Nouvelles technologies pour l'identification des virus respiratoires (ResVir)

Les services du NHS sont toujours sous pression pendant la période hivernale, car la demande de services hospitaliers augmente avec l'arrivée du froid et la propagation accrue des infections respiratoires.

Alors que les hôpitaux regardent désormais au-delà de la pandémie de COVID-19, la nécessité de relever les futurs défis des services hospitaliers est importante. Les changements d'habitudes et les mesures mises en place pour contrôler la propagation du COVID-19 ont affecté la transmission d'autres virus respiratoires. Comprendre les changements dans les occurrences de maladies respiratoires pendant la période hivernale pourrait aider à comprendre les futures pressions hivernales pour les services de santé.

Étant donné que les symptômes d'infection virale et bactérienne peuvent être similaires, les antibiotiques à large spectre sont souvent utilisés comme première ligne de défense, même lorsque la cause de l'infection est inconnue. Les antibiotiques ne sont pas efficaces contre les infections virales et ne fonctionnent que contre les bactéries. Les antibiotiques préviennent des millions de décès chaque année, cependant, des taux de prescription inappropriés et une utilisation excessive ont conduit à une résistance aux antibiotiques qui a créé une urgence sanitaire mondiale chez les superbactéries résistantes à ces traitements. Des tests rapides et sensibles sont nécessaires pour diagnostiquer la cause de l'infection et s'assurer que les patients reçoivent le type de traitement le plus approprié.

LA TECHNOLOGIE L'hôpital travaille en étroite collaboration avec OxDX, qui développe une technologie d'identification rapide des agents pathogènes comprenant un microscope et un ordinateur formé pour reconnaître les motifs fluorescents de différents virus. Les performances de cette technologie informatique dépendent fortement de la qualité des échantillons utilisés pour l'entraîner. Il a le potentiel d'être plus rapide que la technologie de référence actuelle et pourrait être utilisé dans un contexte de contact avec les patients, y compris les cabinets médicaux et les pharmacies.

L'ÉTUDE DE RECHERCHE Il s'agit d'une étude de preuve de concept visant à déterminer si le système OxDx est capable de détecter et de différencier différents virus à partir d'écouvillons nasopharyngés/d'échantillons d'aspiration. Les données collectées serviront à "entraîner" les algorithmes pour pouvoir identifier avec précision les virus respiratoires. La précision avec laquelle les algorithmes estiment l'ensemble de données de test sera surveillée à intervalles réguliers pendant la période de collecte de l'ensemble de données d'apprentissage. Le système OxDx est encore en cours de développement, ce qui signifie qu'il est encore en "apprentissage". Le système doit voir plus d'informations afin qu'il puisse être suffisamment précis pour être utilisé dans la pratique clinique et devrait devenir plus précis dans l'identification de ces virus car il voit de plus en plus d'informations provenant des patients.

Cette étude aura lieu au Portsmouth Hospitals University NHS Trust et vise à recruter 1000 patients. Pour ce faire, nous recruterons à la fois des adultes et des enfants qui se présentent aux urgences ou sont admis au QAH avec une suspicion clinique d'infection virale respiratoire. Tous les participants subiront un prélèvement nasal et/ou de gorge dans le cadre de leur évaluation clinique, et nous demanderons de procéder à un prélèvement nasal supplémentaire aux fins de l'étude. L'échantillonnage de recherche sera combiné avec des échantillons cliniques de routine dans la mesure du possible afin de réduire la fréquence des tests. Nous utiliserons la plupart des informations pour apprendre au système à devenir plus précis dans l'identification des virus respiratoires. Nous garderons les informations restantes séparées et les utiliserons pour tester la précision du système. Toutes les données seront conservées en toute sécurité. Des informations de base seront collectées, notamment l'âge, le sexe, les résultats des tests sanguins effectués pour l'examen clinique, le traitement et les données sur les résultats. Aucun résultat des écouvillons prélevés aux fins de l'étude ne sera mis à la disposition du participant ou de l'équipe clinique et les informations n'auront aucun effet sur les soins aux patients.

PARTAGE DES RÉSULTATS Les résultats de l'étude seront diffusés via des soumissions d'articles aux revues et conférences pertinentes. Une synthèse vulgarisée des résultats sera réalisée en collaboration avec le groupe PHT PRA. L'équipe d'étude explorera avec ce groupe d'autres avenues et formats pour la diffusion des résultats de l'étude afin d'assurer un public aussi large que possible, par exemple par le biais de conférences publiques coproduites, d'articles dans les communications communautaires et les médias sociaux.