Modulation probiotique du microbiote oral (PROROBIOTICS)
Dissection de la modulation probiotique du microbiote oral chez des individus en bonne santé
Cibler le microbiote humain, en particulier ceux du tractus gastro-intestinal, au moyen de prébiotiques, probiotiques, symbiotiques ou antibiotiques a suscité un intérêt pour son potentiel dans la gestion de la santé humaine. Les communautés bactériennes buccales ont été largement étudiées au cours de la dernière décennie à la fois dans des états normaux et pathologiques ; Cependant, peu de données sont disponibles sur la possibilité de modifier la composition du microbiote de manière contrôlée et « non agressive » en utilisant des probiotiques, afin d'améliorer la santé bucco-dentaire.
La salive contient des micro-organismes attachés aux cellules humaines exfoliées et libérés des biofilms oraux ; son microbiote est le plus similaire (proportionnellement) à ceux de la langue dorsale et latérale. De plus, les bactéries appartenant aux genres Porphyromonas, Tannerella et Treponema, qui contiennent des espèces associées à la parodontite, sont systématiquement identifiées dans la salive. Les communautés microbiennes salivaires sont relativement stables et donc potentiellement intéressantes comme indicateur de la santé bucco-dentaire et générale. En effet, il a été suggéré que les interventions visant à améliorer la santé bucco-dentaire devraient cibler le microbiote muqueux (auquel la salive ressemble le plus) en plus des communautés microbiennes dentaires. La salive entière constitue également une alternative au liquide créviculaire gingival lors de l'analyse des analytes présents dans les poches parodontales. Il a été suggéré que la salive reflète un état inflammatoire consensuel de toute la bouche avec une pertinence clinique potentiellement significative.
La souche K12 de Streptococcus salivarius est disponible à l'international comme complément alimentaire, notamment pour l'hygiène bucco-dentaire. Plusieurs études ont examiné l'efficacité de S. salivarius en tant que probiotique dans le contexte des infections pharyngées, de l'halitose, de la formation de plaques et des caries. Notre étude portera sur les effets d'une supplémentation avec ce probiotique oral disponible dans le commerce sur le microbiote résident et les marqueurs inflammatoires afin d'identifier les signatures associées à la résistance/sensibilité à la colonisation par des souches probiotiques.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
OBJECTIFS
Il s'agit d'une étude monocentrique, prospective, croisée, randomisée, en double aveugle dans laquelle tous les participants recevront un placebo et un traitement probiotique actif, dont 15 seront d'abord traités avec un placebo puis recevront des probiotiques. Les 15 autres participants recevront d'abord des probiotiques puis, après une période de sevrage de 3 semaines, le placebo.
L'objectif principal de l'étude est d'évaluer les changements dans les profils du microbiote salivaire et les marqueurs inflammatoires suite au traitement probiotique S. salivarius. Notre objectif secondaire est d'identifier des corrélations entre des taxons microbiens salivaires spécifiques (sous-espèces à des niveaux de phylum) et des marqueurs inflammatoires. Le résultat clinique n'est pas l'objet de cette étude, bien que des informations de base sur la santé bucco-dentaire seront mesurées.
MÉTHODOLOGIE
Le probiotique BIOTICS-O (Burgerstein) qui sera utilisé est un complément alimentaire commercial disponible en vente libre en pharmacie sous forme de plaquettes thermoformées de 30 pastilles contenant 10^9 UFC de S. salivarius K12. Les participants laisseront fondre la pastille après le brossage des dents le soir.
Les pastilles placebo (probiotiques inactivés) auront le même aspect, le même goût et la même odeur que les pastilles de traitement actif, et elles seront administrées de la même manière que les pastilles de traitement actif.
Analyse métagénomique du microbiote :
Des bibliothèques métagénomiques appariées indexées seront préparées à l'aide d'ADN extrait de la salive et séquencées pendant 2x150 cycles sur un instrument Illumina NovaSeq 6000 pour générer 5 à 10 millions de paires de lectures par échantillon. Notre pipeline d'analyse métagénomique standard (HUGE-MAP) sera utilisé ; il comprend : (i) un filtrage de la qualité de lecture ; (ii) élimination des séquences répliquées ; (iii) suppression des paires de lecture qui correspondent à la séquence du génome humain et, (iv) classification des paires de lecture avec CLARK par rapport à la collection de références NCBI et de génomes bactériens, archéens et fongiques représentatifs, ainsi que les derniers génomes RefSeq NCBI de prophages et de virus à ADN familles dont les membres peuvent infecter les humains. Les affectations fonctionnelles, c'est-à-dire le profilage de la présence/absence et de l'abondance des familles et des voies de gènes microbiens, seront effectuées à l'aide du serveur MG-RAST. L'abondance bactérienne sera mesurée par qPCR et/ou par rapport au nombre de lectures obtenues à partir du calibrateur dopé.
Mesures de cytokines :
L'analyse des cytokines salivaires (IL-1β, IL-6, IL-8, IL-10, TNF-alpha, IFN-gamma) sera effectuée à l'aide d'un panel de dépistage Bio-Plex Pro Hu personnalisé à 6 plex (Bio-Rad).
Les prélèvements seront effectués aux semaines 1, 4, 7, 10, 13, 16 et 19.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Phase
- N'est pas applicable
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Geneva, Suisse, 1211
- Geneva University Hospitals (HUG)
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
La description
Critère d'intégration:
- Consentement éclairé documenté par la signature
- Bonne santé bucco-dentaire et générale
Critère d'exclusion:
- Femmes enceintes ou allaitantes
- Intention de devenir enceinte au cours de l'étude
- Maladie systémique
- Inscription précédente dans l'étude en cours
- Lésions buccales sévères cliniquement diagnostiquées
- Utilisation d'antibiotiques et de probiotiques oraux topiques dans les 3 mois précédant l'étude ou pendant l'étude
- Traitements dentaires et utilisation de désinfectants oraux dans les 30 jours précédant l'étude ou pendant l'étude
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Objectif principal: Autre
- Répartition: Randomisé
- Modèle interventionnel: Affectation croisée
- Masquage: Double
Armes et Interventions
Groupe de participants / Bras |
Intervention / Traitement |
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Autre: Placebo-Probiotique
Recevez d'abord un placebo, puis des probiotiques actifs.
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Traitement topique oral avec le probiotique Streptococcus salivarius K12 (BIOTICS-O, Burgerstein) sous forme de pastille, quotidiennement, pendant 3 semaines.
Traitement topique oral avec le placebo [probiotique inactivé Streptococcus salivarius K12 (BIOTICS-O, Burgerstein)] sous forme de pastille, quotidiennement, pendant 3 semaines.
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Autre: Probiotique-Placebo
Recevez d'abord des probiotiques actifs, puis un placebo.
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Traitement topique oral avec le probiotique Streptococcus salivarius K12 (BIOTICS-O, Burgerstein) sous forme de pastille, quotidiennement, pendant 3 semaines.
Traitement topique oral avec le placebo [probiotique inactivé Streptococcus salivarius K12 (BIOTICS-O, Burgerstein)] sous forme de pastille, quotidiennement, pendant 3 semaines.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Modifications des profils taxonomiques globaux des communautés bactériennes salivaires (microbiote) suite à un traitement probiotique
Délai: Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Test PERMANOVA
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Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Changements dans l'abondance relative des taxons bactériens individuels après un traitement aux probiotiques
Délai: Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Test ANCOM
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Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Changements dans l'abondance absolue des taxons bactériens individuels après un traitement aux probiotiques
Délai: Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Test de Wilcoxon
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Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Changements dans l'abondance relative des fonctions des gènes après un traitement aux probiotiques
Délai: Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Test de Wilcoxon
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Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Modifications de la diversité bactérienne (indice de Shannon)
Délai: Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Test de Wilcoxon
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Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Changements dans les niveaux de cytokines salivaires après un traitement aux probiotiques
Délai: Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Test de Wilcoxon
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Sera évalué à la fin d'un cours de trois semaines sans traitement, probiotiques ou placebo
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Corrélations positives et négatives entre le profil taxonomique global de la communauté bactérienne et les niveaux de cytokines salivaires
Délai: Sera évalué aux semaines 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19
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DISTLM
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Sera évalué aux semaines 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19
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Corrélations positives et négatives entre les taxons bactériens salivaires et les niveaux de cytokines salivaires
Délai: Sera évalué aux semaines 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19
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Lancier Rho
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Sera évalué aux semaines 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Estimation)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 320030_197598
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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