Influenssan kaltaisten sairauksien (mukaan lukien COVID-19) vakavuuden ja taudin etenemisen ennustaminen (PREDICT-ILI)

Kliinisestä edistyksestä ja vuosikymmenien tutkimuksesta huolimatta kyky ennustaa luotettavasti hengitysteiden virustautien, kuten influenssan ja koronavirusinfektioiden, etenemistä, on edelleen heikko. Tämän projektin tavoitteena on kehittää alusta ennustavien testien tunnistamiseen ja kehittämiseen yhdistämällä fysiologisia tietoja ja vaikeusasteen korrelaatteja influenssan kaltaisissa infektioissa siten, että eteneminen vakavaksi keuhkovaurioksi voidaan ennakoida hengitystievirusinfektion aikana. Tämä mahdollistaisi sitten itsestään rajoittuvien potilaiden turvallisen kotiutuksen tai hoidon nopeamman tehostamisen tarpeen mukaan.

Hengitystieinfektiot ovat vakavien sairauksien tärkeimpiä syitä maailmanlaajuisesti, ja suurimmat hengitystievirukset aiheuttavat ylivoimaisia ​​paineita terveydenhuoltopalveluihin joka talvi vuosittaisen ilmaantuvuuden nousun vuoksi. Kaksi yleisintä vakavan keuhkosairauden virussyytä, influenssa ja hengitysteiden synsyyttivirus (RSV), ovat vastuussa noin 50 prosentista lasten sairaalahoidoista ja 22 prosentista aikuisten sairaalahoidoista, ja kuolleisuus on suurin iäkkäillä ihmisillä. Väestön ikääntyessä tämä tautitaakka kasvaa tasaisesti. Lisäksi jatkuvaa riskiä äskettäin ilmaantuvista influenssapandeemisista kannoista, jotka syntyvät odottamattomasti, pidetään yleisesti yhtenä kriittisimmistä uhista maailmanlaajuiselle terveydelle ja sosioekonomiselle vakaudelle. Tämän on osoittanut viimeaikainen COVID-19-pandemia.

Vaikean influenssan riskitekijöitä on tutkittu laajasti kliinisissä kohortteissa, ja vanhempi ikä, rinnakkaissairaudet, lihavuus ja raskaus lisäävät vakavan sairauden todennäköisyyttä. Tarkat prognostiset markkerit ovat kuitenkin edelleen vaikeasti havaittavissa, eikä hengitystieinfektion vasteen dynamiikkaa ole tutkittu luonnollisesti tartunnan saaneilla potilailla. Lisäksi biomarkkerien löytämistä on rajoittanut viruskannan ja annoksen heterogeenisyys; viiveet esityksen ajoituksessa; ja potilastason hämmentäviä. Näiden ongelmien ratkaisemiseksi tutkijat ovat tehneet hallittuja ihmisten influenssa- ja RSV-infektioita vuodesta 2010 lähtien tutkiakseen immunopatogeneesin mekanismeja keskittyen erityisesti ihmisen hengitysteiden sairauksiin. Viimeaikaiset alustavat tiedot influenssa A(H1N1)2009-tartunnan saaneiden vapaaehtoisten kohortista osoittivat, että kokoveren transkriptomissa tapahtui nopeita muutoksia 2 päivän sisällä virukselle altistumisesta. Vuoden 2009 influenssapandemian aikana samanlaisia ​​tutkimuksia tehtiin myös sairaalahoidossa oleville potilaille. Siellä veren transkriptominen analyysi osoitti samanlaisia ​​​​viruksenvastaisia ​​​​merkkejä vähemmän huonovointisilla henkilöillä, mutta erilaisia ​​​​merkkejä, jotka liittyivät huonoihin kliinisiin tuloksiin.

Tämän projektin tavoitteena on tunnistaa ja testata influenssaa muistuttavia sairauksia sairastavien potilaiden sairauden etenemisen ja kliinisen pahenemisen ennustajia, jotta voidaan kehittää uusia menetelmiä sairaalahoidon tarpeen ja hoidon tehostamisen entistä tarkemmin määrittämiseksi hengitystievirusinfektion aikana. Näiden biomarkkereiden edelleen kehittämiseksi ja testaamiseksi itsenäisessä luonnollisesti tartunnan saaneiden potilaiden ryhmässä sairaalahoidossa olevat aikuiset, joilla on influenssan kaltainen sairaus, rekrytoidaan 24 tunnin kuluessa saapumisesta ja näytteet otetaan verestä ja nenästä 3 peräkkäisenä ajankohtana.

Näitä tietoja käyttämällä identifioidaan ennustavat transkriptomiset allekirjoitukset. Pitkittäisiä näytteitä ja kliinisiä tietoja käytetään sitten niiden testaamiseen, validointiin ja jalostukseen sairastuneissa paikallisissa populaatioissa. Nämä löydökset muunnetaan sitten uusiksi diagnoosityökaluiksi ja biopankkiksi perustetaan vakavien hengitystievirusinfektioiden virologian ja immunopatogeneesin lisätutkimuksia varten.