南アフリカにおけるインフルエンザ、呼吸器合胞体ウイルス、その他の呼吸器病原体の地域社会負担と感染力学に関する前向き世帯観察コホート研究 (PHIRST-SA)

背景: インフルエンザの地域社会への負担に関する情報は、制御に情報を提供するために不可欠ですが、日常的に収集されていません。 たとえば、ワクチン、抗ウイルス薬、および非医薬品対策の有効性と費用対効果を知るために広く使用されているインフルエンザ伝播モデルは、地域社会での病気の発生と伝播に関する有効な疫学推定に依存しています。 英国のインフルエンザ・ウォッチ・コホート研究などの地域レベルの研究は近年、高所得国で実施されているが、低・中所得国、特に負担が大きいアフリカでは、インフルエンザの地域内負担は依然としてほとんど知られていない。インフルエンザの方が高くなる可能性があります。 さらに、インフルエンザウイルスの家庭内感染動態に関するデータは存在しない。 このようなデータは、例えば、利用可能なインフルエンザワクチンが現在認可されていない、または有効性が低い、より脆弱なグループを保護するために、インフルエンザワクチン接種の間接効果を最大化する方法など、対象を絞った介入を知らせる重要な洞察を提供する可能性があります。 2 歳未満の子供）。

ヒト呼吸器合胞体ウイルス (RSV) は、特に生後 3 か月未満の乳児における小児急性下気道感染症の主な原因です。 RSV ワクチンは現在利用できませんが、有望な RSV 候補ワクチンの有効性が評価されています。 RSウイルスワクチン接種の代替戦略として、集団内でのウイルスの循環を減らしたり、乳児への連鎖感染を防ぐことで脆弱な乳児を間接的に保護するための高齢層へのワクチン接種などが提案されている。 それにもかかわらず、これらの影響を評価するには、地域社会における RSV 負荷、伝播動態、および乳児の感染源に関する知識が必要です。

肺炎球菌は、肺炎の主な原因となる細菌です。 肺炎球菌結合型ワクチン (PCV) は、2009 年に予防接種に関する拡張プログラムに導入されました。 保菌率、保菌の動態、他の呼吸器病原体との相互作用に関するデータは、ワクチン接種では予防できない肺炎球菌疾患を対象とした介入の指針となるでしょう。 ジフテリアと百日咳はいずれも近年、南アフリカで新興病原体として特定されており、長年にわたって流行率が低かった後、2014年と2015年に大流行を引き起こした。 髄膜炎菌は、南アフリカで周期的に流行を引き起こす流行しやすい病気ですが、南アフリカにおける保菌の蔓延についてはほとんど知られていません。 アフリカ南部の結核の年間発生率は世界的に最も高く、スワジランド、レソト、南アフリカは世界で最も結核率が高い。 さらに、南アフリカでは結核が死亡届の主な死因となっており、HIV感染者（抗レトロウイルス薬をまだ投与していない人も、抗レトロウイルス薬を服用中の人も）では、重篤な日和見感染症の最大の原因となっている。

これらの病原体の保菌率および/または伝播動態に関するデータは、標的を絞ったワクチン接種戦略を含む制御手段の指針となるために重要です。 家庭内感染を制限するための予防努力がしばしば推奨されますが、家庭内感染と HIV 感染の影響に関するデータは現時点では限られています。

主な目的

• 以下を含む、インフルエンザおよび RSV の地域社会への負担を推定すること。(i) 地域社会におけるインフルエンザおよび RSV 感染の発生率。 (ii) インフルエンザおよび RSV 感染に関連する症状のある割合。 (iii) 症候性感染症に関連する重症度。 (iv) 症状のある感染症を患い、医療を求めている人の割合。
• 地域社会におけるインフルエンザおよび RSV 感染症の伝播動態を評価すること。これには以下が含まれます。(i) 家庭内二次感染リスク (SIR)、連続間隔および排出期間の推定。 (ii) 家庭内およびおそらく地域社会内の年齢層間の感染伝播の推定。 (iii) 地域社会における実効再生産数 (Rt) とその経時的変動の推定。

セカンダリ (選択済み)

• 症候性の割合、症候性感染症に関連する重症度、およびインフルエンザまたは RSV 陽性症例のうち医療を求めている症候性感染症患者の割合を、HIV 血清状態および年齢別に推定します。
• HIV感染者およびHIV非感染者の初発症例におけるインフルエンザおよびRSVのSIRと排出期間、およびHIV感染者およびHIV非感染者の世帯員におけるインフルエンザおよびRSV感染の罹患率を推定する。
• インフルエンザと RSV の家庭内感染における無症候性感染症の役割を評価する。
• 世帯クラスター内のインフルエンザおよび RSV ウイルス株の不均一性を特定し、世帯内および世帯間でのウイルスの進化、ならびにウイルス株とウイルス排出期間および HIV 状態との関連性を説明します。
• 健康な人の鼻咽頭肺炎球菌負荷を年齢および経時的に説明および比較し、その負荷が呼吸器ウイルス感染症、HIV 状態、ワクチン接種状態によってどのように変化するかを説明および比較する。
• 地域内での百日咳菌の定着率と定着期間を年齢層別、ワクチン接種状況と経時変化、家庭内での感染力学、症状のある感染症を発症する人の割合を特定する。
• 毎年ある時点で、地域社会内での髄膜炎菌およびジフテリア菌の定着率を年齢層ごとに調べること
• 研究世帯に住んでいる個人の結核感染の年間発生率を測定し、結核感染の危険因子（HIVの発生および蔓延を含む）を評価する。
• 住宅の質、燃料使用量、室内空気の質、および選択された換気手段が結核感染や呼吸器系ウイルスや細菌の家庭内感染に及ぼす影響を確認するため 方法: ムプマランガ州の農村地域で世帯レベルのコミュニティコホート研究を実施します。保健人口統計監視 (HDSS) が実施されている場所 (Agincourt HDSS 監視サイト) と、ノースウェスト州マトロサナ市の一部の都市部。 2010 年以来、これらの施設では、インフルエンザおよび RSV に関連した重症急性呼吸器疾患に対する前向きの病院ベースのサーベイランスが実施されています。 この前向きコホート研究は、RSVとインフルエンザの3シーズン連続を含めて、2016年から2018年の3年連続で実施される予定です。 約 100 世帯（施設ごとに 50 世帯、合計 500 人の登録者を募集するために予想される平均世帯員数は 5 人）が毎年研究対象母集団内から無作為に選択され、研究への参加に同意されます。 世帯員ごとに、RSウイルス（2月から5月）およびインフルエンザ（5月から9月）の流行期の前後を含め、四半期ごと（1月から2月、4月から5月、9月から10月、11月から12月）に血清が採取され、最終血液が採取されます。年末に抽選します。 世帯員の人口統計的特徴は登録時に収集されます。 RSウイルスやインフルエンザの季節前から、年間を通じて呼吸器症状の有無にかかわらず、訓練を受けた研究看護師によって世帯全員から上気道サンプルが週に2回採取される。 各訪問中に、症状の進行（重症度スコアを使用）と症状のある症例の医療機関を求める行動が記録されます。 さらに、冬季の家庭訪問では、髄膜炎菌とジフテリアの検査のために各個人から口腔咽頭ぬぐい液が採取されます。 鼻咽頭サンプルは、リアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応 (rt-PCR) によって、RSV またはインフルエンザ ウイルス、肺炎球菌および百日咳菌感染の検出について検査されます。 血液サンプルは、RSV、インフルエンザ、百日咳の抗体力価の上昇について検査されます。 同意した患者の血液サンプルは、HIV 感染の有無を検査されます。 結核感染症については、前回の検査でTST陰性であることが判明した人を対象に、ベースライン時と1年目の終わりにツベルクリン皮膚検査（TST）を実施し、その後は毎年検査を行います。 HIV 検査は、ベースライン時にすべての参加者に提供され、その後は 6 か月ごとに実施されます。 すべての参加者は、ベースライン時に培養のために喀痰サンプルを採取され、その後毎月結核の症状についてスクリーニングされ、結核の症状が存在するかどうかをXpert Mtuberculosis/Rifで調査されます。

連続する 3 シーズンにわたる約 1500 人のサンプル サイズにより、地域社会における 95% CI および 5% の望ましい絶対精度で、20% の感染リスクと 10% の疾病リスクを推定することができます。 研究の 1 年目と 2 年目に登録された世帯の個人は、研究の 2 年目と 3 年目の終わり（10 月）に向けて 1 回のフォローアップ訪問を受けます。 この訪問では、HIV感染症、インフルエンザ、RSV血清学的検査のための血液検体が収集され、前回の検査でTST陰性であることが判明した個人に対してTST検査が実施されます。

影響：この研究は、南アフリカにおけるインフルエンザ、RSV、百日咳、結核、肺炎球菌感染症の地域社会への負担についての理解を深めます。 また、髄膜炎菌とジフテリアの保菌率に関するデータも提供されます。 この研究から生成されたデータは、地域社会におけるインフルエンザ、RSV、百日咳、肺炎球菌の伝播動態に関する重要な情報も提供し、介入（標的を絞ったワクチン戦略を含む）の戦略を立て、その潜在的な影響を評価することを可能にします。 さらに、結核負担の高い国からの結核感染に関する前向きのデータは存在しない。 生成されたデータは、感染のモデリング、予防研究のサンプルサイズ、および国家結核制御プログラムの影響を評価する監視の両方に情報を提供します。