Séquençage génomique pour l'évaluation des anomalies structurelles fœtales

Au cours des dernières années, les prestataires de l'UCSF du Centre de traitement fœtal (FTC) et du Centre de diagnostic prénatal (PDC) ont mené des études de recherche sur le séquençage génomique pour les cas prénatals d'anomalies structurelles fœtales et de complications de grossesse. Cette étude cherche à s’appuyer sur les travaux préliminaires de notre équipe de l’UCSF.

Les enquêteurs étudieront :

A. L'efficacité du séquençage comme outil de diagnostic de la cause génétique sous-jacente chez les fœtus présentant des anomalies structurelles B. La présentation prénatale des maladies génétiques et la façon dont les variantes génétiques peuvent être associées à des phénotypes fœtaux spécifiques C. Comment l'identification d'un diagnostic génétique peut aider les prestataires à prédire pronostic, conseiller les patientes et fournir une prise en charge prénatale et postnatale ciblée du fœtus/nourrisson D. Comment les patients et les familles comprennent et bénéficient de l'identification d'un diagnostic génétique sous-jacent dans une grossesse présentant des anomalies structurelles fœtales

Objectifs spécifiques :

A. Démontrer l'efficacité du séquençage comme outil de diagnostic de la cause génétique sous-jacente chez les fœtus présentant des anomalies structurelles B. Définir la présentation prénatale des maladies génétiques et comment les variantes génétiques peuvent être associées à des phénotypes fœtaux spécifiques C. Déterminer comment l'identification d'un diagnostic génétique peut aider les prestataires à prédire le pronostic, conseiller les patientes et fournir une prise en charge prénatale et postnatale ciblée du fœtus/du nourrisson D. Identifier comment les patients et les familles comprennent et bénéficient de l'identification d'un diagnostic génétique sous-jacent dans une grossesse présentant des anomalies structurelles fœtales

Cette étude suit une conception de cohorte prospective observationnelle. Les patients présentant des anomalies structurelles fœtales se voient systématiquement proposer des tests de diagnostic avec prélèvement de villosités choriales ou amniocentèse. Les patients chez qui de tels tests n'expliquent pas le phénotype fœtal, ou chez qui une maladie génétique est fortement suggérée sur la base du phénotype ou d'un schéma d'anomalies récurrentes, se verront proposer un séquençage de l'exome (ES) et/ou un séquençage du génome. Les patientes qui refusent le test de diagnostic prénatal mais qui présentent une anomalie identifiée avant la naissance peuvent se voir proposer la possibilité de tester le sang du cordon ombilical lors de l'accouchement ou le placenta ou d'autres produits de conception après une mortinatalité ou une interruption de grossesse. Des échantillons de sang ou de salive seront prélevés sur les deux parents, lorsque cela est possible, pour permettre l'option du trio ES/GS ou pour le suivi du séquençage Sanger sur ces échantillons déterminant l'héritage de toute variante fœtale potentiellement significative identifiée. Il sera demandé aux patients d'accepter ou de refuser l'analyse des résultats secondaires, comme recommandé par l'American College of Medical Genetics and Genomics. Le séquençage de l'exome et du génome sera effectué dans le laboratoire clinique de médecine génomique de l'UCSF, et les patients recevront les résultats via le laboratoire clinique certifié CLIA. laboratoire. Les patients seront pris en charge selon les protocoles cliniques habituels. Des données cliniques seront collectées concernant les résultats de la grossesse, de l'accouchement, de la période néonatale et de la petite enfance.