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Entwicklung einer Schweizer Überwachungsdatenbank für die molekulare Epidemiologie hypervirulenter und multiresistenter Krankheitserreger

13. Mai 2025 aktualisiert von: University Hospital, Basel, Switzerland
Hypervirulente und multiresistente Infektionen sind mit erheblichen Gesundheitskosten sowie erheblicher Morbidität und Mortalität verbunden. Daher ist die schnelle Erkennung von Ausbrüchen und Übertragungen mit hypervirulenten und multiresistenten Krankheitserregern eine Schlüsselpriorität für die Infektionskontrolle und die öffentliche Gesundheit. Das Hauptziel besteht darin, eine gemeinsame Datenbank zu implementieren, die human- und veterinärmedizinische Mikrobiologielabore miteinander verbindet und nahezu reale Ergebnisse ermöglicht Zeitliche molekulare Epidemiologie mit hoher räumlich-zeitlicher Auflösung bakterieller Krankheitserreger wie Übertragung und Ausbruchsüberwachung zwischen verschiedenen Kompartimenten, darunter Mensch, Tier und Umwelt in der Schweiz. Ziel des Forschers ist es, bereits gesammelte kodierte retrospektive Datensätze verschiedener Krankheitserreger zu analysieren, indem epidemiologische Daten und gesamte Genomsequenzen von Krankheitserregern kombiniert werden.

Studienübersicht

Status

Rekrutierung

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Detaillierte Beschreibung

Hypervirulente und multiresistente Infektionen sind mit erheblichen Gesundheitskosten sowie erheblicher Morbidität und Mortalität verbunden. Daher ist die schnelle Erkennung von Ausbrüchen und Übertragungen mit hypervirulenten und multiresistenten Krankheitserregern eine Schlüsselpriorität für die Infektionskontrolle und die öffentliche Gesundheit. Für Krankenhausepidemiologen, Experten für Infektionskrankheiten und öffentliche Gesundheit sowie Mikrobiologen ist die Identifizierung einer Ausbruchsquelle ein erster wichtiger Schritt, um wirksame Gegenmaßnahmen zu ergreifen. In der Schweiz ist die Belastung durch die Übertragung von Krankheitserregern zwischen Mensch, Tier und Umwelt erheblich. Das Hauptziel besteht darin, eine gemeinsame Datenbank zu implementieren, die human- und veterinärmedizinische Mikrobiologielabore verbindet und eine molekulare Epidemiologie nahezu in Echtzeit mit hoher räumlich-zeitlicher Auflösung bakterieller Krankheitserreger wie Übertragung und Ausbruchsüberwachung zwischen verschiedenen Kompartimenten, einschließlich Mensch, Tier und Umwelt, ermöglichen würde Schweiz. Ziel des Forschers ist es, bereits gesammelte kodierte retrospektive Datensätze verschiedener Krankheitserreger zu analysieren, indem epidemiologische Daten und gesamte Genomsequenzen von Krankheitserregern kombiniert werden.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Geschätzt)

10000

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienkontakt

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Studienorte

  • Schweiz
      • Basel, Schweiz, 4031
        • Rekrutierung
        • University Hospital Basel
        • Kontakt:
        • Hauptermittler:
          • Hans Hirsch, Prof. Dr.
      • Bern, Schweiz, 3012
        • Rekrutierung
        • University of Bern
        • Kontakt:
          • Vincent Perreten, Prof.
        • Kontakt:
          • Stephen Leib, Prof.
        • Hauptermittler:
          • Vincent Perreten, Prof.
        • Hauptermittler:
          • Stephen Leib, Prof.
      • Geneva, Schweiz, 1205
        • Rekrutierung
        • University Hospital Geneva
        • Kontakt:
          • Jacques Schrenzel, Prof.
        • Kontakt:
          • Laurent Kaiser, Prof.
        • Hauptermittler:
          • Laurent Kaiser, Prof.
        • Hauptermittler:
          • Jacques Schrenzel, Prof.
        • Hauptermittler:
          • Aitana Lebrand, Dr.
      • Lausanne, Schweiz, 1011
        • Rekrutierung
        • University Hospital Lausanne CHUV
        • Kontakt:
          • Gilbert Greub, Prof.
        • Kontakt:
          • Dominique Blanc, PD Dr.
        • Hauptermittler:
          • Gilbert Greub, Prof.
        • Hauptermittler:
          • Dominique Blanc, PD Dr.
      • Zurich, Schweiz, 8057
        • Rekrutierung
        • University of Zurich
        • Kontakt:
          • Michael Huber, Dr.
        • Kontakt:
          • Roger Stephan, Prof.
        • Hauptermittler:
          • Michael Huber, Dr.
        • Hauptermittler:
          • Roger Stephan, Prof.
        • Hauptermittler:
          • Adrian Egli, Prof.

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Kind
  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Probenahmeverfahren

Wahrscheinlichkeitsstichprobe

Studienpopulation

• Alle Patienten mit Kolonisationen oder Infektionen mit einem bakteriellen oder viralen Erreger, einschließlich der unten aufgeführten Erreger aus teilnehmenden Zentren in der Schweiz.

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Alle Patienten mit Kolonisationen oder Infektionen mit einem bakteriellen oder viralen Krankheitserreger, bei denen vollständige Genomsequenzierungsdaten und minimale epidemiologische, demografische und klinische Daten vorliegen
  • Zu den in die Analyse einbezogenen Krankheitserregern gehören: Zu den multiresistenten Bakterien gehören: Methicillin-resistenter Staphylococcus aureus (MRSA), Carbapenemase- und/oder Extended Spectrum Betalactamase (ESBL)-produzierende Enterobacteriaceae und nicht fermentierende Bakterien, einschließlich Pseudomonas aeruginosa und Acinetobacter baumannii, Vancomycin-resistenter Enterococcus faecium , und andere; Zu den virulenten Bakterien gehören: Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, Campylobacter spp., Salmonella spp., Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes und Streptococcus pneumoniae und andere; Zu den Viren gehören: Influenzaviren, Masernviren, Enterovirus E68, Respiratory Syncytial Virus und andere.

Ausschlusskriterien:

  • Lehnen Sie die Unterzeichnung einer allgemeinen Einwilligung oder einer anderen Ablehnungserklärung gegen die Verwendung von Daten für Forschungszwecke ab.

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Patienten mit Besiedlung oder Infektionen mit einem Erreger
Alle Patienten mit Kolonisationen oder Infektionen mit einem bakteriellen oder viralen Krankheitserreger, bei denen vollständige Genomsequenzierungsdaten und minimale epidemiologische, demografische und klinische Daten vorliegen
Diagnosetest: Analyse des Bakteriengenoms
Genomassemblierung; Vorhersage des Sequenztyps (MLST); Kerngenom-MLST-Baum zum schnellen Vergleich von Stämmen innerhalb eines Projekts; Kerngenom-Einzelnukleotid-Polymorphismusbaum (SNP-Baum) zum Vergleich aller Stämme der Swiss Pathogen Surveillance Platform (SPSP), die zu derselben Art gehören; SNP-Baum des gesamten Genoms zum Vergleich aller SPSP-Stämme innerhalb derselben Art und ST;; Vorhersage von Resistenz- und Virulenzfaktoren in den von Krankheitserregern übertragenen Genomen; Zeitbäume und Berechnung von Übertragungsraten, einschließlich Basisreproduktionszahl; Analyse klassischer epidemiologischer Daten mit fortschrittlichen statistischen Methoden einschließlich maschinellem Lernen.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Identifizierung von Übertragungsclustern basierend auf genetischer Ähnlichkeit.
Zeitfenster: Einmalige Identifizierung zu Studienbeginn
Identifizierung von Übertragungsclustern basierend auf genetischer Ähnlichkeit. Mit Schwerpunkt auf der Sequenzierung des gesamten Genoms.
Einmalige Identifizierung zu Studienbeginn

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Nachweis genotypischer Resistenz
Zeitfenster: Einmalige Identifizierung zu Studienbeginn
Nachweis genotypischer Resistenzen (In-vitro-Antibiotika-Empfindlichkeitstest (AST) basierend auf der Messung der minimalen Hemmkonzentration (MIC) oder des Zonendurchmessers (ZD))
Einmalige Identifizierung zu Studienbeginn

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

University Hospital, Basel, Switzerland

Mitarbeiter

Swiss National Science Foundation

Ermittler

  • Hauptermittler: Hans Hirsch, Prof. Dr., Biozentrum, University of Basel

Publikationen und hilfreiche Links

Die Bereitstellung dieser Publikationen erfolgt freiwillig durch die für die Eingabe von Informationen über die Studie verantwortliche Person. Diese können sich auf alles beziehen, was mit dem Studium zu tun hat.

Allgemeine Veröffentlichungen

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

30. September 2019

Primärer Abschluss (Geschätzt)

31. Dezember 2029

Studienabschluss (Geschätzt)

31. Dezember 2029

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

19. November 2019

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

19. November 2019

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

21. November 2019

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

14. Mai 2025

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

13. Mai 2025

Zuletzt verifiziert

1. Mai 2025

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Schlüsselwörter

Andere Studien-ID-Nummern

  • 2019-01291; qu19Egli5

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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