Forutsi alvorlighetsgrad og sykdomsprogresjon ved influensalignende sykdommer (inkludert COVID-19) (PREDICT-ILI)

Til tross for kliniske fremskritt og tiår med forskning, er evnen til pålitelig å forutsi forløpet av respiratoriske virussykdommer som influensa og koronavirusinfeksjoner fortsatt dårlig. Målet med dette prosjektet er å utvikle en plattform for å identifisere og utvikle prediktive tester ved å kombinere fysiologiske data og korrelater av alvorlighetsgrad ved influensalignende infeksjoner slik at progresjon til alvorlig lungepåvirkning kan forutses under luftveisvirusinfeksjon. Dette vil da tillate sikker utskrivning av pasienter med selvbegrensende sykdom eller raskere intensivering av behandlingen etter behov.

Luftveisinfeksjoner er blant de viktigste årsakene til alvorlig sykdom på verdensbasis, med de store luftveisvirusene som er ansvarlige for et overveldende press på helsetjenestene hver vinter på grunn av årlig økning i forekomst. De to vanligste virale årsakene til alvorlig lungesykdom, influensa og respiratorisk syncytialvirus (RSV), er ansvarlige for ~50 % av sykehusinnleggelsene hos barn og 22 % hos voksne, med dødeligheten størst hos eldre mennesker. Etter hvert som befolkningen blir eldre, øker denne sykdomsbyrden stadig. Videre er den kontinuerlige risikoen for nye pandemiske influensastammer som oppstår uforutsigbart universelt ansett som en av de mest kritiske truslene mot global helse og sosioøkonomisk stabilitet. Dette har blitt demonstrert av den nylige COVID-19-pandemien.

Risikofaktorer for alvorlig influensa har blitt undersøkt omfattende i kliniske kohorter, med høyere alder, komorbiditeter, fedme og graviditet som alle øker sannsynligheten for alvorlig sykdom. Nøyaktige prognostiske markører forblir imidlertid unnvikende og dynamikken i responsen på respiratorisk virusinfeksjon har ikke blitt utforsket hos naturlig infiserte pasienter. Videre har biomarkørfunn blitt begrenset av heterogenitet i virusstamme og -dose; forsinkelser i tidspunktet for presentasjonen; og konfoundere på pasientnivå. For å løse disse problemene har etterforskerne utført kontrollerte menneskelige infeksjoner med influensa og RSV siden 2010, for å undersøke mekanismer for immunopatogenese med spesielt fokus på sykdom i luftveiene hos mennesker. Nylige foreløpige data fra en kohort av frivillige infisert med influensa A(H1N1)2009-stammen viste at raske endringer i transkriptomet til fullblod skjedde innen 2 dager etter viruseksponering. Under influensapandemien i 2009 ble det også utført lignende studier med innlagte pasienter. Der viste transkriptomisk analyse av blod lignende antivirale signaturer hos mindre alvorlig syke individer, men divergerende signaturer assosiert med dårlige kliniske utfall.

Målet med dette prosjektet er å identifisere og teste prediktorer for sykdomsprogresjon og klinisk forverring hos pasienter med influensalignende sykdom, for å utvikle nye metoder for mer nøyaktig å bestemme behovet for sykehusinnleggelse og intensivering av behandlingen under luftveisvirusinfeksjon. For å videreutvikle og teste disse biomarkørene i en uavhengig kohort av naturlig infiserte pasienter, vil sykehusinnlagte voksne med influensalignende sykdom rekrutteres innen 24 timer etter innleggelse og prøver tatt fra blod og nese ved 3 påfølgende tidspunkter.

Ved å bruke disse dataene vil prediktive transkriptomiske signaturer bli identifisert. Longitudinelle prøver og kliniske data vil deretter bli brukt til å teste, validere og foredle dem i berørte lokale populasjoner. Disse funnene vil deretter bli oversatt til nye diagnostiske verktøy og en biobank etablert for videre undersøkelse av virologien og immunopatogenesen ved alvorlige luftveisvirusinfeksjoner.