Infection à Clostridioides Difficile : cohorte prospective analysant l'évolution clinique et l'élimination bactérienne (DECLIC)

Clostridioides difficile (anciennement Clostridium) est une bactérie présente sous forme de spores (forme de résistance) dans l'environnement auquel les patients peuvent être exposés. Cette bactérie appartenait autrefois au genre Clostridium, mais l'analyse de son ARN ribosomal 16S en 2016 a permis de la distinguer. Une fois ingérée, la spore peut germer sous forme végétative (la forme active de la bactérie), prenant l’apparence d’un bacille Gram positif qui va coloniser le microbiote digestif. Cette étape préliminaire de colonisation digestive par les bactéries est facilitée par certains facteurs, notamment les sondages nasogastriques, les antiacides, etc. Les antibiotiques, quant à eux, perturbent les bactéries du microbiote digestif (dysbiose), facilitant ainsi l'implantation de C. difficile. Certaines souches (dites toxigènes) vont produire les principaux facteurs de virulence : les toxines A (TcdA) et B (TcdB) ± une troisième toxine (toxine binaire ou CDT), et ainsi provoquer les principaux signes cliniques d'infection digestive, notamment chez les patients présentant facteurs de risque d’infection à C. difficile (cancer évolutif, immunodépression, etc.).

L'infection à Clostridioides difficile (ICD) se caractérise par des présentations cliniques variables, allant d'une simple diarrhée aqueuse sans colite, souvent résolutive spontanément, à des formes sévères avec des complications telles qu'une colite pseudomembraneuse, une perforation intestinale ou un choc septique, de très mauvais pronostic.

La prise en charge de ce type d'ICD repose principalement sur l'administration orale d'antibiotiques anti-clostridium difficile tels que la fidaxomicine (FDX) ou la vancomycine (VAN) pendant 10 jours, comme le recommandent les directives européennes ESCMID, britanniques et américaines IDSA. Le métronidazole oral n'est recommandé qu'en l'absence de disponibilité des deux premières molécules (usage communautaire). Malgré ce traitement, l’une des principales caractéristiques de l’ICD est un taux de récidive élevé, pouvant atteindre 25 % des cas. Avec FDX, les taux de récidive semblent plus faibles, d’autant plus que son schéma d’administration est optimisé. Néanmoins, son coût élevé constitue un frein à son utilisation plus large.

Compte tenu du coût élevé pour la collectivité du traitement des récidives, et de la qualité de vie réduite des patients souffrant de ces récidives, parfois multiples et très invalidantes, réduire la survenue des récidives constitue un enjeu majeur. Une meilleure compréhension des facteurs conduisant à la récidive est donc une condition préalable à l’optimisation des stratégies de prévention et de traitement des ICD.

L’étude de l’immunité de la muqueuse colique (visant à quantifier les IgA dans les selles) pourrait également contribuer à une meilleure compréhension de l’évolution des patients.

Toutes ces problématiques entourant l'ICD et sa prise en charge justifient la mise en place d'une cohorte prospective pour le suivi longitudinal des patients infectés, permettant d'étudier la clairance digestive de la bactérie en fonction de différents facteurs, notamment le microbiote digestif et la réponse immunitaire muqueuse. .