Sekwencjonowanie genomu w celu oceny anomalii strukturalnych płodu

W ciągu ostatnich kilku lat podmioty świadczące usługi UCSF w Centrum Leczenia Płodu (FTC) i Centrum Diagnostyki Prenatalnej (PDC) prowadziły badania w zakresie sekwencjonowania genomu pod kątem prenatalnych przypadków anomalii strukturalnych płodu i powikłań ciąży. Niniejsze badanie opiera się na wstępnych pracach naszego zespołu z UCSF.

Badacze będą badać:

A. Skuteczność sekwencjonowania jako narzędzia do diagnozowania podstawowej przyczyny genetycznej u płodów z anomaliami strukturalnymi B. Prenatalny obraz chorób genetycznych i sposób, w jaki warianty genetyczne mogą być powiązane z określonymi fenotypami płodu C. W jaki sposób identyfikacja diagnozy genetycznej może pomóc lekarzom w przewidywaniu prognozowanie, udzielanie porad pacjentom oraz zapewnianie ukierunkowanego postępowania z płodem/dzieckiem w okresie przedporodowym i poporodowym D. Jak pacjenci i rodziny rozumieją i czerpią korzyści z identyfikacji podstawowej diagnozy genetycznej w przypadku ciąży z anomaliami strukturalnymi płodu

Cele szczegółowe:

A. Wykazanie skuteczności sekwencjonowania jako narzędzia do diagnozowania podstawowej przyczyny genetycznej u płodów z anomaliami strukturalnymi B. Zdefiniowanie prenatalnego obrazu chorób genetycznych oraz tego, w jaki sposób warianty genetyczne mogą być powiązane z określonymi fenotypami płodu C. Określenie, w jaki sposób identyfikacja diagnozy genetycznej może pomagać świadczeniodawcom w przewidywaniu rokowania, udzielać porad pacjentom i zapewniać ukierunkowane leczenie płodu/dziecka w okresie przedporodowym i poporodowym D. Określić, w jaki sposób pacjenci i rodziny rozumieją i czerpią korzyści z identyfikacji podstawowej diagnozy genetycznej w przypadku ciąży z anomaliami strukturalnymi płodu

W niniejszym badaniu zastosowano obserwacyjny prospektywny projekt kohortowy. Pacjentkom z wadami strukturalnymi płodu rutynowo proponuje się badania diagnostyczne polegające na pobraniu próbek kosmówki kosmówki lub amniopunkcji. Pacjentkom, u których takie badania nie wyjaśniają fenotypu płodu lub u których na podstawie fenotypu lub wzoru nawracających anomalii zdecydowanie sugeruje się chorobę genetyczną, zostanie zaproponowane sekwencjonowanie egzomu (ES) i/lub sekwencjonowanie genomu. Pacjentkom, które nie wyrażą zgody na badania prenatalne, ale u których stwierdzono prenatalną wadę, można zaproponować opcję badania krwi pępowinowej podczas porodu lub łożyska lub innych produktów poczęcia po urodzeniu martwego dziecka lub przerwaniu ciąży. Jeśli to możliwe, od obojga rodziców zostaną pobrane próbki krwi lub śliny, aby umożliwić wykonanie trio ES/GS lub wykonanie sekwencjonowania Sangera na tych próbkach w celu określenia dziedziczenia wszelkich zidentyfikowanych potencjalnie istotnych wariantów płodu. Pacjenci zostaną poproszeni o zaakceptowanie lub odrzucenie analizy pod kątem wtórnych ustaleń, zgodnie z zaleceniami American College of Medical Genetics and Genomics. Sekwencjonowanie egzomu i genomu zostanie przeprowadzone w klinicznym Laboratorium Medycyny Genomicznej UCSF, a pacjenci otrzymają wyniki za pośrednictwem laboratorium klinicznego posiadającego certyfikat CLIA laboratorium. Pacjenci będą leczeni zgodnie ze zwykłymi protokołami klinicznymi. Gromadzone będą dane kliniczne dotyczące przebiegu ciąży, porodu, noworodków i wczesnego dzieciństwa.