Förutsäga svårighetsgrad och sjukdomsprogression vid influensaliknande sjukdom (inklusive covid-19) (PREDICT-ILI)

Trots kliniska framsteg och årtionden av forskning är förmågan att på ett tillförlitligt sätt förutsäga förloppet av luftvägsvirussjukdomar som influensa och coronavirusinfektioner fortfarande dålig. Syftet med detta projekt är att utveckla en plattform för att identifiera och utveckla prediktiva tester genom att kombinera fysiologiska data och korrelat av svårighetsgrad i influensaliknande infektioner så att progression till allvarlig lungpåverkan kan förutses under luftvägsvirusinfektion. Detta skulle sedan möjliggöra säker utskrivning av patienter med självbegränsande sjukdom eller snabbare intensifiering av behandlingen som är lämpligt.

Luftvägsinfektioner är bland de viktigaste orsakerna till allvarliga sjukdomar i världen, med de stora luftvägsvirusen som ansvarar för det överväldigande trycket på hälso- och sjukvården varje vinter på grund av årliga ökningar i incidensen. De två vanligaste virala orsakerna till allvarlig lungsjukdom, influensa och respiratoriskt syncytialvirus (RSV), är ansvariga för ~50 % av sjukhusinläggningarna hos barn och 22 % hos vuxna, med dödligheten störst hos äldre. När befolkningen åldras ökar denna sjukdomsbörda stadigt. Dessutom anses den ständiga risken för nyuppkomna pandemiska influensastammar som uppstår oförutsägbart allmänt sett vara ett av de mest kritiska hoten mot global hälsa och socioekonomisk stabilitet. Detta har visats av den senaste covid-19-pandemin.

Riskfaktorer för svår influensa har undersökts omfattande i kliniska kohorter, med högre ålder, komorbiditeter, fetma och graviditet som alla ökar sannolikheten för allvarlig sjukdom. Men exakta prognostiska markörer förblir svårfångade och dynamiken i svaret på luftvägsvirusinfektion har inte undersökts hos naturligt infekterade patienter. Dessutom har upptäckten av biomarkörer begränsats av heterogenitet i virusstam och dos; förseningar i tidpunkten för presentationen; och konfunderare på patientnivå. För att ta itu med dessa frågor har utredarna genomfört kontrollerade mänskliga infektioner med influensa och RSV sedan 2010, för att undersöka mekanismer för immunopatogenes med särskilt fokus på sjukdomar i mänskliga luftvägar. Nya preliminära data från en kohort av frivilliga infekterade med influensa A(H1N1)2009-stammen visade att snabba förändringar i transkriptomet av helblod inträffade inom 2 dagar efter virusexponering. Under influensapandemin 2009 gjordes liknande studier även med inlagda patienter. Där visade transkriptomisk analys av blod liknande antivirala signaturer hos mindre allvarligt sjuka individer men divergerande signaturer associerade med dåliga kliniska resultat.

Syftet med detta projekt är att identifiera och testa prediktorer för sjukdomsprogression och klinisk försämring hos patienter med influensaliknande sjukdom, för att utveckla nya metoder för att mer exakt bestämma behovet av sjukhusinläggning och behandlingsintensivering vid luftvägsvirusinfektion. För att vidareutveckla och testa dessa biomarkörer i en oberoende kohort av naturligt infekterade patienter, kommer sjukhusvårdade vuxna med influensaliknande sjukdom att rekryteras inom 24 timmar efter inläggningen och prover tas från blod och näsa vid 3 efterföljande tidpunkter.

Med hjälp av dessa data kommer prediktiva transkriptomiska signaturer att identifieras. Longitudinella prover och kliniska data kommer sedan att användas för att testa, validera och förfina dem i drabbade lokala populationer. Dessa fynd kommer sedan att översättas till nya diagnostiska verktyg och en biobank upprättas för vidare undersökning av virologin och immunopatogenesen av allvarliga luftvägsvirusinfektioner.