Genomische sequencing voor evaluatie van structurele afwijkingen van de foetus

De afgelopen jaren hebben UCSF-aanbieders in het Foetale Behandelingscentrum (FTC) en het Prenatale Diagnosecentrum (PDC) genomische sequencing-onderzoeksstudies uitgevoerd voor prenatale gevallen van foetale structurele afwijkingen en zwangerschapscomplicaties. Deze studie probeert voort te bouwen op voorbereidend werk van ons team bij UCSF.

De onderzoekers zullen bestuderen:

A. De effectiviteit van sequencing als hulpmiddel voor het diagnosticeren van de onderliggende genetische oorzaak bij foetussen met structurele afwijkingen B. De prenatale presentatie van genetische ziekten en hoe genetische varianten geassocieerd kunnen worden met specifieke foetale fenotypes C. Hoe het identificeren van een genetische diagnose zorgverleners kan helpen voorspellen prognose, patiënten adviseren en gerichte prenatale en postnatale behandeling van de foetus/zuigeling bieden D. Hoe patiënten en families het identificeren van een onderliggende genetische diagnose bij een zwangerschap met structurele afwijkingen van de foetus begrijpen en er profijt van hebben

Specifieke doelstellingen:

A. De effectiviteit van sequencing aantonen als hulpmiddel voor het diagnosticeren van de onderliggende genetische oorzaak bij foetussen met structurele afwijkingen B. De prenatale presentatie van genetische ziekten definiëren en hoe genetische varianten geassocieerd kunnen worden met specifieke foetale fenotypes C. Bepalen hoe het identificeren van een genetische diagnose kan zorgverleners helpen de prognose te voorspellen, patiënten te adviseren en gerichte prenatale en postnatale behandeling van de foetus/zuigeling te bieden. D. Identificeren hoe patiënten en families het identificeren van een onderliggende genetische diagnose begrijpen en er baat bij hebben bij een zwangerschap met structurele foetale afwijkingen

Deze studie volgt een observationeel prospectief cohortontwerp. Patiënten met foetale structurele afwijkingen krijgen routinematig diagnostische tests aangeboden met vlokkentest of vruchtwaterpunctie. Patiënten bij wie dergelijke testen het foetale fenotype niet verklaren, of bij wie een genetische ziekte sterk wordt gesuggereerd op basis van het fenotype of een patroon van terugkerende afwijkingen, zullen exome sequencing (ES) en/of genoomsequencing worden aangeboden. Patiënten die prenatale diagnostische tests weigeren, maar die een prenataal vastgestelde afwijking hebben, kunnen de mogelijkheid worden geboden om bij de bevalling te testen op navelstrengbloed of op de placenta of andere bevruchtingsproducten na een doodgeboorte of zwangerschapsafbreking. Indien mogelijk zullen bij beide ouders bloed- of speekselmonsters worden afgenomen om de optie van trio-ES/GS of voor follow-up Sanger-sequencing op deze monsters mogelijk te maken, om de overerving van eventuele geïdentificeerde potentieel significante foetale varianten te bepalen. Patiënten zal worden gevraagd de analyse van secundaire bevindingen te accepteren of af te wijzen, zoals aanbevolen door het American College of Medical Genetics and Genomics. Exoom- en genoomsequencing zal worden uitgevoerd in het UCSF Clinical Genomic Medicine Laboratory, en patiënten zullen resultaten ontvangen via het CLIA-gecertificeerde klinische laboratorium. laboratorium. Patiënten zullen worden behandeld volgens de gebruikelijke klinische protocollen. Er zullen klinische gegevens worden verzameld over de zwangerschap, bevalling, neonatale uitkomsten en de uitkomsten in de vroege kinderjaren.