Předvídání závažnosti a progrese onemocnění u onemocnění podobných chřipce (včetně COVID-19) (PREDICT-ILI)

Navzdory klinickému pokroku a desetiletím výzkumu je schopnost spolehlivě předvídat průběh respiračních virových onemocnění, jako je chřipka a koronavirové infekce, stále špatná. Cílem tohoto projektu je vyvinout platformu pro identifikaci a vývoj prediktivních testů kombinací fyziologických dat a korelátů závažnosti u infekcí podobných chřipce tak, aby bylo možné předvídat progresi k těžkému plicnímu postižení během respirační virové infekce. To by pak umožnilo bezpečné propuštění pacientů s nemocí, která sama odeznívá, nebo rychlejší zintenzivnění léčby podle potřeby.

Respirační infekce patří mezi nejvýznamnější příčiny závažných onemocnění na celém světě, přičemž hlavní respirační viry jsou každou zimu odpovědné za obrovský tlak na zdravotnické služby kvůli každoročnímu nárůstu výskytu. Dvě nejčastější virové příčiny závažných plicních onemocnění, chřipka a respirační syncyciální virus (RSV), jsou zodpovědné za ~50 % hospitalizací u dětí a 22 % u dospělých, přičemž mortalita je nejvyšší u starších lidí. Jak populace stárne, tato zátěž nemocí neustále narůstá. Neustálé riziko nově se objevujících pandemických chřipkových kmenů, které vznikají nepředvídatelně, je navíc všeobecně považováno za jednu z nejkritičtějších hrozeb pro globální zdraví a socioekonomickou stabilitu. Prokázala to nedávná pandemie COVID-19.

Rizikové faktory těžké chřipky byly rozsáhle zkoumány v klinických kohortách, přičemž vyšší věk, souběžná onemocnění, obezita a těhotenství zvyšují pravděpodobnost závažného onemocnění. Přesné prognostické markery však zůstávají nepolapitelné a dynamika odpovědi na respirační virovou infekci nebyla u přirozeně infikovaných pacientů prozkoumána. Kromě toho byl objev biomarkerů omezen heterogenitou virového kmene a dávky; zpoždění v načasování prezentace; a zmatky na úrovni pacientů. K řešení těchto problémů vědci od roku 2010 prováděli kontrolované lidské infekce chřipkou a RSV, aby prozkoumali mechanismy imunopatogeneze se zvláštním zaměřením na onemocnění v lidském dýchacím traktu. Nedávné předběžné údaje od kohorty dobrovolníků infikovaných kmenem chřipky A(H1N1)2009 ukázaly, že během 2 dnů po expozici viru došlo k rychlým změnám v transkriptomu plné krve. Během pandemie chřipky v roce 2009 byly podobné studie provedeny také s hospitalizovanými pacienty. Tam transkriptomická analýza krve prokázala podobné antivirové signatury u méně závažně nemocných jedinců, ale odlišné signatury spojené se špatnými klinickými výsledky.

Cílem tohoto projektu je identifikovat a testovat prediktory progrese onemocnění a klinického zhoršení u pacientů s onemocněním podobným chřipce, aby bylo možné vyvinout nové metody pro přesnější určení potřeby hospitalizace a intenzifikaci léčby při respirační virové infekci. K dalšímu vývoji a testování těchto biomarkerů v nezávislé kohortě přirozeně infikovaných pacientů budou do 24 hodin od přijetí přijati hospitalizovaní dospělí s onemocněním podobným chřipce a vzorky z krve a nosu budou odebrány ve 3 následujících časových bodech.

Pomocí těchto dat budou identifikovány prediktivní transkriptomické signatury. Podélné vzorky a klinická data pak budou použity k jejich testování, validaci a zpřesnění v postižených místních populacích. Tyto poznatky budou následně převedeny do nových diagnostických nástrojů a zřízena biobanka pro další výzkum virologie a imunopatogeneze závažných respiračních virových infekcí.