Desarrollo de una base de datos de vigilancia suiza para la epidemiología molecular de patógenos hipervirulentos y resistentes a múltiples fármacos
13 de mayo de 2025 actualizado por: University Hospital, Basel, Switzerland
Las infecciones hipervirulentas y multirresistentes se asocian con costos significativos de atención médica y una morbilidad y mortalidad considerables.
Por lo tanto, el reconocimiento rápido de brotes y transmisiones con patógenos hipervirulentos y multirresistentes es una prioridad clave para el control de infecciones y la salud pública. El objetivo principal es implementar una base de datos compartida, conectando laboratorios de microbiología humana y veterinaria, lo que permitiría Epidemiología molecular en tiempo real con alta resolución espaciotemporal de patógenos bacterianos, como transmisión y vigilancia de brotes entre diferentes compartimentos, incluidos humanos, animales y el medio ambiente en Suiza.
Investigator tiene como objetivo analizar conjuntos de datos retrospectivos codificados ya recopilados de varios patógenos mediante la combinación de datos epidemiológicos y secuencias genómicas completas de patógenos.
Descripción general del estudio
Estado
Reclutamiento
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
Las infecciones hipervirulentas y multirresistentes se asocian con costos significativos de atención médica y una morbilidad y mortalidad considerables.
Por lo tanto, el reconocimiento rápido de brotes y transmisiones con patógenos hipervirulentos y resistentes a múltiples fármacos es una prioridad clave para el control de infecciones y la salud pública.
Para epidemiólogos de hospitales, expertos en enfermedades infecciosas y salud pública, y microbiólogos, la identificación de la fuente de un brote es un primer paso importante para establecer contramedidas efectivas.
En Suiza, la carga de transmisión de patógenos entre humanos, animales y el medio ambiente es sustancial.
El objetivo principal es implementar una base de datos compartida, que conecte los laboratorios de microbiología humana y veterinaria, lo que permitiría la epidemiología molecular casi en tiempo real con alta resolución espaciotemporal de patógenos bacterianos, como la transmisión y la vigilancia de brotes entre diferentes compartimentos, incluidos humanos, animales y el medio ambiente en Suiza.
Investigator tiene como objetivo analizar conjuntos de datos retrospectivos codificados ya recopilados de varios patógenos mediante la combinación de datos epidemiológicos y secuencias genómicas completas de patógenos.
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Estimado)
10000
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Estudio Contacto
- Nombre: Aitana Lebrand, Dr.
- Correo electrónico: Aitana.Lebrand@sib.swiss
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Hans Hirsch, Prof. Dr.
- Número de teléfono: +41 61 32 86697
- Correo electrónico: hans.hirsch@unibas.ch
Ubicaciones de estudio
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Basel, Suiza, 4031
- Reclutamiento
- University Hospital Basel
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Contacto:
- Hans Hirsch, Prof. Dr.
- Número de teléfono: +41 61 32 86697
- Correo electrónico: hans.hirsch@unibas.ch
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Investigador principal:
- Hans Hirsch, Prof. Dr.
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Bern, Suiza, 3012
- Reclutamiento
- University of Bern
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Contacto:
- Vincent Perreten, Prof.
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Contacto:
- Stephen Leib, Prof.
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Investigador principal:
- Vincent Perreten, Prof.
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Investigador principal:
- Stephen Leib, Prof.
-
Geneva, Suiza, 1205
- Reclutamiento
- University Hospital Geneva
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Contacto:
- Jacques Schrenzel, Prof.
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Contacto:
- Laurent Kaiser, Prof.
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Investigador principal:
- Laurent Kaiser, Prof.
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Investigador principal:
- Jacques Schrenzel, Prof.
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Investigador principal:
- Aitana Lebrand, Dr.
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Lausanne, Suiza, 1011
- Reclutamiento
- University Hospital Lausanne CHUV
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Contacto:
- Gilbert Greub, Prof.
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Contacto:
- Dominique Blanc, PD Dr.
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Investigador principal:
- Gilbert Greub, Prof.
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Investigador principal:
- Dominique Blanc, PD Dr.
-
Zurich, Suiza, 8057
- Reclutamiento
- University of Zurich
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Contacto:
- Michael Huber, Dr.
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Contacto:
- Roger Stephan, Prof.
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Investigador principal:
- Michael Huber, Dr.
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Investigador principal:
- Roger Stephan, Prof.
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Investigador principal:
- Adrian Egli, Prof.
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Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Niño
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
No
Método de muestreo
Muestra de probabilidad
Población de estudio
• Todos los pacientes con colonizaciones o infecciones con patógenos bacterianos o virales, incluidos los patógenos enumerados a continuación de los centros participantes en Suiza.
Descripción
Criterios de inclusión:
- Todos los pacientes con colonizaciones o infecciones con un patógeno bacteriano o viral, donde se disponga de datos de secuenciación del genoma completo y datos mínimos epidemiológicos, demográficos y clínicos.
- Los patógenos incluidos en el análisis son: Las bacterias multirresistentes incluyen: Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (MRSA), enterobacterias productoras de carbapenemasas y/o betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y bacterias no fermentadoras, incluidas Pseudomonas aeruginosa y Acinetobacter baumannii, Enterococcus faecium resistente a la vancomicina , y otros; las bacterias virulentas incluyen: Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, Campylobacter spp., Salmonella spp., Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes y Streptococcus pneumoniae, y otras; Los virus incluyen: virus de la influenza, virus del sarampión, enterovirus E68, virus respiratorio sincitial y otros.
Criterio de exclusión:
- Negarse a firmar un consentimiento general o cualquier otra declaración de rechazo contra el uso de datos con fines de investigación.
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
|---|---|
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Pacientes con colonización o infecciones con un patógeno
Todos los pacientes con colonizaciones o infecciones con un patógeno bacteriano o viral, donde se disponga de datos de secuenciación del genoma completo y datos mínimos epidemiológicos, demográficos y clínicos.
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ensamblaje del genoma; predicción del tipo de secuencia (MLST); árbol MLST del genoma central para comparar rápidamente cepas dentro de un proyecto; árbol de polimorfismo de nucleótido único (SNP) del genoma central para comparar todas las cepas de la plataforma suiza de vigilancia de patógenos (SPSP) que pertenecen a la misma especie; árbol de SNP de genoma completo para comparar todas las cepas de SPSP dentro de la misma especie y ST;; predicción de factores de resistencia y virulencia dentro de los genomas enviados por patógenos; árboles de tiempo y cálculo de tasas de transmisión, incluido el número de reproducción básico; análisis de datos epidemiológicos clásicos con métodos estadísticos avanzados, incluido el aprendizaje automático.
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
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Identificación de clusters de transmisión basados en la similitud genética.
Periodo de tiempo: Identificación única en la línea de base
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Identificación de clusters de transmisión basados en la similitud genética.
Con énfasis en la secuenciación del genoma completo.
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Identificación única en la línea de base
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
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Detección de resistencia genotípica
Periodo de tiempo: Identificación única en la línea de base
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Detección de resistencia genotípica (prueba de susceptibilidad antibiótica in vitro (AST) basada en la medición de la concentración inhibitoria mínima (MIC) o el diámetro de la zona (ZD))
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Identificación única en la línea de base
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Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
Patrocinador
Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Hans Hirsch, Prof. Dr., Biozentrum, University of Basel
Publicaciones y enlaces útiles
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Publicaciones Generales
- Cassini A, Hogberg LD, Plachouras D, Quattrocchi A, Hoxha A, Simonsen GS, Colomb-Cotinat M, Kretzschmar ME, Devleesschauwer B, Cecchini M, Ouakrim DA, Oliveira TC, Struelens MJ, Suetens C, Monnet DL; Burden of AMR Collaborative Group. Attributable deaths and disability-adjusted life-years caused by infections with antibiotic-resistant bacteria in the EU and the European Economic Area in 2015: a population-level modelling analysis. Lancet Infect Dis. 2019 Jan;19(1):56-66. doi: 10.1016/S1473-3099(18)30605-4. Epub 2018 Nov 5.
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- Walker TM, Merker M, Knoblauch AM, Helbling P, Schoch OD, van der Werf MJ, Kranzer K, Fiebig L, Kroger S, Haas W, Hoffmann H, Indra A, Egli A, Cirillo DM, Robert J, Rogers TR, Groenheit R, Mengshoel AT, Mathys V, Haanpera M, Soolingen DV, Niemann S, Bottger EC, Keller PM; MDR-TB Cluster Consortium. A cluster of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis among patients arriving in Europe from the Horn of Africa: a molecular epidemiological study. Lancet Infect Dis. 2018 Apr;18(4):431-440. doi: 10.1016/S1473-3099(18)30004-5. Epub 2018 Jan 8.
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Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
30 de septiembre de 2019
Finalización primaria (Estimado)
31 de diciembre de 2029
Finalización del estudio (Estimado)
31 de diciembre de 2029
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
19 de noviembre de 2019
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
19 de noviembre de 2019
Publicado por primera vez (Actual)
21 de noviembre de 2019
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
14 de mayo de 2025
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
13 de mayo de 2025
Última verificación
1 de mayo de 2025
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Otros números de identificación del estudio
- 2019-01291; qu19Egli5
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
No
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
No
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