Leendő háztartási megfigyelési kohorsztanulmány az influenzáról, a légúti szincitiális vírusról és más légúti kórokozók közösségi teherről és átviteli dinamikáról Dél-Afrikában (PHIRST-SA)

Háttér: Az influenza közösségi terhére vonatkozó információk elengedhetetlenek a védekezéshez, de nem gyűjtik őket rutinszerűen. Például az influenza átviteli modelljei, amelyeket széles körben használnak a vakcinák, vírusellenes szerek és nem gyógyszerészeti ellenintézkedések hatékonyságának és költséghatékonyságának tájékoztatására, a közösségben előforduló betegségek és a betegségek terjedésének érvényes epidemiológiai becsléseitől függenek. Míg az elmúlt években közösségi szintű tanulmányokat, például az Egyesült Királyságban végzett Flu Watch kohorszvizsgálatot hajtottak végre a magas jövedelmű országokban, az influenza okozta közösségi teher továbbra is nagyrészt ismeretlen az alacsonyabb és közepes jövedelmű országokban, különösen Afrikában, ahol a teher influenza esetén magasabb lehet. Ezenkívül nem állnak rendelkezésre adatok az influenzavírusok háztartási terjedési dinamikájáról. Az ilyen adatok fontos betekintést nyújthatnak a célzott beavatkozásokhoz, például arra, hogyan lehet maximalizálni az influenza elleni védőoltás közvetett hatásait, hogy megvédjék azokat a veszélyeztetettebb csoportokat, amelyek számára a rendelkezésre álló influenza elleni védőoltások jelenleg nem engedélyezettek, vagy a hatékonyságuk alacsony (pl. 2 évesnél fiatalabb gyermekek).

A humán légúti szincitiális vírus (RSV) a gyermekkori akut alsó légúti fertőzések fő oka, különösen a 3 hónaposnál fiatalabb csecsemőknél. Bár jelenleg nem áll rendelkezésre RSV-oltás, az ígéretes RSV-vakcinák hatékonyságát jelenleg értékelik. Alternatív stratégiákat javasoltak az RSV elleni oltásra, beleértve az idősebb korcsoportok vakcinázását a sérülékeny csecsemők közvetett védelmére azáltal, hogy csökkentik a vírus cirkulációját a populációban, vagy megakadályozzák a csecsemőbe való átviteli láncot. Mindazonáltal e hatások értékeléséhez ismerni kell az RSV-terhelést, az átviteli dinamikát és a csecsemők fertőzési forrását a közösségben.

A pneumococcus a tüdőgyulladás vezető bakteriális okozója. A pneumoccus konjugált vakcina (PCV) 2009-ben került be a kibővített immunizálási programba. A hordozás prevalenciájára, a hordozás dinamikájára és az egyéb légúti kórokozókkal való interakciókra vonatkozó adatok hasznosak lehetnek a vakcinázással meg nem előzhető pneumococcus-betegség célzott beavatkozásaiban. Az elmúlt években a diftériát és a pertussist is új kórokozóként azonosították Dél-Afrikában, amelyek 2014-ben és 2015-ben járványkitöréseket okoztak az alacsony prevalenciájú évek után. A meningococcus egy járványra hajlamos betegség, amely ciklikus járványkitöréseket okoz Dél-Afrikában, de keveset tudunk a dél-afrikai hordozók előfordulásáról. A tuberkulózis éves incidenciája Dél-Afrikában a legmagasabb globálisan, Szváziföldön, Lesotho-ban és Dél-Afrikában a legmagasabb a tuberkulózis aránya a világon. Ezen túlmenően Dél-Afrikában a tuberkulózis a vezető halálokok a haláleset-bejelentő űrlapokon, és a HIV-fertőzött egyéneknél (mindegyik még nem részesült antiretrovirális szerekben, mind pedig miközben antiretrovirális szereket szed) a vezető súlyos opportunista fertőzés.

Ezeknek a kórokozóknak a hordozási gyakoriságára és/vagy átviteli dinamikájára vonatkozó adatok fontosak a védekezési intézkedések irányításához, beleértve a célzott vakcinázási stratégiákat. Gyakran javasolják a megelőzésre irányuló erőfeszítéseket a háztartásokban történő terjedés korlátozására, de a háztartási átvitelre és a HIV-fertőzés hatásaira vonatkozó adatok egyelőre korlátozottak.

Célok Elsődleges

• Az influenza és az RSV okozta közösségi terhek becslése, beleértve: (i) az influenza és az RSV fertőzés előfordulását a közösségben; (ii) az influenzával és az RSV-fertőzéssel kapcsolatos tünetekkel járó frakció; iii. a tünetekkel járó fertőzésekkel kapcsolatos súlyosság; és (iv) a tünetekkel járó fertőzésben szenvedő egyének azon része, akik orvosi ellátást kérnek.
• Az influenza és az RSV fertőzések közösségen belüli terjedési dinamikájának felmérése, beleértve: (i) a háztartási másodlagos fertőzési kockázat (SIR), a sorozatos intervallum és a terjedés hosszának becslését; ii. a fertőzés korcsoportok közötti terjedésének becslése a háztartáson belül és adott esetben a közösségen belül; és (iii) az effektív szaporodási szám (Rt) becslése és annak időbeli változása a közösségben.

Másodlagos (kiválasztva)

• A tüneti hányad, a tünetekkel járó fertőzésekkel összefüggő súlyosság, valamint az influenza- vagy RSV-pozitív esetek között az orvosi ellátást igénylő, tüneti fertőzésben szenvedők arányának becslése HIV-szerosztátus és életkor szerint.
• Megbecsülni az influenza és az RSV terjedésének SIR-jét és hosszát a HIV-fertőzött és HIV-fertőzetlen indexes esetek között, valamint az influenza és RSV fertőzés megszerzésének arányát a HIV-fertőzött és HIV-fertőzetlen háztartástagok körében.
• Felmérni a tünetmentes fertőzések szerepét az influenza és az RSV háztartási terjedésében.
• Határozza meg az influenza és az RSV vírustörzsek heterogenitását a háztartási klasztereken belül, és írja le a vírus evolúcióját a háztartásokon belül és azok között, valamint a vírustörzsek és a vírus terjedésének időtartama és a HIV státusz közötti összefüggést
• Leírni és összehasonlítani a nasopharyngealis pneumococcus terhelést egészséges egyénekben életkor és idő szerint, valamint azt, hogy a terhelést hogyan változtathatja meg a légúti vírusfertőzés, a HIV-státusz és az oltási állapot
• A B. pertussis megtelepedésének prevalenciájának és időtartamának meghatározása a közösségen belül korcsoportonként, a vakcina státusza és az idő múlásával, a háztartáson belüli átviteli dinamika, valamint a tüneti fertőzésben szenvedők aránya
• Meghatározni a N. meningitidis és a C. diphtheria közösségen belüli előfordulását korcsoportonként, minden évben egyetlen időpontban
• A vizsgálati háztartásokban élő egyének tuberkulózisfertőzésének éves előfordulási gyakoriságának mérése, valamint a tuberkulózis fertőzés megszerzésének kockázati tényezőinek (beleértve az incidenst és a prevalencia HIV-fertőzést) felmérése.
• A lakásminőség, az üzemanyag-felhasználás és a beltéri levegő minősége, valamint a szellőztetés kiválasztott intézkedéseinek a tuberkulózisfertőzésre, valamint a légúti vírusok és baktériumok háztartási átvitelére gyakorolt ​​hatásának megállapítása Módszerek: Háztartási szintű közösségi kohorsz vizsgálatot végzünk Mpumalanga tartomány vidéki közösségében. ahol egészségügyi és demográfiai felügyeletet (HDSS) végeznek (az Agincourt HDSS megfigyelőhely), valamint kiválasztott városi területeken az északnyugati tartomány Matlosana településén. Az influenzával és az RSV-vel összefüggő súlyos akut légúti megbetegedések prospektív, kórházi felügyeletét ezeken a helyeken 2010 óta végzik. A prospektív kohorszvizsgálatot 3 egymást követő évben, 2016 és 2018 között végzik, és 3 egymást követő RSV- és influenza-szezont is magában foglal. A vizsgált populációból évente körülbelül száz háztartást (telephelyenként 50 háztartás várható átlagosan 5 fő háztartási taglétszámmal) véletlenszerűen választanak ki a vizsgált populációból, és hozzájárulnak a vizsgálatban való részvételhez. A szérumot minden háztartástag esetében negyedévente (január-február, április-május, szeptember-október és november-december) gyűjtik, beleértve az RSV (februártól májusig) és influenza (májustól szeptemberig) szezon előtt és után, valamint egy utolsó vért. sorsolás az év végén. A beiratkozáskor összegyűjtjük a háztartás tagjainak demográfiai jellemzőit. Az RSV és az influenza szezon előtt a felső légúti mintákat hetente kétszer gyűjtik a felső légúti mintákat képzett vizsgálati nővérek minden háztartástagtól, függetlenül attól, hogy egész évben fennállnak-e légúti tünetek. Minden egyes látogatás során rögzítésre kerül a tünetek alakulása (súlyossági pontszám segítségével) és a tünetekkel járó esetek egészségügyi ellátást igénylő magatartása. Ezen túlmenően, télen egy háztartási látogatás alkalmával minden egyéntől szájgarat-tamponot vesznek meningococcus és diftéria vizsgálata céljából. A nasopharyngealis mintákat valós idejű reverz transzkriptáz polimeráz láncreakcióval (rt-PCR) vizsgálják az RSV vagy influenza vírus és a pneumococcus, valamint a B. pertussis fertőzés kimutatására. A vérmintákat megvizsgálják az RSV, az influenza és a pertussis antitest-titerek emelkedésére. A beleegyező betegek vérmintáját HIV-fertőzés szempontjából vizsgálják. Tuberculosis fertőzés esetén tuberkulin bőrtesztet (TST) végzünk a kiinduláskor és az első év végén, majd ezt követően évente azoknál az embereknél, akiknél az előző teszt TST-negatívnak bizonyult. A HIV-tesztet minden résztvevőnek felajánlják a kiinduláskor, majd hathavonta. Minden résztvevőtől köpetmintát vesznek tenyésztéshez a kiinduláskor, majd ezt követően havonta megvizsgálják a tüneteket a tuberkulózis tüneteire, és Xpert Mtuberculosis/Rif-fel vizsgálják, ha tuberkulózis tünetei vannak.

A körülbelül 1500 egyedből álló mintanagyság 3 egymást követő szezonban lehetővé teszi a fertőzés kockázatának 20%-os és a betegség 10%-os kockázatának becslését 95%-os CI-vel és 5%-os kívánt abszolút pontossággal a közösségben. A vizsgálat első és második évében beiratkozott háztartásokba tartozó egyének a vizsgálat 2. és 3. évének vége felé (októberben) egyszeri utóellenőrzési látogatáson vesznek részt. Ezen a látogatáson vérmintát vesznek a HIV-fertőzés, az influenza és az RSV szerológiai vizsgálatához, és TST-tesztet végeznek azon egyének esetében, akik az előző vizsgálat során TST-negatívnak bizonyultak.

Hatás: Ez a tanulmány javítani fogja az influenza, az RSV, a pertussis, a tuberkulózis és a pneumococcus fertőzés által okozott közösségi terhek megértését Dél-Afrikában. Ezenkívül adatokat szolgáltat a meningococcus és a diftéria hordozási gyakoriságáról. Az ebből a tanulmányból származó adatok fontos információkkal szolgálnak az influenza, az RSV, a pertussis és a pneumococcus közösségben való átviteli dinamikájáról is, lehetővé téve a beavatkozások (beleértve a célzott oltási stratégiákat) jobb stratégiáját és azok lehetséges hatásának értékelését. Ezen túlmenően hiányoznak a magas tuberkulózisterheket sújtó országokból származó tuberkulózis-fertőzéssel kapcsolatos prospektív adatok. A keletkezett adatok egyaránt szolgálnak majd a terjedés modellezéséhez, a prevenciós vizsgálatokhoz szükséges mintanagysághoz és a Nemzeti Tuberkulózis Ellenőrzési Program hatásának felméréséhez.