Pathobiomes dans l'intestin des patients gravement malades

Malgré de puissants antibiotiques, 50% des tracts intestinaux de patients chirurgicaux gravement malades sont colonisés par Pseudomonas aeruginosa, dont la simple présence dans ce site augmente quadruple la mortalité par des mécanismes qui restent inconnus. De nombreux patients qui survivent au traumatisme chirurgical initial succombent toujours à une défaillance multi-organes et à la septicémie secondaire à une infection nosocomiale invasive. Les séquelles du choc, de l'hypoxie et de la nutrition parentale entraînent une blessure à la muqueuse intestinale, des changements de perméabilité intestinale et une défaillance des mécanismes de défense intestinaux. Ces conditions mettent les patients à risque d'infection et de défaillance d'organes multiples secondaires à la translocation des bactéries entériques, initiant une libération systémique de médiateurs inflammatoires - un processus qui a été appelé septicémie dérivée de l'intestin.

L'intestinal P. aeruginosa détecte les facteurs de l'hôte libérés pendant le stress et répond en activant sa machinerie de gènes de virulence. En tant que tel, la présence d'un milieu intestinal hautement activateur sert à induire une virulence dans les souches de P. aeruginosa et cela est en corrélation à la gravité de la maladie d'un patient. Bien que l'interaction hôte-pathogène soit un processus dynamique, l'étude s'attend à ce que la maladie d'un patient s'aggrave ou se résout avec le temps, les propriétés "activant la virulence" de leur milieu intestinal changent en conséquence. Cette étude mènera un essai d'observation prospectif dans une population de patients gravement malades à l'Université du Chicago Medical Center. Cet essai impliquera la collecte et le dépistage d'échantillons de selles obtenus de patients gravement malades pour leurs capacités induisant la virulence sur les souches de laboratoire de P. aeruginosa en utilisant des tests in vitro et in vivo. L'étude prévoit également d'isoler les souches de P. aeruginosa intestinale des échantillons de selles pour déterminer la prévalence de P. aeruginosa intestinale dans une population de patients gravement malades.