Transplantation de microbiote fécal (FMT) chez les patients atteints de SII Mécanisme(s) d'action

Patients Deux cents patients qui remplissent les critères de Rome IV pour le syndrome du côlon irritable (IBS) seront inclus dans l'étude. Tous les sous-types d'IBS doivent être inclus.

Les enquêteurs donneurs vont utiliser le même super-donneur qu'ils ont utilisé dans leur précédente étude randomisée en double aveugle et contrôlée par placebo. Le donneur est un homme caucasien athlétique âgé de 36 ans. Il est non-fumeur et en parfaite santé sans aucun médicament et avec un IMC de 23,5. Il n'est apparenté à aucun des patients de l'essai. Il est né par accouchement vaginal et allaité. Il a été traité 3 fois avec des antibiotiques au cours de sa vie. Il s'entraîne 5 fois par semaine une heure à chaque fois. Il prenait régulièrement des compléments alimentaires riches en protéines, vitamines, fibres et minéraux qui rendaient son alimentation plus riche que la moyenne en ces substances. Il a été sélectionné selon les directives pour les donneurs de FMT. Avant qu'il ne soit accepté comme donneur, le microbiote a été analysé dans un échantillon fécal à l'aide du test GA-map Dysbiosis. L'analyse a révélé un indice de dysbiose (DI) = 1, indiquant une normobiose. De plus, il avait un excès de bactéries appartenant aux Firmicutes. Ses matières fécales seront testées tous les trois mois pendant l'essai.

Protocole

Les patients sont randomisés pour recevoir soit une greffe de 90 g, soit une greffe de 90 g deux fois à 1 semaine d'intervalle dans l'intestin grêle distal, soit une greffe de 90 g dans le coecum du côlon. Les patients doivent remplir 5 5 questionnaires et fournir des échantillons fécaux au départ, 2 semaines, 1 mois et 3 mois après FMT.

Collecte, préparation et administration des matières fécales Les matières fécales du donneur et des patients doivent être collectées et stockées à - 80•. Les matières fécales congelées doivent être décongelées et chaque 30 g est dissous dans 30 ml de solution saline stérile à 0,9 %. Les selles dissoutes administrées aux patients, après une nuit de jeûne, par le canal de travail du gastroduodeno-scope dans le pars du duodénum descendant distal à la papille de Vater ou au coecum par le canal de travail d'un coloscope.

Questionnaires d'analyse

1. Échelle de sévérité des symptômes du SII (IBS-SSS).
2. Échelle des symptômes de Birmingham.
3. Questionnaire IBS-qualité de vie (IBSQo).
4. Forme abrégée de l'indice de dyspepsie de Nepean (SF-NDI).
5. Échelle d'évaluation de la fatigue (FAS).

Analyse du microbiome L'analyse du microbiote intestinal est réalisée à l'aide du test Genetic analysis-mapTM Dysbiosis (Genetic Analysis AS, Oslo, Norvège) en évaluant de manière algorithmique l'abondance et le profil des bactéries fécales (indice de dysbiose, DI) et la déviation potentielle du microbiome par rapport à la normobiose. Le test GA-map est basé sur l'homogénéisation fécale, la rupture mécanique des cellules bactériennes et l'extraction automatisée de l'ADN génomique bactérien total à l'aide de billes magnétiques. DI est basé sur 54 sondes ADN ciblant plus de 300 souches bactériennes en fonction de leur séquence d'ARNr 16S dans sept régions variables (V3-V9). Vingt-six sondes bactériennes sont spécifiques à une espèce, 19 détectent des bactéries au niveau du genre et 9 sondes détectent des bactéries à des niveaux taxonomiques plus élevés. Le marquage de la sonde se fait par extension de nucléotide unique et hybridation à des sondes complémentaires couplées à des billes magnétiques, et détection du signal à l'aide de l'analyseur BioCode 1000A 128-Plex (Applied BioCode, Santa Fe Springs, CA, USA). Un DI supérieur à 2 montre un profil de microbiote différent de celui de la collection de référence normobiotique (DI 1-2 : non dysbiose, DI : modéré, DI 4-5 : dysbiose sévère).