 2019

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

19 novembre 2019

Primo Inserito (Effettivo)

21 novembre 2019

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

14 maggio 2025

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

13 maggio 2025

Ultimo verificato

1 maggio 2025

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Altri numeri di identificazione dello studio

  • 2019-01291; qu19Egli5

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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