Prédire la gravité et la progression de la maladie dans les cas de syndrome grippal (y compris la COVID-19) (PREDICT-ILI)

Malgré les progrès cliniques et des décennies de recherche, la capacité à prédire de manière fiable l'évolution des maladies virales respiratoires telles que la grippe et les infections à coronavirus reste faible. L'objectif de ce projet est de développer une plateforme d'identification et de développement de tests prédictifs en combinant des données physiologiques et des corrélats de sévérité dans les infections de type grippal afin d'anticiper l'évolution vers une atteinte pulmonaire sévère au cours d'une infection virale respiratoire. Cela permettrait alors une sortie en toute sécurité des patients atteints d'une maladie spontanément résolutive ou une intensification plus rapide du traitement, le cas échéant.

Les infections respiratoires sont parmi les causes les plus importantes de maladies graves dans le monde, les principaux virus respiratoires étant responsables d'une pression écrasante sur les services de santé chaque hiver en raison des augmentations annuelles de l'incidence. Les deux causes virales les plus courantes de maladie pulmonaire grave, la grippe et le virus respiratoire syncytial (VRS), sont responsables d'environ 50 % des hospitalisations chez les enfants et de 22 % chez les adultes, la mortalité étant la plus élevée chez les personnes âgées. À mesure que la population vieillit, ce fardeau de la maladie ne cesse d'augmenter. En outre, le risque continu de nouvelles souches de grippe pandémique émergentes qui surviennent de manière imprévisible est universellement considéré comme l'une des menaces les plus critiques pour la santé mondiale et la stabilité socio-économique. Cela a été démontré par la récente pandémie de COVID-19.

Les facteurs de risque de grippe grave ont été étudiés de manière approfondie dans des cohortes cliniques, l'âge avancé, les comorbidités, l'obésité et la grossesse augmentant tous la probabilité de maladie grave. Cependant, des marqueurs pronostiques précis restent insaisissables et la dynamique de la réponse à une infection virale respiratoire n'a pas été explorée chez les patients naturellement infectés. En outre, la découverte de biomarqueurs a été limitée par l'hétérogénéité de la souche virale et de la dose ; retards dans le moment de la présentation ; et facteurs de confusion au niveau du patient. Pour résoudre ces problèmes, les chercheurs ont mené des infections humaines contrôlées par la grippe et le VRS depuis 2010, afin d'étudier les mécanismes de l'immunopathogenèse avec un accent particulier sur les maladies des voies respiratoires humaines. Des données préliminaires récentes provenant d'une cohorte de volontaires infectés par la souche grippale A(H1N1)2009 ont montré que des changements rapides dans le transcriptome du sang total se produisaient dans les 2 jours suivant l'exposition au virus. Lors de la pandémie de grippe de 2009, des études similaires ont également été menées auprès de patients hospitalisés. Là, l'analyse transcriptomique du sang a montré des signatures antivirales similaires chez des individus moins gravement malades, mais des signatures divergentes associées à de mauvais résultats cliniques.

L'objectif de ce projet est d'identifier et de tester les prédicteurs de la progression de la maladie et de la détérioration clinique chez les patients atteints d'un syndrome grippal, afin de développer de nouvelles méthodes pour déterminer plus précisément la nécessité d'une hospitalisation et d'une intensification du traitement lors d'une infection virale respiratoire. Pour développer et tester davantage ces biomarqueurs dans une cohorte indépendante de patients naturellement infectés, des adultes hospitalisés atteints d'un syndrome grippal seront recrutés dans les 24 heures suivant leur admission et des échantillons de sang et de nez seront prélevés à 3 moments ultérieurs.

Grâce à ces données, des signatures transcriptomiques prédictives seront identifiées. Des échantillons longitudinaux et des données cliniques seront ensuite utilisés pour les tester, les valider et les affiner auprès des populations locales touchées. Ces résultats seront ensuite traduits en nouveaux outils de diagnostic et en une biobanque établie pour une enquête plus approfondie sur la virologie et l'immunopathogénie des infections virales respiratoires graves.