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Un essai clinique adaptatif du dépistage néonatal BeginNGS de centaines de maladies génétiques par séquençage du génome (BeginNGS)

5 mars 2024 mis à jour par: Stephen F. Kingsmore, Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute

L’objectif de cet essai clinique est de tester une nouvelle méthode de dépistage néonatal par séquençage du génome entier, appelée BeginNGS. Les parents seront invités à donner leur consentement éclairé pour inscrire leurs nouveau-nés dans des contextes prénatals, postnatals et ambulatoires. Les principales questions auxquelles cette étude vise à répondre sont :

Quelle est l’utilité de BeginNGS par rapport au dépistage néonatal d’État ? Quelle est l’acceptabilité et la faisabilité du BeginNGS par rapport au dépistage néonatal d’État ? Quelle est la rentabilité de BeginNGS par rapport au dépistage néonatal public ?

Les nouveau-nés inscrits recevront un échantillon de sang et recevront le test BeginNGS. Les nouveau-nés auront également subi le test de dépistage néonatal de l’État.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

Chaque année, 98 % des nouveau-nés américains reçoivent un dépistage (NBS) de taches de sang séché (DBS) pour au moins 35 troubles génétiques recommandés par le panel de dépistage uniforme recommandé (RUSP) pour le diagnostic et le traitement dès/avant l'apparition des symptômes. Environ 6 600 nourrissons véritablement positifs sont identifiés chaque année. Le NBS est bien accepté et son utilité clinique a été prouvée. Entre 2010 et 2022, cependant, alors que de nombreuses nouvelles interventions thérapeutiques pour les maladies génétiques infantiles ont montré une utilité clinique et/ou ont été approuvées par la Food and Drug Administration (FDA), seuls 6 troubles ont été ajoutés au RUSP. En conséquence, environ 700 maladies génétiques infantiles disposent de traitements efficaces mais ne sont pas encore dépistées par le NBS, et les enfants affectés connaissent des retards de diagnostic et de traitement, ainsi que de mauvais résultats. Pour résoudre ce problème, les enquêteurs développent BeginNGS - NBS par séquençage du génome (GS) de DBS pour, à terme, environ 700 maladies génétiques infantiles graves avec des interventions thérapeutiques efficaces. BeginNGS est adaptatif : des troubles génétiques sont ajoutés (ou supprimés) à mesure que des preuves apparaissent selon lesquelles un traitement précoce améliore (ou n'améliore pas) les résultats. La version 1 de BeginNGS (v1, 388 troubles génétiques) présentait une bonne sensibilité (88,8 %) et un taux de faux positifs (0,27 %) dans une étude rétrospective portant sur 458 000 sujets. Un essai clinique prospectif exploratoire comparant BeginNGS v2 (avec 409 troubles) et le séquençage diagnostique rapide du génome (RDGS) a identifié des résultats à signaler chez 24 (34 %) des 71 nouveau-nés gravement malades qui n'étaient pas suspectés d'avoir une maladie génétique. Seuls 2 de ces troubles ont été détectés par le NBS standard. Les enquêteurs proposent un essai clinique adaptatif multicentrique en groupe unique pour comparer l'utilité, l'acceptabilité, la faisabilité et la rentabilité de BeginNGS (intervention expérimentale) avec le NBS standard (contrôle) chez un minimum de 10 000 nouveau-nés (âgés de <28 jours, maximum de 100 000 ). L'objectif principal de l'essai est de générer des preuves pour soutenir une mise en œuvre à grande échelle de BeginNGS. Une conception adaptative a été choisie plutôt qu'une conception traditionnelle et fixe pour permettre d'accumuler des résultats afin de rendre l'essai plus efficace, informatif et éthique par l'ajout ou la suppression de troubles BeginNGS et de variantes génétiques, l'enrichissement de la population (pour les groupes minoritaires raciaux, ethniques et ancestraux). ), et réestimation de la taille de l'échantillon. La conception adaptative facilitera également la méta-analyse avec d’autres essais cliniques du NBS-by-GS, offrant ainsi une plus grande puissance pour tester l’utilité dans les maladies génétiques ultra-rares. NBS-by-GS a le potentiel de transformer la manière dont les maladies génétiques infantiles sont diagnostiquées et les traitements lancés. Les données préliminaires suggèrent que l'adoption nationale de BeginNGS pour toutes les naissances a le potentiel d'améliorer les résultats de plus de 50 000 enfants américains par an.

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Estimé)

10000

Phase

  • N'est pas applicable

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

  • Nom: Lauren Olsen, MSN
  • Numéro de téléphone: 228456 858-576-1700
  • E-mail: lolsen1@rchsd.org

Lieux d'étude

  • États-Unis
    • California
      • San Diego, California, États-Unis, 92123
        • Recrutement
        • Rady Children's Hospital San Diego
        • Contact:
          • Lauren Olsen, MSN
          • Numéro de téléphone: 228456 858-576-1700
          • E-mail: lolsen1@rchsd.org

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Enfant

Accepte les volontaires sains

Oui

La description

Critère d'intégration:

  1. Nouveau-nés (<28 jours) sur les sites d'inscription.
  2. Les parents doivent avoir identifié un fournisseur (ou un groupe) de soins primaires.

Critère d'exclusion:

  1. Nouveau-nés dont la mère a moins de 18 ans.
  2. Nouveau-nés pupilles de l’État.
  3. Nouveau-nés dont le parent/tuteur légal est incapable de donner son consentement.
  4. Parents ayant une adresse personnelle en dehors des États-Unis ou de la juridiction des sites d'inscription.
  5. Nouveau-nés ou fœtus malades et chez lesquels l'inscription ou l'échantillonnage devraient interférer avec la prestation de soins de santé à l'accouchement. Par exemple, les fœtus ou les nouveau-nés qui sont susceptibles de nécessiter un transfert vers un niveau de soins supérieur, comme vers une USIN de niveau IV lors de l'accouchement.
  6. Nouveau-nés qui sont envisagés pour une séquence génomique de diagnostic rapide ou d'autres tests génétiques de diagnostic.
  7. Nouveau-nés dont on ne s’attend pas à ce qu’ils survivent à la période néonatale.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: Dépistage
  • Répartition: N / A
  • Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
  • Masquage: Aucun (étiquette ouverte)

Armes et Interventions

Groupe de participants / Bras
Intervention / Traitement
Expérimental: Inscrits
Les nourrissons inscrits recevront le test BeginNGS en plus du dépistage néonatal de l'État.
Génétique: Début du test NGS
Séquençage génomique qui détecte plus de 400 maladies génétiques.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Comparaison de l'utilité clinique de BeginNGS et de la norme de soins (état NBS), définie par la proportion de participants susceptibles de bénéficier (susceptibles d'avoir un résultat amélioré) d'une intervention thérapeutique indiquée
Délai: 5 années
La proportion de personnes inscrites susceptibles de bénéficier (probablement d'avoir un résultat amélioré) d'une intervention thérapeutique indiquée (selon un système de gestion clinique électronique, Genome-to-Treatment, GTRx)
5 années

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Résultat secondaire d’utilité 1
Délai: 5 années
La proportion de BeginNGS et d'état NBS de DBS qui sont positifs (taux positif)
5 années
Résultat secondaire d’utilité 2
Délai: 5 années
La proportion de résultats positifs de BeginNGS et de NBS d’État ou de DBS qui sont confirmés (taux de vrais positifs et valeur prédictive positive)
5 années
Résultat secondaire d’utilité 3
Délai: 5 années
La proportion de BeginNGS et d'état NBS de DBS qui sont vraiment positifs et diagnostiqués pendant la petite enfance.
5 années
Résultat secondaire d’utilité 4
Délai: 5 années
La proportion de BeginNGS et d'état NBS de DBS qui sont vraiment positifs et diagnostiqués à la fin de l'étude.
5 années
Résultat secondaire d’utilité 5
Délai: 5 années
La proportion de BeginNGS et d'état NBS ou DBS qui sont positifs et chez lesquels une intervention thérapeutique indiquée a été commencée à la fin de l'étude.
5 années
Résultat secondaire d’utilité 6
Délai: 5 années
La proportion de BeginNGS et d'état NBS ou DBS qui sont positifs et chez lesquels l'évolution de la maladie a changé en raison d'une intervention thérapeutique à la fin de l'étude.
5 années
Résultat secondaire d’utilité 7
Délai: 5 années
Analyse en sous-groupe de l'utilité clinique (telle que définie par le critère de jugement principal) par race (noir, blanc, asiatique), origine ethnique (hispanique, non hispanique), ascendance génétique et groupe de troubles
5 années
Résultat secondaire d’utilité 8
Délai: 5 années
Analyse en sous-groupe du taux positif (mesure de résultat d'utilité secondaire 1) par race, origine ethnique, ascendance génétique et groupe de troubles.
5 années
Résultat secondaire d’utilité 9
Délai: 5 années
Analyse de sous-groupe du taux de vrais positifs (mesure de résultat d'utilité secondaire 2) par race, origine ethnique, ascendance génétique et groupe de troubles.
5 années
Résultat secondaire d’utilité 10
Délai: 5 années
Analyse de sous-groupe de la proportion de BeginNGS et d'état NBS de DBS qui sont vraiment positifs et diagnostiqués pendant la petite enfance par race, origine ethnique, ascendance génétique et groupe de troubles.
5 années
Résultat d’acceptabilité 1
Délai: 5 années
Proportion de parents approchés qui acceptent d'inscrire leur nouveau-né (Figure 1c①). Il s'agit d'un « résultat clé » (tel que défini par CONSORT PRO31).
5 années
Résultat d’acceptabilité 2
Délai: 5 années
Questionnaires destinés aux médecins et aux parents (Figure 1c⑤) concernant les perceptions des avantages et des inconvénients de BeginNGS par les parents et les pédiatres de soins primaires.
5 années
Résultat d’acceptabilité 3
Délai: 5 années
Analyse en sous-groupe du taux d'inscription (proportion de parents approchés qui acceptent d'inscrire leur nouveau-né ; figure 1c①) par race, origine ethnique, ascendance génétique et méthode d'inscription.
5 années
Résultat d’acceptabilité 4
Délai: 5 années
Analyse de sous-groupes de questionnaires parentaux (concernant les perceptions des avantages et des inconvénients de BeginNGS) par race, origine ethnique et ascendance génétique.
5 années
Faisabilité (capacité de l’étude à être entreprise telle que conçue) résultat 1
Délai: 5 années
Il est temps de renvoyer un résultat pour BeginNGS et l’état NBS.
5 années
Faisabilité (capacité de l’étude à être entreprise comme prévu) résultat 2
Délai: 5 années
Il est temps de revenir d’un résultat véritablement positif confirmé de BeginNGS et de l’État NBS.
5 années
Faisabilité (capacité de l’étude à être entreprise comme prévu) résultat 3
Délai: 5 années
Proportion d'inscrits avec des résultats positifs qui subissent des tests de confirmation par BeginNGS et l'État NBS.
5 années
Faisabilité (capacité de l’étude à être entreprise comme prévu) résultat 4
Délai: 5 années
Délai jusqu'au diagnostic (délai jusqu'à ce qu'une caractéristique clinique du trouble soit identifiée) pour BeginNGS et l'état NBS.
5 années
Faisabilité (capacité de l’étude à être entreprise comme prévu) résultat 5
Délai: 5 années
Proportion d'inscrits perdus de vue à l'âge d'un an.
5 années
Résultat 1 en termes de rentabilité
Délai: 5 années
Rapport coût-efficacité moyen (ACER, coût moyen pour prévenir un décès de nourrisson ou un événement indésirable).
5 années
Résultat 2 en termes de rentabilité
Délai: 5 années
Rapport coût-efficacité différentiel (ICER, variation moyenne du coût associé à la prévention d'un décès de nourrisson ou d'un événement indésirable).
5 années
Résultat 3 en termes de rentabilité
Délai: 5 années
Analyse en sous-groupe du rapport coût-efficacité moyen (ACER, coût moyen pour prévenir un décès de nourrisson ou un événement indésirable) par groupe de troubles (par exemple troubles métaboliques, troubles d'immunodéficience, troubles épileptiques, troubles endocriniens, troubles liés à une carence en vitamines et en cofacteurs, troubles hématologiques, troubles musculaires) ).
5 années
Résultat 4 en termes de rentabilité
Délai: 5 années
Analyse en sous-groupe du rapport coût-efficacité différentiel (ICER, variation moyenne du coût associé à la prévention d'un décès de nourrisson ou d'un événement indésirable) par groupe de troubles (par exemple troubles métaboliques, troubles d'immunodéficience, troubles épileptiques, troubles endocriniens, troubles liés à une carence en vitamines et en cofacteurs, troubles hématologiques) troubles musculaires).
5 années
Résultat de précision 1
Délai: 5 années
Taux de vrais positifs (vrai positif/vrai positif + faux négatif, rappel, sensibilité) de BeginNGS par comparaison avec l'état NBS de DBS (tous les inscrits).
5 années
Résultat de précision 2
Délai: 5 années
Taux de vrais positifs de BeginNGS par rapport à d'autres tests génétiques (chez les nourrissons qui subissent ensuite des tests de diagnostic pour une maladie génétique suspectée).
5 années
Résultat secondaire d’utilité 11
Délai: 5 années
Nombre nécessaire à dépister pour prévenir un décès de nourrisson ou un événement indésirable.
5 années
Résultat de faisabilité 6
Délai: 5 années
Incidence des variantes et des haplotypes associés à des maladies génétiques individuelles chez les nouveau-nés.
5 années
Résultat de faisabilité 7
Délai: 5 années
Détermination catégorique du mode de transmission génétique (par exemple dominant, récessif) de maladies génétiques individuelles chez les nouveau-nés (lorsque cela n'a pas été établi sans équivoque).
5 années
Résultat secondaire d’utilité 12
Délai: 5 années
Analyse catégorique en sous-groupe de l'efficacité des interventions thérapeutiques individuelles chez les nourrissons.
5 années

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Stephen Kingsmore, MD DSc, Rady Children's Institute for Genomic Medicine
  • Chercheur principal: Rebecca Reimers, MD MPH, Rady Children's Institute for Genomic Medicine

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

29 février 2024

Achèvement primaire (Estimé)

1 février 2029

Achèvement de l'étude (Estimé)

1 février 2029

Dates d'inscription aux études

Première soumission

22 février 2024

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

5 mars 2024

Première publication (Réel)

12 mars 2024

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

12 mars 2024

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

5 mars 2024

Dernière vérification

1 mars 2024

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • 20235517

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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