Prédire l'avenir : Tuberculose naissante (PreFIT)

Bien que le nombre estimé de personnes infectées par la tuberculose en Afrique diminue depuis le déploiement de la thérapie antirétrovirale il y a dix ans, la tuberculose est toujours la plus élevée au monde. Le diagnostic et le traitement précoces de la maladie tuberculeuse sont essentiels pour réduire la morbidité et la mortalité. Les progrès transformateurs ne seront jamais possibles avec les outils de diagnostic actuels car ils reposent sur la détection de la tuberculose active qui se produit généralement après que la maladie s'est déjà propagée à d'autres. Des technologies de diagnostic permettant de détecter avec précision qui développera une tuberculose active sont en cours de développement. Cependant, leurs performances ne sont pas bien rapportées.

Un meilleur test de prédiction de la tuberculose est nécessaire pour détecter la tuberculose avant la manifestation clinique. Les enquêteurs de PreFIT émettent l'hypothèse que les volontaires avec une combinaison de résultats Xpert HR positifs, de taux élevés de CRP et/ou de faibles taux d'Hb évolueront probablement vers une tuberculose active dans les 12 mois. Ils émettent également l'hypothèse que les personnes atteintes de tuberculose auront tôt des niveaux élevés d'hepcidine, de ferritine et de transferrine.

Les enquêteurs prévoient de demander aux personnes trouvées atteintes de tuberculose à la clinique locale si elles acceptent de participer à l'étude. Les participants, s'ils y consentent, donneront alors des informations sur les personnes (contacts) avec qui ils séjournent ou se rencontrent fréquemment pour participer également à l'étude. Les contacts qui présentent des symptômes de tuberculose seront invités à tousser des expectorations pour être testés pour la tuberculose co-prévalente. S'il s'avère qu'ils ne sont pas atteints de tuberculose, on leur demandera de donner du sang : quelques gouttes d'une piqûre au doigt et environ 50 ml de la veine du bras à conserver et à utiliser pour d'autres tests. Le suivi et l'échantillonnage des contacts inscrits sans tuberculose active co-prévalente auront lieu à six et 12 mois (± 21 jours avant ou après chaque point temporel, une fenêtre totale de six semaines). Les participants répondant aux définitions présumées de tuberculose ou d'expectoration à six (M6) ou 12 mois (M12) de suivi, ou signalant des symptômes à tout moment entre les deux, subiront Xpert Ultra (ou Xpert MTB/RIF si Ultra indisponible) et tests de culture. Toutes les cultures positives subiront un séquençage du génome entier (WGS) pour suivre la transmission des cas index et des cas co-prévalents ou incidents. Une radiographie pulmonaire (CXR) sera effectuée à M12 pour exclure potentiellement une maladie active manquée par les méthodes microbiologiques. Les diagnostics de tuberculose passive (microbiologiques ou empiriques) tout au long de la période de suivi seront saisis.

Pour éviter tout biais d'information diagnostique, les résultats des tests M0 et M6 pour Xpert HR, CRP et hémoglobine seront cachés aux infirmières et médecins de l'étude qui dépisteront les participants de la cohorte pour la tuberculose active pendant le suivi. De même, les techniciens de laboratoire qui testent les échantillons stockés pour l'hepcidine, la transferrine et la ferritine ne sauront pas si l'échantillon provient d'un participant qui a développé une tuberculose active pendant le suivi ou d'un participant de la cohorte qui ne l'a pas fait.

L'étude recrutera 1515 participants à l'essai chacun à l'Université de Stellenbosch en Afrique du Sud, 1515 au Centro de Investigação em Saúde de Manhiça au Mozambique et 1010 à l'Université Makerere en Ouganda. Les participants seront âgés de 12 à 60 ans ; les femmes enceintes, les minorités, les personnes défavorisées sur le plan économique et éducatif, séronégatives et séropositives, rejoindront l'étude. Les contacts présentant une tuberculose active co-prévalente, des pathologies potentielles sur CXR, des taux anormaux d'Hb et de CRP seront référés à la clinique locale pour une enquête selon la norme de soins avec un résumé écrit des résultats de l'étude pertinente. Toutes les informations des participants seront traitées de manière strictement confidentielle et ne seront identifiées que par un code et non par un identifiant personnel.

Les résultats de PreFIT contribueront au développement et à l'adoption d'outils de diagnostic précis, rentables, évolutifs et adaptés au terrain, afin de faciliter l'intensification du traitement préventif en Afrique subsaharienne et au-delà.