冈比亚的幽门螺杆菌（第 1 部分）

该试点项目的总体目标是实施和评估一种分离幽门螺杆菌 (H. pylori) 的新方法。 pylori) 菌株，并将这些菌株与从同一人群的成人中获得的菌株进行比较。 这是研究的第一部分，第二部分在微生物学和传染病学部方案 06-0004 中进行了描述。 从儿童定植到成人疾病状态的转变可能受到多种因素的影响，包括定植的幽门螺杆菌菌株本身的基因型进化，部分是由宿主对感染的反应驱动的。 假设是来自冈比亚儿童的幽门螺杆菌菌株在遗传上与来自同一社区的长期定植的成年人的菌株不同。 儿童和成人幽门螺杆菌分离株的遗传和表型特征将测试在这 2 个年龄组中传播的菌株之间的根本差异，从而有助于评估菌株选择和/或基因组进化在此类高风险社会中的重要性。 具体目标是：比较从接受诊断性上内窥镜检查的冈比亚成人和儿童的胃活组织检查培养的幽门螺杆菌获得的基因型范围，与从同一受试者的胃液抽吸物培养获得的基因型范围。 与胃活检衍生的幽门螺杆菌分离株相比，这将允许解释从不需要诊断性内窥镜检查的儿童的鼻胃管抽吸物培养中获得的结果。 大多数基因分型将需要对毒力标记进行聚合酶链反应测试、有限（重点）DNA 测序以及对甲硝唑的易感性和正向突变频率的测试。 研究人群将包括西非冈比亚的居民。 多达 75 名所有年龄段的成年人，他们正在接受诊断性内窥镜检查作为其临床管理的一部分，以及 20 名营养不良的两性和 2 岁以下儿童，他们正在接受诊断性内窥镜检查作为其临床管理的一部分, 将被研究。 所有科目都将在英国医学研究委员会研究实验室和位于冈比亚法哈拉的临床机构进行研究。 主要结果指标将是细菌分离株之间的相关程度。 这将通过多态性 DNA 随机扩增 (RAPD) 结果之间的视觉比较，通过比较感兴趣的等位基因的基因型，以及最终通过管家基因测序构建相关性的系统发育树来评估，使用 STAR 程序（用于将 DNA 序列放在一起进行分析）和多位点序列分型 (MLST) 数据库。 没有针对人类受试者的结果测量。 所有实验室调查都将对细菌分离物进行。