TP53 変異キャリアのバイオマーカーモニタリング
家族性高がん素因設定における TP53 遺伝子変異を有する若い個人のバイオマーカーモニタリング
目的
この研究は、TP53 遺伝子の遺伝子変異による癌の遺伝的素因を持つ個人に焦点を当てた「N-of-One」観察研究です。 この変異を持つ個人は、生涯でさまざまな形態のがんを発症する可能性が 90% 以上あります。 生殖細胞 TP53 遺伝子突然変異キャリアはがんに非常にかかりやすいため、がんの予防戦略とがんの早期発見戦略が重要です。 残念なことに、生殖細胞系 TP53 遺伝子突然変異キャリアを癌の初期の兆候についてモニタリングするための現在の標準治療は、年 1 回の MRI スキャンと断続的な採血です。 ヴィラニ等。は、標準的なモニタリングが不十分であることを示し、がんの早期発見のためのより洗練されたプロトコルを導入しました。 Villaniらを拡張しました。早期発見のための多くのマーカーを含めるプロトコルであり、現在、それらの固有の変動性、頻繁な尋問に対する患者の忍容性、およびさらなる検査の必要性を示す可能性のある変化を示す能力の観点から、それらの有用性を精査しています.
収集されるマーカーに加えて、食事、睡眠、活動などの重要な共変量情報が (ウェアラブル ワイヤレス デバイスなどを介して) 収集され、単一のデータでマーカーのレベルを評価する際に考慮に入れられます。収集時間または時間の経過。 プロトコルの重要な側面の 1 つは、Drescher らによって議論された「個人化されたしきい値」の概念を本質的に利用して、腫瘍形成を示す可能性のある個人の経時的なマーカー状態の変化を、特定のレベルではなく特定することです。
癌、腫瘍形成プロセス、または不健康の一般的な徴候の存在の兆候が観察された場合、プロトコルは研究チーム間での調査結果の議論、続いて研究チームの臨床リーダーとの議論を要求します。参加している患者のケアを監督する一次医療提供者および/または専門家、議論の動機となるアッセイの検証の可能性、および一次医療提供者および/または専門家の介入方法に関する決定。
調査の概要
状態
詳細な説明
特定の生殖細胞系 TP53 遺伝子変異を保有する個人は、がんに非常にかかりやすく、生涯でいずれか 1 つまたは多くの種類のがんを発症する可能性があります。 そのような個人にとって、予防戦略と早期腫瘍検出戦略は非常に重要です。 これは、Villani らによって示されています。がんマーカーの積極的なモニタリングは、標準的なモニタリング プロトコルよりもはるかに優れた結果 (例: がんの早期発見) につながる可能性があります。 しかし、がんの存在を示すことができる早期発見に使用するマーカーの選択、および遺伝性がん症候群などの特定のがん素因を持つ患者または個人の監視および監視戦略は複雑です。 この選択は、多くの場合、大規模な集団レベルの臨床研究における潜在的なマーカーの幅広いリストの中で観察された一連のマーカーの有用性によって導かれます。 しかし、集団全体の一連のマーカーに基づく早期発見または監視戦略の有用性は、特定の個人に対するこれらのマーカーの有用性に必ずしも変換されません。 この現象は、生殖細胞系 TP53 遺伝子変異を持つ個人など、まれな遺伝性癌症候群および状態を持つ個人にとってさらに問題となります。 TP53 変異を持つ個人の間でさえ、発がん性物質への曝露や他の感受性変異の存在などの他の要因により、がんの発症年齢にばらつきがあります (Arrifin et al. 2015)。 さらに、遺伝した TP53 突然変異を持つ個人が実際にまれであることを考えると、TP53 突然変異保因者の癌および/または一般的な疾患の徴候を今後モニタリングするのに役立つ可能性のある一連のマーカーを特定するために追求されてきた大規模な研究はありません。
具体的には、TP53 遺伝子の DNA 配列バリアントを継承した個人は、生涯でがんを発症する可能性が 90% を超え、生涯で複数の連続したがんを発症することがよくあります。 TP53 変異を持つ女性が 45 歳になる前に癌を発症する確率は 82% であり (Chompret A et al. 2000)、一般に TP53 変異を持つ個人の癌発症の平均年齢は 28 歳ですが、これらの統計では存在する突然変異の種類、遺伝的背景、保因者が住んでいる環境など、他の要因を考慮に入れていません。 (Ruijs et al. 2010; Sagne et al. 2014; Petitjean et al. 2007) 最終的に癌を発症し、遺伝性の TP53 遺伝子変異を保有する個人は、医学文献で「リ-フラウメニ症候群」であると説明されています。 残念なことに、frank Li-Fraumeni 症候群の患者、または TP53 遺伝子に変異がある (まだがんを発症していない) 患者の TP53 変異をもつ近親者は、がんを発症するリスクがさらに高くなります。 (Hwang ら。 2003;ニコルズ等。 2001) さらに、リ-フラウメニ症候群の家族では、がん形成の発症年齢が世代ごとに早いという「予測」が行われることが示されており、これらの TP53 変異キャリアは、早期発症を発症した年配の親戚と一緒に置かれます。がんは、人生の早い段階でがんを発症するリスクがさらに高くなります。 (Trkova et al. 2002; Arrifini et al. 2015)
これらの調査結果に照らして、リ-フラウメニ症候群を発症した兄弟姉妹を持つ TP53 突然変異の個々の保因者、およびより古い世代の個人が早期発症がんを患った家系に属する人は、非常に早期発症のがんを発症する可能性がはるかに高く、がんの徴候がないか注意深く監視する必要があります。 実際、特定のがんの発症年齢については文献に記載されています。 表 1 は、Petitjean らの研究で説明されているデータに基づいて、変異体 TP53 タンパク質の測定された活性化レベルに応じたさまざまながんの平均発症年齢の範囲を示しています。 (2007) 最初に、ほとんどの TP53 突然変異保因者は生涯にわたって複数の癌を発症することに注意してください。そのため、表 1 の癌の発症年齢は、保因者によって発症した 2 番目または 3 番目の癌に関連している可能性があります。 第二に、「軟部組織肉腫」などのカテゴリーは、単一のがんではなく、多くの種類のがんを指すことに注意してください。 これらの事実は、成人になる前であっても、がんの初期の徴候についてそのような個人を監視することが、特に軟部組織、脳、および骨の肉腫にとって有益であることを示唆しています。 重要なことに、TP53 変異の保因者、または率直なリー-フラウメニ症候群の保因者におけるがんの早期発見は、Villani らによって記述されているように、生存率と治療介入の有効性を劇的に高めることができることが示されています。 (2011)とりわけ。 しかし、Villaniらによる研究で使用された少数のマーカーはあるものの、 TP53 変異を持つ個人の癌の初期兆候の検出を容易にすることができる洗練された包括的な患者モニタリングスキームが欠けています. (2011) は有望であることが示されました。 さらに、TP53 突然変異キャリアの現在受け入れられている保険償還可能な監視方法は、1 年に 1 枚の全身画像であり、これは単に不十分であり、Villani らによる臨床研究で実際に不十分であることが示されています。 (2011)
これらの事実の結果として、現在のプロジェクトは、プロトタイプの縦断的な「バイオマーカー」(血液ベースのタンパク質など)および「バイオメトリック」(画像またはウェアラブル無線デバイスなど)のモニタリング戦略を開発するように設計されました。癌の家族性凝集による、癌に対するさらに顕著な素因。 このモニタリング戦略は、がんの形成またはがんに対する感受性を悪化させる可能性のある健康関連の現象を反映している可能性のあるバイオマーカーの変化を特定するのに役立つ可能性があります。 このプロジェクトは、さまざまなマーカー、アッセイ、およびデバイスを活用するだけでなく、マーカーとデバイスのデータから推論を引き出すための分析とプロトタイプの視覚化方法の開発も行います。 最終的に、このプロトコルは、癌の感受性が高い状況で TP53 変異を有する個々の被験者 (例えば、Li-Fraumeni 症候群の兄弟および古い世代の家族性がん)。 このプロトコルには、Villani らによって説明された吟味されたマーカー (1) と、生物医学的に重要である可能性が高いこれらのマーカーの状態の値または変化を検出する可能性を高めるための、より包括的なマーカー、バイオメトリクス、および手順のセットが含まれます。 . がん生存者の 50% (4/7) 以上が、Villani らで正常に監視されているため。 (2011) の研究は 20 歳未満であり、TP53 突然変異保因者のがん発症年齢は、Li-Fraumeni および早期発症がんの家族歴を持つ人で最も低いという事実、および公開されたレポートでは、年齢が- TP53 変異保持者のがん発症率は非常に低いため (表 1 など)、このプロトコルを未成年者や子供に導入することは正当化されると考えています。 研究対象のバイオマーカーの多くは遺伝的基盤を持っている可能性が高いため、対象患者の家族から表現型とバイオサンプルを収集して、それらの値が対象患者の値の対照値として機能できるようにすることは理にかなっています。
現在登録されている患者のプロトコルを介して収集されているマーカーと頻度には、次のものがあります。
- 全身の磁気共鳴画像法 (MRI) による分析を 4 ~ 6 か月ごとに実施
- 焦点を合わせた両側乳房 MRI を 6 か月ごとに
- 6か月ごとの腹部超音波画像検査
- 2 週間ごとにショットガン シーケンスによる便マイクロバイオーム
- 月に1回の広範な血液代謝プロファイリング
- セルフリー DNA を月に 1 回循環させる
- 月に 1 回、血球からの DNA 修復アッセイの結果が得られます
- 文献に裏付けられた早期癌検出血液ベースのマーカー (17-OH-プレグネノロン、テストステロン、プロゲステロン、11 デオキシコルチゾール、デオキシコルチコステロン (DOC)、ベータ-2-ミクログロブリン、癌胎児性抗原 (CEA)、癌抗原 125 (CA) -125)、β-ヒト絨毛性ゴナドトロピン(β-HCG)、α-フェトプロテイン、17-OH-プロゲステロン、アンドロステンジオン、デヒドロエピアンドロステロン(DHEA)、乳酸脱水素酵素)。
- 2 か月に 1 回、血球計算情報を記入してください
- 血清電解質および肝機能検査(ナトリウム、カリウム、塩化物、重炭酸塩、血中尿素窒素、クレアチニン、ブドウ糖、カルシウム、アルブミン、総タンパク、ビリルビン、アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ、アラニンアミノトランスフェラーゼ、アルカリホスファターゼ)
この提案された、単一被験者、または「N-of-1」研究デザインには、TP53キャリアでの長期的なデータ収集(つまり、サンプリングの繰り返し)が含まれ、時間の経過に伴う健康に有益な変化を検出します。 研究対象のバイオマーカーとバイオメトリクスの多くは、がんを検出する可能性があることを強調しますが、一般的な健康状態の変化の指標を提供するだけである可能性もあります。腫瘍形成を検出したり、さらなる精査が必要な健康状態の変化を示したりするバイオマーカーを監視します。
表1。
結腸直腸 36.3 - 52 年 乳房 33.3 - 42.7 年 軟部肉腫 17.3 - 20.6 年 脳腫瘍 23.6 - 26.2 年 骨肉腫 16.9 - 17.7 年 副腎皮質 3.2 - 4.6 年 肺 46.1 - 48.8 年
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
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-
California
-
La Jolla、California、アメリカ、92037
- Scripps Clinic Medical Group
-
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- リー・フラウメニ症候群の影響を受けやすい既知の機能的に重要な生殖細胞系 TP53 変異を有する個人およびその家族。
- 既知の遺伝性がん症候群を有する個人およびその家族。
除外基準:
- 機能的に重要な生殖細胞系 TP53 遺伝子変異はありません。
- 集中的なバイオモニタリングに耐えられない。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:ケースのみ
- 時間の展望:見込みのある
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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がんの発生
時間枠:12ヶ月
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12ヶ月
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協力者と研究者
スポンサー
捜査官
- 主任研究者:Nicholas J Schork, PhD、J. Craig Venter Institute
- スタディディレクター:Victoria Magnuson, PhD、J. Craig Venter Institute
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Villani A, Tabori U, Schiffman J, Shlien A, Beyene J, Druker H, Novokmet A, Finlay J, Malkin D. Biochemical and imaging surveillance in germline TP53 mutation carriers with Li-Fraumeni syndrome: a prospective observational study. Lancet Oncol. 2011 Jun;12(6):559-67. doi: 10.1016/S1470-2045(11)70119-X. Epub 2011 May 19.
- Chompret A, Brugieres L, Ronsin M, Gardes M, Dessarps-Freichey F, Abel A, Hua D, Ligot L, Dondon MG, Bressac-de Paillerets B, Frebourg T, Lemerle J, Bonaiti-Pellie C, Feunteun J. P53 germline mutations in childhood cancers and cancer risk for carrier individuals. Br J Cancer. 2000 Jun;82(12):1932-7. doi: 10.1054/bjoc.2000.1167.
- Ruijs MW, Verhoef S, Rookus MA, Pruntel R, van der Hout AH, Hogervorst FB, Kluijt I, Sijmons RH, Aalfs CM, Wagner A, Ausems MG, Hoogerbrugge N, van Asperen CJ, Gomez Garcia EB, Meijers-Heijboer H, Ten Kate LP, Menko FH, van 't Veer LJ. TP53 germline mutation testing in 180 families suspected of Li-Fraumeni syndrome: mutation detection rate and relative frequency of cancers in different familial phenotypes. J Med Genet. 2010 Jun;47(6):421-8. doi: 10.1136/jmg.2009.073429.
- Sagne C, Marcel V, Bota M, Martel-Planche G, Nobrega A, Palmero EI, Perriaud L, Boniol M, Vagner S, Cox DG, Chan CS, Mergny JL, Olivier M, Ashton-Prolla P, Hall J, Hainaut P, Achatz MI. Age at cancer onset in germline TP53 mutation carriers: association with polymorphisms in predicted G-quadruplex structures. Carcinogenesis. 2014 Apr;35(4):807-15. doi: 10.1093/carcin/bgt381. Epub 2013 Dec 11.
- Petitjean A, Achatz MI, Borresen-Dale AL, Hainaut P, Olivier M. TP53 mutations in human cancers: functional selection and impact on cancer prognosis and outcomes. Oncogene. 2007 Apr 2;26(15):2157-65. doi: 10.1038/sj.onc.1210302.
- Hwang SJ, Lozano G, Amos CI, Strong LC. Germline p53 mutations in a cohort with childhood sarcoma: sex differences in cancer risk. Am J Hum Genet. 2003 Apr;72(4):975-83. doi: 10.1086/374567. Epub 2003 Feb 27.
- Nichols KE, Malkin D, Garber JE, Fraumeni JF Jr, Li FP. Germ-line p53 mutations predispose to a wide spectrum of early-onset cancers. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2001 Feb;10(2):83-7.
- Trkova M, Hladikova M, Kasal P, Goetz P, Sedlacek Z. Is there anticipation in the age at onset of cancer in families with Li-Fraumeni syndrome? J Hum Genet. 2002;47(8):381-6. doi: 10.1007/s100380200055.
- McBride KA, Ballinger ML, Killick E, Kirk J, Tattersall MH, Eeles RA, Thomas DM, Mitchell G. Li-Fraumeni syndrome: cancer risk assessment and clinical management. Nat Rev Clin Oncol. 2014 May;11(5):260-71. doi: 10.1038/nrclinonc.2014.41. Epub 2014 Mar 18.
- Drescher CW, Shah C, Thorpe J, O'Briant K, Anderson GL, Berg CD, Urban N, McIntosh MW. Longitudinal screening algorithm that incorporates change over time in CA125 levels identifies ovarian cancer earlier than a single-threshold rule. J Clin Oncol. 2013 Jan 20;31(3):387-92. doi: 10.1200/JCO.2012.43.6691. Epub 2012 Dec 17.
- Ariffin H, Hainaut P, Puzio-Kuter A, Choong SS, Chan AS, Tolkunov D, Rajagopal G, Kang W, Lim LL, Krishnan S, Chen KS, Achatz MI, Karsa M, Shamsani J, Levine AJ, Chan CS. Whole-genome sequencing analysis of phenotypic heterogeneity and anticipation in Li-Fraumeni cancer predisposition syndrome. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Oct 28;111(43):15497-501. doi: 10.1073/pnas.1417322111. Epub 2014 Oct 13.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (見積もり)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- Scripps IRB 14-6419
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