ガンビアのヘリコバクター (前編)

このパイロット プロジェクトの全体的な目標は、ヘリコバクター ピロリ (H. ピロリ菌株を幼児から分離し、これらの分離株を同じ集団の成人から得られた分離株と比較します。 これは研究のパート I であり、パート II は微生物学および感染症部門のプロトコル 06-0004 に記載されています。 小児期のコロニー形成から成人の病状への移行は、感染に対する宿主の反応によって部分的に駆動される、ヘリコバクター ピロリ菌株自体のコロニー形成の遺伝子型の進化を含む複数の要因によって影響を受ける可能性があります。 仮説は、ガンビアの子供からのピロリ菌株は、同じコミュニティから慢性的に定着した成人の株とは遺伝的に異なるというものです。 小児および成人のピロリ菌分離株の遺伝的および表現型の特徴付けは、これら 2 つの年齢層で循環している菌株間の根本的な違いをテストし、それによって、そのようなリスクの高い社会における菌株選択および/またはゲノム進化の重要性を評価するのに役立ちます。 特定の目的は次のとおりです。ガンビアの成人および診断用上部内視鏡検査を受けている子供の胃生検から培養されたピロリ菌から得られた遺伝子型の範囲を、同じ被験者から吸引された胃液の培養によって得られたものと比較すること。 これにより、胃生検由来のピロリ菌分離株と比較した場合、診断内視鏡検査を必要としない子供からの経鼻胃吸引物の培養から得られた結果の解釈が可能になります。 ほとんどのジェノタイピングには、病原性マーカーのポリメラーゼ連鎖反応試験、限られた (焦点を絞った) DNA 配列決定、およびメトロニダゾールに対する感受性と前方突然変異の頻度の試験が伴います。 研究集団は、西アフリカのガンビアの居住者で構成されます。 臨床管理の一環として診断内視鏡検査を受けている男女およびすべての年齢の最大 75 人の成人、および臨床管理の一環として診断内視鏡検査を受けている男女および 2 歳未満の栄養失調の子供 20 人、研究されます。 すべての被験者は、ガンビアのファジャラにあるイギリスの研究所および臨床施設の医学研究評議会で研究されます。 主な結果の尺度は、細菌分離株間の関連性の程度になります。 これは、多型DNAのランダム増幅（RAPD）の結果を視覚的に比較すること、目的の対立遺伝子の遺伝子型を比較す​​ること、およびSTARプログラム（分析のために DNA 配列をまとめる) および複数の遺伝子座配列タイピング (MLST) データベース。 ヒト被験者の結果測定はありません。 すべての実験室調査は、細菌分離株に対して実施されます。