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Uno studio clinico adattivo sullo screening neonatale BeginNGS per centinaia di malattie genetiche mediante sequenziamento del genoma (BeginNGS)

5 marzo 2024 aggiornato da: Stephen F. Kingsmore, Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute

L'obiettivo di questo studio clinico è testare un nuovo metodo per lo screening neonatale utilizzando il sequenziamento dell'intero genoma, chiamato BeginNGS. I genitori verranno contattati per fornire il consenso informato per arruolare i loro neonati in ambito prenatale, postnatale e ambulatoriale. Le principali domande a cui questo studio si propone di rispondere sono:

Qual è l’utilità di BeginNGS rispetto allo screening neonatale statale? Qual è l’accettabilità e la fattibilità di BeginNGS rispetto allo screening neonatale statale? Qual è il rapporto costo-efficacia di BeginNGS rispetto allo screening neonatale statale?

Ai neonati iscritti verrà prelevato un campione di sangue e verrà effettuato il test BeginNGS. I neonati saranno sottoposti anche al test di screening neonatale statale.

Panoramica dello studio

Stato

Reclutamento

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

Ogni anno il 98% dei neonati statunitensi viene sottoposto allo screening (NBS) delle macchie di sangue essiccato (DBS) per almeno 35 malattie genetiche RUSP (Recommended Uniform Screening Panel) per la diagnosi e il trattamento prima della comparsa dei sintomi. Ogni anno vengono identificati circa 6.600 neonati veri positivi. La NBS è ben accetta e ha dimostrato un’utilità clinica. Tra il 2010 e il 2022, tuttavia, mentre molti nuovi interventi terapeutici per le malattie genetiche infantili hanno mostrato utilità clinica e/o sono stati approvati dalla Food and Drug Administration (FDA), solo 6 disturbi sono stati aggiunti al RUSP. Di conseguenza, circa 700 malattie genetiche infantili hanno trattamenti efficaci ma non sono ancora state esaminate dalla NBS, e i bambini colpiti sperimentano diagnosi e trattamenti ritardati e scarsi risultati. Per risolvere questo problema i ricercatori stanno sviluppando BeginNGS - NBS mediante sequenziamento del genoma (GS) di DBS per, in definitiva, circa 700 malattie genetiche infantili gravi con interventi terapeutici efficaci. BeginNGS è adattivo: i disturbi genetici vengono aggiunti (o rimossi) quando emergono prove che il trattamento precoce migliora (o non migliora) i risultati. La versione 1 di BeginNGS (v1, 388 malattie genetiche) ha avuto una buona sensibilità (88,8%) e un tasso di falsi positivi (0,27%) in uno studio retrospettivo su 458.000 soggetti. Uno studio clinico prospettico esplorativo che ha confrontato BeginNGS v2 (con 409 disturbi) e il sequenziamento diagnostico rapido del genoma (RDGS) ha identificato risultati segnalabili in 24 (34%) di 71 neonati con malattie acute che non erano sospettati di avere una malattia genetica. Solo 2 di questi disturbi sono stati rilevati dalla NBS standard. I ricercatori propongono uno studio clinico adattivo, multicentrico, a gruppo singolo per confrontare l'utilità, l'accettabilità, la fattibilità e il rapporto costo-efficacia di BeginNGS (intervento sperimentale) con NBS standard (controllo) in un minimo di 10.000 neonati (di età <28 giorni, massimo di 100.000 ). L'obiettivo principale dello studio è generare prove a sostegno di un'ampia implementazione di BeginNGS. È stato scelto un disegno adattivo piuttosto che un disegno tradizionale e fisso per consentire l'accumulo di risultati e rendere lo studio più efficiente, informativo ed etico mediante l'aggiunta o la rimozione di disturbi BeginNGS e varianti genetiche, arricchimento della popolazione (per gruppi minoritari razziali, etnici e ancestrali ) e nuova stima della dimensione del campione. La progettazione adattiva faciliterà inoltre la meta-analisi con altri studi clinici di NBS-by-GS, fornendo maggiore potenza per testare l’utilità nelle malattie genetiche ultra rare. NBS-by-GS ha il potenziale di trasformare il modo in cui vengono diagnosticate le malattie genetiche infantili e avviati i trattamenti. I dati preliminari suggeriscono che l’adozione nazionale di BeginNGS in tutte le nascite ha il potenziale per migliorare i risultati di oltre 50.000 bambini statunitensi all’anno.

Tipo di studio

Interventistico

Iscrizione (Stimato)

10000

Fase

  • Non applicabile

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

  • Nome: Lauren Olsen, MSN
  • Numero di telefono: 228456 858-576-1700
  • Email: lolsen1@rchsd.org

Luoghi di studio

    • California
      • San Diego, California, Stati Uniti, 92123
        • Reclutamento
        • Rady Children's Hospital San Diego
        • Contatto:

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Bambino

Accetta volontari sani

Descrizione

Criterio di inclusione:

  1. Neonati (<28 giorni) nei siti di arruolamento.
  2. I genitori devono aver identificato un fornitore di cure primarie (o un gruppo).

Criteri di esclusione:

  1. Neonati la cui madre ha meno di 18 anni.
  2. Neonati affidati allo Stato.
  3. Neonati il ​​cui genitore/tutore legale non è in grado di fornire il consenso.
  4. Genitori con indirizzo di casa al di fuori degli Stati Uniti o nella giurisdizione dei siti di registrazione.
  5. Neonati o feti malati e per i quali si prevede che l'arruolamento o il campionamento interferiscano con la fornitura di assistenza sanitaria al momento del parto. Ad esempio, feti o neonati che potrebbero richiedere il trasferimento a un livello di assistenza più elevato, come ad una terapia intensiva neonatale di livello IV al momento del parto.
  6. Neonati che sono in esame per una sequenza diagnostica rapida del genoma o altri test genetici diagnostici.
  7. Neonati di cui non si prevede che sopravvivano al periodo neonatale.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Scopo principale: Selezione
  • Assegnazione: N / A
  • Modello interventistico: Assegnazione di gruppo singolo
  • Mascheramento: Nessuno (etichetta aperta)

Armi e interventi

Gruppo di partecipanti / Arm
Intervento / Trattamento
Sperimentale: Iscritti
I neonati iscritti riceveranno il test BeginNGS oltre allo screening neonatale statale.
Sequenziamento genomico per lo screening di oltre 400 malattie genetiche.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Confronto tra l'utilità clinica di BeginNGS e lo standard di cura (NBS statale), definito dalla percentuale di iscritti che probabilmente trarranno beneficio (probabilità di avere un risultato migliore) da un intervento terapeutico indicato
Lasso di tempo: 5 anni
La percentuale di iscritti che probabilmente trarranno beneficio (probabilità di avere un risultato migliore) da un intervento terapeutico indicato (secondo un sistema di gestione clinica elettronica, Genome-to-Treatment, GTRx)
5 anni

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Risultato secondario di utilità 1
Lasso di tempo: 5 anni
La percentuale di BeginNGS e NBS statale di DBS che sono positivi (tasso positivo)
5 anni
Risultato secondario di utilità 2
Lasso di tempo: 5 anni
La proporzione di BeginNGS e NBS statale di risultati positivi DBS confermati (tasso di veri positivi e valore predittivo positivo)
5 anni
Risultato secondario di utilità 3
Lasso di tempo: 5 anni
La percentuale di BeginNGS e NBS statale di DBS che sono veri positivi e diagnosticati durante l'infanzia.
5 anni
Risultato secondario di utilità 4
Lasso di tempo: 5 anni
La percentuale di BeginNGS e NBS statale di DBS che sono veri positivi e diagnosticati alla fine dello studio.
5 anni
Risultato secondario di utilità 5
Lasso di tempo: 5 anni
La percentuale di BeginNGS e NBS statale di DBS che sono positivi e in cui è stato avviato un intervento terapeutico indicato entro la fine dello studio.
5 anni
Risultato secondario di utilità 6
Lasso di tempo: 5 anni
La percentuale di BeginNGS e NBS statale di DBS che sono positivi e in cui l'esito della malattia è cambiato a causa di un intervento terapeutico entro la fine dello studio.
5 anni
Risultato secondario di utilità 7
Lasso di tempo: 5 anni
Analisi dell'utilità clinica per sottogruppi (come definita dalla misura dell'esito primario) per razza (neri, bianchi, asiatici), etnia (ispanica, non ispanica), ascendenza genetica e gruppo di disturbi
5 anni
Risultato secondario di utilità 8
Lasso di tempo: 5 anni
Analisi di sottogruppi del tasso positivo (misura di risultato di utilità secondaria 1) per razza, etnia, discendenza genetica e gruppo di disturbi.
5 anni
Risultato secondario di utilità 9
Lasso di tempo: 5 anni
Analisi di sottogruppi del tasso di veri positivi (misura di risultato di utilità secondaria 2) per razza, etnia, discendenza genetica e gruppo di disturbi.
5 anni
Risultato secondario di utilità 10
Lasso di tempo: 5 anni
Analisi di sottogruppi della proporzione di BeginNGS e NBS statale di DBS che sono veri positivi e diagnosticati durante l'infanzia nell'infanzia per razza, etnia, ascendenza genetica e gruppo di disturbo.
5 anni
Esito di accettabilità 1
Lasso di tempo: 5 anni
Proporzione di genitori contattati che accettano di iscrivere il loro neonato (Figura 1c①). Questo è un "risultato chiave" (come definito da CONSORT PRO31).
5 anni
Risultato di accettabilità 2
Lasso di tempo: 5 anni
Questionari per medici e genitori (Figura 1c⑤) riguardanti la percezione dei benefici e dei danni di BeginNGS da parte dei genitori e dei pediatri di base.
5 anni
Risultato di accettabilità 3
Lasso di tempo: 5 anni
Analisi dei sottogruppi del tasso di iscrizione (percentuale di genitori contattati che accettano di iscrivere il proprio neonato; Figura 1c①) per razza, etnia, discendenza genetica e metodo di iscrizione.
5 anni
Risultato di accettabilità 4
Lasso di tempo: 5 anni
Analisi di sottogruppi dei questionari dei genitori (riguardanti la percezione dei benefici e dei danni di BeginNGS) per razza, etnia e ascendenza genetica.
5 anni
Fattibilità (capacità dello studio di essere intrapreso come previsto) risultato 1
Lasso di tempo: 5 anni
Tempo per restituire un risultato per BeginNGS e stato NBS.
5 anni
Fattibilità (capacità dello studio di essere intrapreso come previsto) risultato 2
Lasso di tempo: 5 anni
È tempo di restituire un risultato vero positivo confermato di BeginNGS e di stato NBS.
5 anni
Fattibilità (capacità dello studio di essere intrapreso come previsto) risultato 3
Lasso di tempo: 5 anni
Proporzione di iscritti con risultati positivi sottoposti a test di conferma da BeginNGS e NBS statale.
5 anni
Fattibilità (capacità dello studio di essere intrapreso come previsto) risultato 4
Lasso di tempo: 5 anni
Tempo alla diagnosi (tempo fino all'identificazione di una caratteristica clinica del disturbo) per BeginNGS e stato NBS.
5 anni
Fattibilità (capacità dello studio di essere intrapreso come previsto) risultato 5
Lasso di tempo: 5 anni
Proporzione di iscritti persi al follow-up a un anno di età.
5 anni
Risultato costo-efficacia 1
Lasso di tempo: 5 anni
Rapporto costo-efficacia medio (ACER, costo medio per prevenire la morte di un neonato o un evento avverso).
5 anni
Risultato costo-efficacia 2
Lasso di tempo: 5 anni
Rapporto costo-efficacia incrementale (ICER, variazione media del costo associato alla prevenzione della morte di un neonato o di un evento avverso).
5 anni
Risultato costo-efficacia 3
Lasso di tempo: 5 anni
Analisi dei sottogruppi del rapporto costo-efficacia medio (ACER, costo medio per prevenire la morte di un neonato o un evento avverso) per gruppo di disturbi (ad esempio disturbi metabolici, disturbi da immunodeficienza, disturbi convulsivi, disturbi endocrini, disturbi da carenza di vitamine e cofattori, disturbi ematologici, disturbi muscolari ).
5 anni
Risultato costo-efficacia 4
Lasso di tempo: 5 anni
Analisi dei sottogruppi del rapporto costo-efficacia incrementale (ICER, variazione media del costo associato alla prevenzione della morte di un neonato o di un evento avverso) per gruppo di disturbi (ad esempio disturbi metabolici, disturbi da immunodeficienza, disturbi convulsivi, disturbi endocrini, disturbi da carenza di vitamine e cofattori, disturbi ematologici disturbi, disturbi muscolari).
5 anni
Risultato di precisione 1
Lasso di tempo: 5 anni
Tasso di veri positivi (vero positivo/vero positivo+falso negativo, ricordo, sensibilità) di BeginNGS rispetto allo stato NBS di DBS (tutti gli iscritti).
5 anni
Risultato di precisione 2
Lasso di tempo: 5 anni
Tasso di positività reale di BeginNGS rispetto ad altri test genetici (nei neonati che successivamente ricevono test diagnostici per una sospetta malattia genetica).
5 anni
Risultato secondario di utilità 11
Lasso di tempo: 5 anni
Numero necessario per lo screening per prevenire la morte di un neonato o un evento avverso.
5 anni
Esito di fattibilità 6
Lasso di tempo: 5 anni
Incidenza di varianti e aplotipi associati a singole malattie genetiche nei neonati.
5 anni
Esito di fattibilità 7
Lasso di tempo: 5 anni
Determinazione categoriale del modello genetico di ereditarietà (ad esempio dominante, recessivo) delle singole malattie genetiche nei neonati (dove ciò non è stato stabilito inequivocabilmente).
5 anni
Risultato secondario di utilità 12
Lasso di tempo: 5 anni
Analisi categorica dei sottogruppi dell'efficacia degli interventi terapeutici individuali nei neonati.
5 anni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Investigatore principale: Stephen Kingsmore, MD DSc, Rady Children's Institute for Genomic Medicine
  • Investigatore principale: Rebecca Reimers, MD MPH, Rady Children's Institute for Genomic Medicine

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

29 febbraio 2024

Completamento primario (Stimato)

1 febbraio 2029

Completamento dello studio (Stimato)

1 febbraio 2029

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

22 febbraio 2024

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

5 marzo 2024

Primo Inserito (Effettivo)

12 marzo 2024

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

12 marzo 2024

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

5 marzo 2024

Ultimo verificato

1 marzo 2024

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • 20235517

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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