Genomisk sekvensering for evaluering av fosterets strukturelle anomalier

I løpet av de siste årene har UCSF-leverandører i Fetal Treatment Center (FTC) og Prenatal Diagnosis Center (PDC) utført genomiske sekvenseringsstudier for prenatale tilfeller av føtale strukturelle anomalier og graviditetskomplikasjoner. Denne studien søker å bygge på foreløpig arbeid fra teamet vårt ved UCSF.

Etterforskerne vil studere:

A. Effektiviteten av sekvensering som et verktøy for å diagnostisere den underliggende genetiske årsaken hos fostre med strukturelle anomalier B. Prenatal presentasjon av genetiske sykdommer og hvordan genetiske varianter kan assosieres med spesifikke føtale fenotyper C. Hvordan identifisering av en genetisk diagnose kan hjelpe forsørgere å forutsi prognose, gi råd til pasienter og gi fokusert prenatal og postnatal behandling av fosteret/spedbarnet D. Hvordan pasienter og familier forstår og drar nytte av å identifisere en underliggende genetisk diagnose i en graviditet med fosterstrukturelle anomalier

Spesifikke mål:

A. Demonstrere effektiviteten av sekvensering som et verktøy for å diagnostisere den underliggende genetiske årsaken hos fostre med strukturelle anomalier B. Definere prenatal presentasjon av genetiske sykdommer og hvordan genetiske varianter kan assosieres med spesifikke føtale fenotyper C. Bestem hvordan identifisering av en genetisk diagnose kan hjelper leverandørene med å forutsi prognose, veileder pasienter og gir fokusert prenatal og postnatal behandling av fosteret/spedbarnet D. Identifiser hvordan pasienter og familier forstår og drar nytte av å identifisere en underliggende genetisk diagnose i en graviditet med fosterstrukturelle anomalier

Denne studien følger et observasjonsprospektivt kohortdesign. Pasienter med føtale strukturelle anomalier tilbys rutinemessig diagnostisk testing med chorionic villus prøvetaking eller fostervannsprøve. Pasienter der slik testing ikke forklarer fosterets fenotype, eller hvor en genetisk sykdom er sterkt anbefalt basert på fenotypen eller et mønster av tilbakevendende anomalier, vil bli tilbudt eksomsekvensering (ES) og/eller genomsekvensering. Pasienter som avslår prenatal diagnostisk testing, men som har en prenatalt identifisert anomali, kan bli tilbudt muligheten til å teste på navlestrengsblod ved fødsel eller på morkaken eller andre unnfangelsesprodukter etter dødfødsel eller svangerskapsavbrudd. Blod- eller spyttprøver vil bli samlet inn på begge foreldrene, når det er mulig, for å tillate muligheten for trio ES/GS eller for oppfølging av Sanger-sekvensering på disse prøvene som bestemmer arv av eventuelle potensielt signifikante fostervarianter som er identifisert. Pasienter vil bli bedt om å akseptere eller avslå analyse for sekundære funn, som anbefalt av American College of Medical Genetics and Genomics. Eksome- og genomsekvensering vil bli utført i UCSFs kliniske Genomic Medicine Laboratory, og pasienter vil motta resultater gjennom CLIA-sertifisert klinisk laboratorium. Pasienter vil bli behandlet i henhold til vanlige kliniske protokoller. Kliniske data vil bli samlet inn angående graviditet, fødsel, neonatale og tidlige barndomsutfall.