Nye teknologier for identifikasjon av luftveisvirus (ResVir)

NHS-tjenester kommer alltid under press over vinterperioden ettersom etterspørselen etter sykehustjenester øker med ankomsten av kaldt vær og økende spredning av luftveisinfeksjoner.

Ettersom sykehusene nå ser utover covid-19-pandemien, er behovet for å møte fremtidige sykehusutfordringer viktig. Endringer i vane og tiltak iverksatt for å kontrollere spredningen av COVID-19 har påvirket overføringen av andre luftveisvirus. Å forstå endringer i forekomster av luftveislignende sykdommer i vinterperioden kan hjelpe til med å forstå fremtidig vinterpress for helsetjenester.

Siden virus- og bakterieinfeksjonssymptomer kan være like, brukes bredspektrede antibiotika ofte som første forsvarslinje selv når årsaken til infeksjonen er ukjent. Antibiotika er ikke effektive mot virusinfeksjoner og virker kun mot bakterier. Antibiotika forhindrer millioner av dødsfall hvert år, men upassende reseptbelagte priser og overforbruk har ført til antibiotikaresistens som har skapt en global helsenødsituasjon for superbugs som er resistente mot disse behandlingene. Det er behov for raske og sensitive tester for å diagnostisere årsaken til infeksjonen og sikre at pasientene får den mest passende typen behandling.

TEKNOLOGIEN Sykehuset samarbeider tett med OxDX, som utvikler en teknologi for rask patogenidentifikasjon som består av mikroskop og en datamaskin som er opplært til å gjenkjenne fluorescerende mønstre fra forskjellige virus. Ytelsen til denne teknologidatamaskinen er svært avhengig av kvaliteten på prøvene som brukes til å trene den. Den har potensial til å være raskere enn dagens gullstandardteknologi og kan brukes i en pasientrettet setting, inkludert fastlegeoperasjoner og apotek.

FORSKNINGSSTUDIEN Dette er en proof of concept-studie for å avgjøre om OxDx-systemet er i stand til å oppdage og skille forskjellige virus fra nasofaryngeale vattpinner/aspiratprøver. Dataene som samles inn vil bli brukt til å «trene» algoritmene til å kunne identifisere luftveisvirus nøyaktig. Nøyaktigheten som algoritmene estimerer testdatasettet med, vil bli overvåket med jevne mellomrom under innsamlingsperioden for treningsdatasett. OxDx-systemet er fortsatt under utvikling, noe som betyr at det fortsatt "lærer". Systemet trenger å se mer informasjon slik at det kan være tilstrekkelig nøyaktig til å brukes i klinisk praksis og bør bli mer nøyaktig i å identifisere disse virusene etter hvert som det ser mer og mer informasjon fra pasienter.

Denne studien vil finne sted ved Portsmouth Hospitals University NHS Trust og har som mål å rekruttere 1000 pasienter. For å gjøre dette vil vi rekruttere både voksne og barn som enten møter til akuttmottaket eller er innlagt på QAH med klinisk mistanke om luftveisvirusinfeksjon. Alle deltakerne vil få tatt en nese- og/eller halsprøve som en del av deres kliniske vurdering, og vi vil be om å ta en ny neseprøve for formålet med studien. Forskningsprøvetaking vil bli kombinert med rutinemessige kliniske prøver der det er mulig for å redusere frekvensen av testing. Vi vil bruke mesteparten av informasjonen til å lære systemet hvordan det kan bli mer nøyaktig når det gjelder å identifisere luftveisvirus. Vi vil holde den gjenværende informasjonen adskilt og bruke den til å teste hvor nøyaktig systemet er. Alle data vil oppbevares sikkert. Grunnleggende informasjon vil bli samlet inn, inkludert alder, kjønn, resultater av blodprøver tatt for klinisk gjennomgang, behandling og utfallsdata. Ingen resultater fra vattpinnene tatt for studiens formål vil være tilgjengelig for verken deltakeren eller det kliniske teamet, og informasjonen vil ikke ha noen effekt på pasientbehandlingen.

DELING AV FUNN Resultatene av studien vil bli formidlet via papirinnleveringer til relevante tidsskrifter og konferanser. En lekmannsoppsummering av resultatene vil bli laget i samarbeid med PHT PRA-gruppen. Studieteamet vil sammen med denne gruppen utforske andre veier og formater for formidling av studiefunnene for å sikre et så bredt publikum som mulig, for eksempel gjennom samproduserte offentlige foredrag, artikler i samfunnskommunikasjon og sosiale medier.