Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Opracowanie szwajcarskiej bazy danych nadzoru dla epidemiologii molekularnej hiperwirulentnych i wielolekoopornych patogenów

13 maja 2025 zaktualizowane przez: University Hospital, Basel, Switzerland
Infekcje hiperwirulentne i wielolekooporne wiążą się ze znacznymi kosztami opieki zdrowotnej, znaczną zachorowalnością i śmiertelnością. Dlatego też szybkie rozpoznawanie ognisk i transmisji za pomocą hiperzjadliwego i wielolekoopornego patogenu jest kluczowym priorytetem kontroli zakażeń i zdrowia publicznego. Głównym celem jest wdrożenie wspólnej bazy danych, łączącej laboratoria mikrobiologii ludzkiej i weterynaryjnej, która umożliwiłaby niemal rzeczywiste epidemiologii molekularnej w czasie z wysoką rozdzielczością czasoprzestrzenną patogenów bakteryjnych, takich jak przenoszenie i obserwacja epidemii między różnymi przedziałami, w tym ludźmi, zwierzętami i środowiskiem w Szwajcarii. Badacz ma na celu przeanalizowanie już zebranych zakodowanych retrospektywnych zestawów danych różnych patogenów poprzez połączenie danych epidemiologicznych i całych sekwencji genomu patogenów.

Przegląd badań

Status

Rekrutacyjny

Warunki

Interwencja / Leczenie

Szczegółowy opis

Infekcje hiperwirulentne i wielolekooporne wiążą się ze znacznymi kosztami opieki zdrowotnej, znaczną zachorowalnością i śmiertelnością. Dlatego też szybkie rozpoznawanie ognisk i transmisji za pomocą hiperwirulentnego i wielolekoopornego patogenu jest kluczowym priorytetem kontroli zakażeń i zdrowia publicznego. Dla epidemiologów szpitalnych, ekspertów ds. chorób zakaźnych i zdrowia publicznego oraz mikrobiologów identyfikacja źródła epidemii jest pierwszym ważnym krokiem do ustanowienia skutecznych środków zaradczych. W Szwajcarii ciężar przenoszenia patogenów między ludźmi, zwierzętami i środowiskiem jest znaczny. Głównym celem jest wdrożenie wspólnej bazy danych, łączącej laboratoria mikrobiologii ludzkiej i weterynaryjnej, która umożliwiłaby epidemiologię molekularną w czasie zbliżonym do rzeczywistego z wysoką rozdzielczością czasoprzestrzenną patogenów bakteryjnych, taką jak przenoszenie i obserwacja epidemii między różnymi przedziałami, w tym ludźmi, zwierzętami i środowiskiem w Szwajcaria. Badacz ma na celu przeanalizowanie już zebranych zakodowanych retrospektywnych zestawów danych różnych patogenów poprzez połączenie danych epidemiologicznych i całych sekwencji genomu patogenów.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Szacowany)

10000

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

Kopia zapasowa kontaktu do badania

Lokalizacje studiów

  • Szwajcaria
      • Basel, Szwajcaria, 4031
        • Rekrutacyjny
        • University Hospital Basel
        • Kontakt:
        • Główny śledczy:
          • Hans Hirsch, Prof. Dr.
      • Bern, Szwajcaria, 3012
        • Rekrutacyjny
        • University of Bern
        • Kontakt:
          • Vincent Perreten, Prof.
        • Kontakt:
          • Stephen Leib, Prof.
        • Główny śledczy:
          • Vincent Perreten, Prof.
        • Główny śledczy:
          • Stephen Leib, Prof.
      • Geneva, Szwajcaria, 1205
        • Rekrutacyjny
        • University Hospital Geneva
        • Kontakt:
          • Jacques Schrenzel, Prof.
        • Kontakt:
          • Laurent Kaiser, Prof.
        • Główny śledczy:
          • Laurent Kaiser, Prof.
        • Główny śledczy:
          • Jacques Schrenzel, Prof.
        • Główny śledczy:
          • Aitana Lebrand, Dr.
      • Lausanne, Szwajcaria, 1011
        • Rekrutacyjny
        • University Hospital Lausanne CHUV
        • Kontakt:
          • Gilbert Greub, Prof.
        • Kontakt:
          • Dominique Blanc, PD Dr.
        • Główny śledczy:
          • Gilbert Greub, Prof.
        • Główny śledczy:
          • Dominique Blanc, PD Dr.
      • Zurich, Szwajcaria, 8057
        • Rekrutacyjny
        • University of Zurich
        • Kontakt:
          • Michael Huber, Dr.
        • Kontakt:
          • Roger Stephan, Prof.
        • Główny śledczy:
          • Michael Huber, Dr.
        • Główny śledczy:
          • Roger Stephan, Prof.
        • Główny śledczy:
          • Adrian Egli, Prof.

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

  • Dziecko
  • Dorosły
  • Starszy dorosły

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Metoda próbkowania

Próbka prawdopodobieństwa

Badana populacja

• Wszyscy pacjenci z kolonizacją lub infekcją patogenami bakteryjnymi lub wirusowymi, w tym patogenami wymienionymi poniżej, z uczestniczących ośrodków w Szwajcarii.

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Wszyscy pacjenci z kolonizacją lub zakażeniem patogenem bakteryjnym lub wirusowym, w przypadku gdy dane z sekwencjonowania całego genomu i dostępne minimalne dane epidemiologiczne, demograficzne i kliniczne
  • Patogeny uwzględnione w analizie to: Bakterie wielolekooporne obejmują: metycylinooporny Staphylococcus aureus (MRSA), Enterobacteriaceae wytwarzające karbapenemazy i/lub betalaktamazy o rozszerzonym spektrum (ESBL) oraz bakterie niefermentujące, w tym Pseudomonas aeruginosa i Acinetobacter baumannii, Enterococcus faecium oporny na wankomycynę , i inni; zjadliwe bakterie obejmują: Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, Campylobacter spp., Salmonella spp., Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes i Streptococcus pneumoniae i inne; Wirusy obejmują: wirusy grypy, wirus odry, enterowirus E68, syncytialny wirus oddechowy i inne.

Kryteria wyłączenia:

  • Odmowy podpisania ogólnej zgody lub innego oświadczenia odmownego przeciwko wykorzystywaniu danych do celów badawczych.

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
Pacjenci z kolonizacją lub zakażeniem patogenem
Wszyscy pacjenci z kolonizacją lub zakażeniem patogenem bakteryjnym lub wirusowym, w przypadku gdy dane z sekwencjonowania całego genomu i dostępne minimalne dane epidemiologiczne, demograficzne i kliniczne
Test diagnostyczny: Analiza genomu bakteryjnego
składanie genomu; przewidywanie typu sekwencji (MLST); drzewo rdzenia genomu MLST do szybkiego porównywania szczepów w ramach projektu; drzewo polimorfizmu pojedynczego nukleotydu (SNP) genomu rdzenia w celu porównania wszystkich szczepów Swiss Pathogen Surveillance Platform (SPSP) należących do tego samego gatunku; drzewo SNP całego genomu w celu porównania wszystkich szczepów SPSP w obrębie tego samego gatunku i ST; przewidywanie czynników oporności i wirulencji w genomach poddanych działaniu patogenu; drzewa czasowe i obliczanie szybkości transmisji, w tym podstawowej liczby reprodukcyjnej; analiza klasycznych danych epidemiologicznych za pomocą zaawansowanych metod statystycznych, w tym uczenia maszynowego.

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Identyfikacja klastrów transmisji na podstawie podobieństwa genetycznego.
Ramy czasowe: Jednorazowa identyfikacja na linii bazowej
Identyfikacja klastrów transmisji na podstawie podobieństwa genetycznego. Z naciskiem na sekwencjonowanie całego genomu.
Jednorazowa identyfikacja na linii bazowej

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Wykrywanie oporności genotypowej
Ramy czasowe: Jednorazowa identyfikacja na linii bazowej
Wykrywanie oporności genotypowej (test wrażliwości na antybiotyki (AST) in vitro na podstawie pomiaru minimalnego stężenia hamującego (MIC) lub średnicy strefy (ZD))
Jednorazowa identyfikacja na linii bazowej

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

University Hospital, Basel, Switzerland

Współpracownicy

Swiss National Science Foundation

Śledczy

  • Główny śledczy: Hans Hirsch, Prof. Dr., Biozentrum, University of Basel

Publikacje i pomocne linki

Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.

Publikacje ogólne

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

30 września 2019

Zakończenie podstawowe (Szacowany)

31 grudnia 2029

Ukończenie studiów (Szacowany)

31 grudnia 2029

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

19 listopada 2019

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

19 listopada 2019

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

21 listopada 2019

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

14 maja 2025

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

13 maja 2025

Ostatnia weryfikacja

1 maja 2025

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Słowa kluczowe

Inne numery identyfikacyjne badania

  • 2019-01291; qu19Egli5

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Subskrybuj