Enquête active sur les contacts étroits de la tuberculose par détection assistée par ordinateur et Stool Xpert MTB/RIF parmi les personnes vivant en Éthiopie (CADOOL)

Bien qu'il s'agisse d'une maladie évitable et traitable, la tuberculose infecte environ 25 % de la population mondiale, provoquant environ 1,4 million de décès chez les personnes séronégatives (intervalle d'incertitude à 95 % : 1,3-1,5 million) et 187 000 décès (IC à 95 % : 158 000-218 000) parmi les personnes vivant avec le VIH. À l'échelle mondiale, on estime que 10,6 millions de personnes sont tombées malades de la tuberculose seulement en 2021, en augmentation par rapport aux 10,1 millions de cas estimés pour 2020, inversant ainsi une tendance à la baisse de longue durée. La tuberculose est une maladie de la pauvreté, puisque 87 % de tous les cas incidents de tuberculose ont été enregistrés dans les 30 pays à forte prévalence, principalement des pays à faible revenu des régions OMS d'Asie du Sud-Est et d'Afrique. À cet égard, la relation entre le fardeau de la tuberculose et les indicateurs de sous-développement couramment utilisés est bien établie. Les déterminants largement reconnus de la tuberculose comprennent le produit intérieur brut (PIB) et la prévalence de la sous-alimentation, cette dernière étant à elle seule responsable d'environ 2 millions de nouveaux cas de tuberculose en 2021. Comme indiqué par l'Organisation mondiale de la santé, la conséquence immédiate de la pandémie de COVID-19 a été une forte baisse du nombre de cas de tuberculose nouvellement signalés et une augmentation estimée des cas incidents de tuberculose résistante à la rifampicine, tous des indicateurs qui représentent un inconvénient important dans la poursuite des jalons de la fin de la tuberculose en 2025. Ces lacunes dans le diagnostic de la tuberculose comprennent à la fois les personnes diagnostiquées mais non signalées aux autorités locales de santé publique et les personnes non diagnostiquées et donc non prises en charge.

Pour le diagnostic de la tuberculose active, la technique de référence reste la recherche de preuves microbiologiques d'infection. Cela se fait classiquement par microscopie de frottis d'expectoration et culture liquide avec test de sensibilité aux médicaments. La culture est l'étalon-or pour le diagnostic, mais son utilisation est cependant entravée par le fait que les résultats ne sont disponibles qu'après 10 à 21 jours et n'aident donc que peu ou pas à la prise de décision clinique. Depuis son approbation par les lignes directrices de l'OMS en 2010, Xpert MTB/RIF (Cepheid, CA, États-Unis), un test moléculaire capable de détecter l'ADN mycobactérien et les polymorphismes génétiques associés à la résistance à la rifampicine, est entré dans le bilan diagnostique à la fois pour les hautes et les basses pays à revenu. Une nouvelle version du test a été approuvée par l'OMS en 2021, Xpert MTB/RIF Ultra, avec une sensibilité proche de celle enregistrée pour les tests de culture, mais avec l'avantage, comme son prédécesseur, de nécessiter moins de ressources et de fournir des résultats plus rapides. Parallèlement aux tests microbiologiques, la détection d'anomalies radiologiques par radiographie pulmonaire a récemment attiré beaucoup d'attention et est maintenant recommandée comme test de dépistage standard. Une description plus détaillée des performances diagnostiques de la radiographie pulmonaire et de la radiographie pulmonaire numérique à détection assistée par ordinateur est donnée dans le paragraphe suivant de cette introduction.

Ces dernières années, la détection assistée par ordinateur (CAO) est un logiciel basé sur l'intelligence artificielle qui a été développé dans le but d'offrir une interprétation automatisée des images CXR numériques. En termes généraux, les programmes CAD produisent un score numérique qui interprète les altérations CXR afin de quantifier la probabilité de TB. Lorsque la précision du diagnostic est évaluée par rapport à une tuberculose confirmée bactériologiquement, la sensibilité du logiciel CAD varie de 90 % à 92 %, et la spécificité varie de 23 % à 66 %, répondant ainsi à la sensibilité minimale requise par l'OMS pour un test de dépistage. Ces performances diagnostiques ont été confirmées par plusieurs études prospectives menées dans des pays à revenu faible et intermédiaire (PRFI), des revues systématiques et une méta-analyse au niveau du patient, conduisant ainsi à l'approbation des technologies CAD par les directives consolidées actuelles de l'OMS sur la tuberculose pour le dépistage. de personnes âgées de 15 ans ou plus appartenant à certaines populations à haut risque. Parmi les progiciels de CAO disponibles dans le commerce, la plate-forme CAD4TB version 6 (Delft Imaging Systems, Pays-Bas), développée à l'aide de technologies d'apprentissage en profondeur - un type de technologie d'apprentissage automatique basée sur des réseaux de neurones artificiels - libère des résultats en quelques secondes et a été conçue pour fonctionner sur les patients à partir de 4 ans. Dans une étude récente menée, par rapport à une norme de référence microbiologique Xpert, CAD4TB v7 s'est avéré à la fois très efficace et rentable dans les environnements à charge élevée, étant capable de traiter 132 images par jour pour un coût inférieur à 6 USD par personne. Même si la technologie est validée pour une utilisation chez les individus âgés de 4 ans ou plus, très peu de données existent sur l'utilité clinique de cette technologie chez les enfants. Ces dernières années, l'attention a été attirée par Xpert MTB/RIF sur des échantillons de selles, car les mycobactéries - contenant des crachats peuvent être avalés et ensuite être disponibles pour des tests moléculaires. De la même manière que Xpert sur des échantillons d'expectorations, Xpert dans les selles est capable de détecter à la fois la présence d'ADN mycobactérien et les mutations associées à la résistance à la rifampicine. L'utilisation de Xpert MTB/RIF sur des échantillons de selles a été introduite dans les directives de l'OMS de 2020 en tant que test de diagnostic initial possible pour les enfants présentant des signes et des symptômes de tuberculose pulmonaire. Cependant, cette recommandation est basée sur une faible certitude des données probantes. En raison du manque de preuves disponibles, aucune recommandation n'a été émise à ce jour concernant l'utilisation de Xpert sur des échantillons de selles dans la population adulte.

L'Éthiopie figure sur la liste des 30 pays les plus touchés à la fois par la tuberculose et le VIH/la tuberculose, sortant, dans le dernier rapport mondial sur la tuberculose, de la liste des pays les plus touchés par la tuberculose multirésistante ou résistante à la rifampicine (MDR-RRTB ). L'incidence annuelle de la tuberculose est de 132 cas pour 100 000 personnes (IC à 95 % 92-178), avec un taux de létalité de 15 % et la plupart des cas attribuables à la sous-alimentation. L'incidence de la maladie et la mortalité, tant chez les personnes séropositives que chez les personnes non infectées par le VIH, diminuent, atteignant presque le jalon de la fin de la tuberculose, soit une réduction de 35 % des décès dus à la tuberculose par rapport à 2015. Cependant, étant donné que la perturbation des services de lutte contre la tuberculose liée à la pandémie a eu un impact sur le nombre de cas de tuberculose nouvellement diagnostiqués, son influence sur la mortalité et la charge globale de morbidité n'est probablement pas encore visible.

Comme dans la plupart des pays à faibles ressources et à forte prévalence, la recherche des contacts à l'initiative du prestataire est rarement effectuée en Éthiopie, bien que la recherche des contacts et l'évaluation de toutes les personnes qui ont été en contact avec un cas actif de tuberculose soient recommandées par les dernières directives nationales. . L'Organisation mondiale de la santé a récemment mis à jour ses directives de dépistage, en mettant l'accent sur l'importance du dépistage actif, initié par le prestataire, des populations à risque, en particulier les ménages des patients tuberculeux index . Les données épidémiologiques sur la tuberculose active parmi les contacts familiaux sont limitées mais, lorsqu'elles sont déclarées, les taux de prévalence sont élevés . De plus, une méta-analyse menée par Gamtesa et al. ont constaté que le comportement de recherche de soins de santé en Éthiopie est faible, même chez les patients présentant des signes et des symptômes de tuberculose.

Le dépistage à l'initiative du prestataire de certaines populations à haut risque est une stratégie clé dans la lutte pour l'éradication de la tuberculose. Selon l'OMS, cette approche devrait impliquer l'identification systématique des personnes susceptibles d'être atteintes de tuberculose au moyen de tests, d'examens ou d'autres procédures pouvant être appliquées rapidement. Dans ce contexte, les données sur l'impact clinique de l'utilisation des technologies de CAO en Éthiopie font défaut. De plus, des données sur les performances diagnostiques, respectivement, du logiciel de CAO et du Xpert MTB/RIF des selles dans la population pédiatrique et la population adulte sont nécessaires.

L'étude sera menée à l'hôpital catholique St. Luke, Wolisso, en Éthiopie.

L'hôpital catholique St. Luke est l'hôpital de référence dans la zone sud-ouest de Shoa, région d'Oromia, entre Addis-Abeba et Jimma, couvrant une distance de 400 km. L'hôpital catholique St. Luke dessert une population d'une zone de chalandise d'environ 1,4 million de personnes. À ce jour, la capacité en lits de l'hôpital est de 208, tandis que les visites moyennes dans les services ambulatoires sont de 350 patients par jour .

Pour l'année 2021, à l'hôpital St Luke, 207 patients ont reçu un diagnostic de tuberculose pulmonaire. Parmi ceux-ci, 164 patients ont été traités en hospitalisation et 43 en ambulatoire. Parmi ceux-ci, 5 ont montré une résistance à la rifampicine. Ces cas de MDR ont été référés aux Centres d'Initiation Thérapeutique pour un traitement de deuxième intention. Parmi les patients traités à la clinique OPD, 30 ont été suivis à la clinique antituberculeuse de l'hôpital.

Le dépistage systématique de la tuberculose à l'hôpital catholique St. Luke est basé sur le parcours initié par le patient avec une évaluation des signes et des symptômes évocateurs de la tuberculose. Les cas possibles de tuberculose sont identifiés lors d'une visite clinique qui peut inclure une évaluation par radiographie pulmonaire. Lorsqu'elles sont réalisées, les images radiographiques du thorax sont évaluées par des cliniciens de service en format numérique.