Genomisk sekvensering til evaluering af føtale strukturelle anomalier

I løbet af de sidste mange år har UCSF-udbydere i Fetal Treatment Center (FTC) og Prenatal Diagnosis Center (PDC) udført genomiske sekventeringsundersøgelser for prænatale tilfælde af føtale strukturelle anomalier og graviditetskomplikationer. Denne undersøgelse søger at bygge videre på det foreløbige arbejde fra vores team på UCSF.

Efterforskerne vil studere:

A. Effektiviteten af ​​sekventering som et værktøj til at diagnosticere den underliggende genetiske årsag hos fostre med strukturelle anomalier B. Den prænatale præsentation af genetiske sygdomme, og hvordan genetiske varianter kan være forbundet med specifikke føtale fænotyper C. Hvordan identifikation af en genetisk diagnose kan hjælpe udbydere med at forudsige prognose, rådgive patienter og give fokuseret prænatal og postnatal behandling af fosteret/spædbarnet D. Hvordan patienter og familier forstår og drager fordel af at identificere en underliggende genetisk diagnose i en graviditet med føtale strukturelle anomalier

Specifikke mål:

A. Demonstrere effektiviteten af ​​sekventering som et værktøj til diagnosticering af den underliggende genetiske årsag hos fostre med strukturelle anomalier B. Definer den prænatale præsentation af genetiske sygdomme, og hvordan genetiske varianter kan associeres med specifikke føtale fænotyper C. Bestem, hvordan identifikation af en genetisk diagnose kan hjælper udbydere med at forudsige prognose, vejleder patienter og yder fokuseret prænatal og postnatal behandling af fosteret/spædbarnet D. Identificer, hvordan patienter og familier forstår og drager fordel af at identificere en underliggende genetisk diagnose i en graviditet med føtale strukturelle anomalier

Denne undersøgelse følger et observationelt prospektivt kohortedesign. Patienter med føtale strukturelle anomalier tilbydes rutinemæssigt diagnostisk testning med chorionic villus prøvetagning eller fostervandsprøve. Patienter, hvor en sådan testning ikke forklarer den føtale fænotype, eller hos hvem en genetisk sygdom er stærkt foreslået baseret på fænotypen eller et mønster af tilbagevendende anomalier, vil blive tilbudt exome-sekventering (ES) og/eller genom-sekventering. Patienter, der afslår prænatal diagnostisk test, men som har en prænatalt identificeret anomali, kan tilbydes mulighed for at teste på navlestrengsblod ved fødslen eller på moderkagen eller andre produkter fra undfangelsen efter en dødfødsel eller graviditetsafbrydelse. Blod- eller spytprøver vil blive indsamlet på begge forældre, når det er muligt, for at give mulighed for trio ES/GS eller for opfølgende Sanger-sekventering på disse prøver, der bestemmer nedarvning af eventuelle potentielt signifikante føtale varianter, der er identificeret. Patienterne vil blive bedt om at acceptere eller afslå analyse for sekundære fund, som anbefalet af American College of Medical Genetics and Genomics. Exome- og genomsekventering vil blive udført i UCSF's clinical Genomic Medicine Laboratory, og patienter vil modtage resultater gennem det CLIA-certificerede kliniske laboratorium. Patienterne vil blive behandlet i henhold til de sædvanlige kliniske protokoller. Der vil blive indsamlet kliniske data vedrørende graviditet, fødsel, neonatale og tidlige barndomsresultater.