Impact des vaccins sur la résistance microbienne aux antimicrobiens (IVAR)

Type d'étude de recherche : Une série d'enquêtes transversales basées sur les communautés et les centres de santé

Problème : La pneumonie est l'une des principales causes de mortalité infantile à l'échelle mondiale et Streptococcus pneumoniae, l'une des principales causes d'infections des voies respiratoires inférieures (IVRI) chez les enfants de moins de cinq ans. Le paludisme reste endémique dans une grande partie de l'Afrique subsaharienne, provoquant fréquemment des maladies fébriles chez les enfants et malgré des progrès substantiels dans les programmes de contrôle, le paludisme continue d'être l'une des principales causes de mortalité infantile. La vaccination est donc une solution attractive.

On pense que les vaccins jouent un rôle crucial dans le contrôle de la résistance antimicrobienne (RAM), mais leur impact sur la RAM pourrait être plus complexe qu’on ne le pensait initialement. Les impacts directs et indirects du vaccin sur la RAM nécessitent une évaluation systématique. En collaboration avec le ministère de la Santé du Malawi, nous lançons deux évaluations randomisées en grappes, financées et approuvées par les organismes de réglementation, de vaccins ciblant deux des causes les plus courantes de maladie fébrile et de maladie potentiellement mortelle chez les enfants de moins de 5 ans en Afrique : l'infection invasive à pneumocoque. , et le paludisme. Cette étude s'appuiera sur deux grandes évaluations de vaccins randomisées en grappes financées (changement de calendrier du vaccin conjugué contre le pneumocoque 13-valent (PCV13) de 3+0 à 2+1 et introduction du vaccin antipaludique RTS,S/AS01 (nom commercial Mosquirix). Nous évaluerons les effets sélectifs des vaccins antipneumococciques et antipaludiques sur la résistance aux antibiotiques, les maladies fébriles et l'utilisation d'antibiotiques chez les enfants de moins de 3 ans.

Hypothèse : l'extension de la protection vaccinale contre Streptococcus pneumoniae via un changement de calendrier de 3+0 à 2+1 sera associée à une réduction de la prévalence des isolats porteurs de S. pneumoniae avec augmentation de la RAM chez les enfants de moins de 3 ans. L'introduction du vaccin contre le paludisme réduira la fréquence des consultations entraînant la prescription d'antibiotiques, réduira la prévalence des bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) Escheriquia coli ou Klebsiellae dans les selles des enfants de moins de 3 ans et modifiera le résistome des voies respiratoires supérieures. profil chez les enfants de moins de 3 ans.

Objectif : Établir les effets sélectifs directs et indirects des vaccins antipneumococciques et antipaludiques sur la résistance aux antibiotiques, les maladies fébriles et l'utilisation d'antibiotiques chez les jeunes enfants au Malawi.

Objectifs:

1. Établir le profil de résistance aux antibiotiques des isolats porteurs de S. pneumoniae provenant d'enfants de moins de 3 ans suite à un changement de calendrier du PCV13 qui étend la protection (2+1 contre 3+0) ou à l'introduction du vaccin contre le paludisme (RTS,S/AS01).
2. Évaluer la fréquence des maladies fébriles et de l'utilisation d'antibiotiques chez les enfants < 3 ans après le changement du calendrier du PCV13 ou l'introduction du vaccin contre le paludisme
3. Étudier le changement dans le résistome des voies respiratoires supérieures chez les enfants <3 ans après le changement du calendrier PCV13 ou l'introduction du vaccin contre le paludisme.

Méthodologie : Trois enquêtes par échantillonnage transversal doivent être menées (1) peu de temps après l'introduction du PCV13 2+1, suivies d'enquêtes 18 et 33 mois après l'introduction, et (2) pour RTS,S/AS01 2,5 ans, 3 ans et 3,5 ans. après introduction, en grappes définies au moyen de deux grandes études d'évaluation du vaccin randomisées en grappes. Ceux-ci comprendront la collecte d'écouvillons nasopharyngés et rectaux et le remplissage d'un questionnaire individuel sur les épisodes de maladie fébrile, l'utilisation du test de diagnostic rapide (TDR) du paludisme et l'utilisation de médicaments en mettant l'accent sur les antibiotiques. De plus, nous surveillerons la prescription d'antimicrobiens et les maladies fébriles au niveau des centres de santé au sein des communautés où l'étude se déroulera en effectuant des audits des centres de santé (SC). Il s'agira de très brefs « entretiens de sortie » anonymisés avec des utilisateurs du service de consultation externe (OPD) sélectionnés au hasard, dans lesquels nous enregistrerons des informations sur le vaccin concerné (soit RTS, S/AS01 ou PCV13), le RDT contre le paludisme (en tant que proxy). pour les maladies fébriles) et prescription de médicaments

Résultats attendus Des écouvillons nasopharyngés et rectaux obtenus auprès des participants seront testés pour la présence de S. pneumoniae et d'isolats d'E. coli et de Klebsiella respectivement. Les isolats bactériens seront testés pour la présence de gènes AMR, et les profils de résistance seront analysés en relation avec leur association soit à l'introduction du vaccin RTS,S/AS01, soit au changement de calendrier PCV13, et dans le contexte de la prescription et de l'utilisation des antibiotiques. pour les épisodes de maladie fébrile.

Mesures des résultats :

Primaire : le profil de résistance aux antibiotiques des isolats porteurs de S. pneumoniae provenant d'enfants de moins de 3 ans suivant un calendrier PCV13 qui étend la protection (2+1 contre 3+0) ou l'introduction du vaccin contre le paludisme (RTS,S/AS01)

Secondaire:

1. La fréquence des maladies fébriles et de l'utilisation d'antibiotiques chez les enfants <3 ans après le changement du calendrier PCV13 ou l'introduction du vaccin contre le paludisme.
2. Le portage dans les selles de BLSE E. coli ou Klebsiella chez les enfants de moins de 3 ans après un changement de calendrier du PCV13 ou l'introduction du vaccin contre le paludisme.
3. La modification du résistome des voies respiratoires supérieures chez les enfants <3 ans après le changement du calendrier du PCV13 ou l'introduction du vaccin contre le paludisme.

Éligibilité de la population : Pour le changement de calendrier du PCV13, chaque enquête transversale recrutera des enfants âgés de 4 à 9 mois pour l'enquête de base, et âgés de 15 et 24 mois pour les enquêtes suivantes, résidant dans le district de Blantyre, recrutés dans la communauté. . Pour RTS,S/AS01, chaque enquête transversale recrutera des enfants âgés de 18 à 36 mois, résidant à Mangochi, recrutés dans la communauté. Des audits anonymes des TDR et de l'utilisation des médicaments chez les enfants de moins de 3 ans fréquentant un sous-ensemble de CS pour enquêter sur une mauvaise santé seront également menés.

Diffusion des résultats : les enquêteurs chercheront à publier en temps opportun dans des revues à comité de lecture. Les résultats partiels et les analyses intermédiaires seront partagés avec le ministère de la Santé (MoH) du Malawi et d'autres décideurs politiques et parties prenantes concernés. Les résultats partiels et finaux seront présentés au College of Medicine (Journée de diffusion de la recherche COM, réunions de recherche en cours de Malawi-Liverpool Wellcome Trust (MWL) et conférences scientifiques internationales. Une copie de tous les documents et rapports publiés sera partagée avec le comité d'éthique de la recherche du Collège de médecine (COMREC) et la bibliothèque du Collège de médecine du Malawi.