C. Difficileおよび/または潰瘍性大腸炎または不定性大腸炎に対する糞便微生物移植 (FMT)
薬剤不応性クロストリジウム・ディフィシルおよび/または潰瘍性大腸炎または不定性大腸炎患者における糞便微生物移植
調査の概要
詳細な説明
この研究では、次の仮説を検証します。
- 糞便微生物叢移植は、C. difficile 患者にとって安全で、忍容性があり、有効な手順であり、潰瘍性大腸炎および不定性大腸炎の患者にとって安全で忍容性のある手順です。
- 糞便移植後の糞便レシピエントの糞便微生物の多様性、組成および機能は、ドナーの糞便に見られるのと同様の微生物の多様性、組成および機能に変化する。
主な目的:
1. 再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび薬剤難治性の潰瘍性大腸炎または不確定性大腸炎の患者における、移植後 12 週間までの糞便微生物叢移植の短期的な安全性と忍容性を判断すること。
副次的な目的:
1a. 再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび薬剤難治性の潰瘍性大腸炎または不確定性大腸炎の患者における、移植後1年までの糞便微生物叢移植の長期的な安全性と忍容性を判断すること。
1b. 1年以内にC. difficileの再発がないと定義された再発性または難治性のClostridium difficile患者における糞便微生物叢移植の有効性を判断すること。
2. 再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび薬剤難治性潰瘍性大腸炎または不定性大腸炎の患者 (レシピエント) から採取した FMT 前のレシピエント便と比較して、健康なドナー便の微生物多様性を比較する。
3. 再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび薬剤難治性潰瘍性大腸炎または不確定性大腸炎の患者 (レシピエント) からの FMT 前のレシピエント便と比較して、健康なドナー便の微生物組成を比較する。
4. 再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび薬剤難治性潰瘍性大腸炎または不定性大腸炎の患者 (レシピエント) からの FMT 前のレシピエント便と比較して、健康なドナー便の微生物機能を比較する。
5. 健康なドナーの便と FMT 前のレシピエントの便の微生物の多様性を、再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび薬剤不応性潰瘍性大腸炎または不定性大腸炎の患者 (レシピエント) から採取した移植後 1 週間のレシピエントの便サンプルと比較する。
6. 健康なドナー便および FMT 前のレシピエント便中の微生物組成を、再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび薬剤難治性潰瘍性大腸炎または不定性大腸炎の患者 (レシピエント) から採取した移植後 1 週間のレシピエント便サンプルと比較する。
7. 健康なドナーの便と FMT 前のレシピエントの便の微生物機能を、再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび薬剤不応性潰瘍性大腸炎または不定性大腸炎の患者 (レシピエント) から採取した移植後 1 週間のレシピエントの便サンプルと比較する。
8. 健康なドナーの便および FMT 前のレシピエントの便における微生物の多様性を、再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび薬剤難治性の潰瘍性大腸炎または不定性大腸炎の患者 (レシピエント) から採取した移植後 12 週間のレシピエント便サンプルと比較する。
9. 健康なドナー便およびFMT前のレシピエント便中の微生物組成を、再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび投薬不応性潰瘍性大腸炎または不定性大腸炎の患者（レシピエント）から採取した移植後12週間のレシピエント便サンプルと比較する。
10. 健康なドナーの便と FMT 前のレシピエント便の微生物機能を、再発性または難治性のクロストリジウム・ディフィシルおよび薬剤難治性の潰瘍性大腸炎または不定性大腸炎の患者 (レシピエント) から採取した移植後 12 週間のレシピエント便サンプルと比較する。
11. FMT が統計的に有意な変化を引き起こすかどうかを判断するために、ベースライン前 FMT、FMT 後 1 週間および 12 週間でレシピエントの便カルプロテクチンレベルを測定します。
研究の種類
入学 (実際)
段階
- 初期フェーズ 1
連絡先と場所
研究場所
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New York
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Stony Brook、New York、アメリカ、11794
- Stony Brook University Hospital
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
説明
クロストリジウム・ディフィシル患者/レシピエントのみ:
含まれるもの:
1.患者は7歳以上です。 2. 次のいずれか: 2a. メトロニダゾール、バンコマイシンまたはフィダキソマイシンによる標準的な医学療法を完了した後、陽性毒素PCRまたはEIAによって診断された、軽度から中等度のC.ディフィシル（下痢便6回/日未満）の少なくとも2回の再発（合計3回のCDI感染）。
2b. -重度のC.ディフィシル感染症の少なくとも2つのエピソード（入院を必要とし、重大な罹患率に関連する> 6便/日）。
2c。中等度の C. difficile 感染症 (1 日 3 ～ 6 回の下痢便で、継続的な標準治療に反応しない。 メトロニダゾール、バンコマイシンおよび/またはフィダキソマイシン）を少なくとも28日間持続させる。
2d。 -重度および/または劇症の C. difficile 大腸炎 (> 6 回の下痢便/日) で、48 時間後に標準治療に反応しない。
除外：
- 7歳未満
- -今後12週間以内に腹部手術が予定されています
- 過去3か月以内に腹部の大手術を受けた
- 妊娠
- ヘモグロビン < 6 g/dL
- 絶対好中球数が1500/mm3未満
- 移植片対宿主病の既知の診断
- 過去2か月以内に治験薬を使用した
- 過去2週間以内にTNFαアゴニストを使用した
- 過去4週間以内に菌血症と診断された
潰瘍性および不確定な大腸炎の患者のみ：
含まれるもの:
- 患者は7歳以上です。
- 次のいずれかです。
2a.少なくとも1か月間ステロイド治療を受けています。 2b. 少なくとも 1 か月間免疫調節療法で治療されている 2c. 生物学的療法で少なくとも 1 か月間治療を受けている。
除外：
- 7歳未満
- -今後12週間以内に腹部手術が予定されています
- 過去3か月以内に腹部の大手術を受けた
- 妊娠
- ヘモグロビン < 6 g/dL
- 絶対好中球数が1500/mm3未満
- 移植片対宿主病の既知の診断
- 過去2か月以内に治験薬を使用した
- 過去2週間以内にTNFαアゴニストを使用した
- 過去4週間以内に菌血症と診断された
- 以前のFMT
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 主な目的：処理
- 割り当て：なし
- 介入モデル：単一グループの割り当て
- マスキング：なし（オープンラベル）
武器と介入
参加者グループ / アーム |
介入・治療 |
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実験的：糞便微生物移植
糞便微生物移植で治療
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糞便微生物移植は、適格な患者への治療オプションとして提供されます。 患者によって選択されたドナーは、潜在的な伝染性病原体について質問票と血液および便検査によってスクリーニングされます。 便濾液は、大腸内視鏡検査によって回腸および/または盲腸に投与されます
他の名前：
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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CTCAE v4.0 によって評価された、治療関連の有害事象のある参加者の数
時間枠：9年
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FMT後1年以内にグレード2を超える治療関連の有害事象が発生した参加者の数が報告されます。 安全性は、移植後に新たな病状がないという報告として評価されます。移植後に深刻な有害事象がないという報告によって記録される忍容性と、処置の有効性は、移植後の臨床的に必要な大腸内視鏡検査中の臨床症状の改善として記録されます。移植前と比較した移植 C. diff 患者は、移植後のアウトカム指標として、C. diff テストの結果が陰性であると報告されます。 |
9年
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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FMT前、FMT後1週間、FMT後12週間のレシピエント便と比較して、健康なドナー便の微生物多様性に対する糞便微生物移植の効果を測定する。
時間枠：10年
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糞便 DNA サンプルは、V3-V4 16S rRNA シーケンスを受けます。
操作上の分類単位 (OTU) は、同一の分類学的割り当てを持つ配列をクラスター化することによって生成されます。
アルファ多様性指数 (例:
Chao1、Shannon complex H、Shannon Evenness H/Hmax) は、Explicet を使用して 1000 回の反復リサンプリングを通じて推測されて計算されます。
ベータ多様性 (Bray-Curtis 距離と Jaccard 距離) は、門の R ビーガン パッケージのアドニス関数を使用して、対となるドナーと比較して、受信者の Pre-FMT、FMT の 1 週間後、および FMT の 12 週間後に計算されます。家族と属のレベル。
線形混合モデルを使用して、各時点 (FMT) と各疾患グループ (グループ) の間でアルファ多様性 (ShannonH) とベータ多様性 (Bray-Curtis および Jaccard 距離) を比較します。
0.05 未満の P 値は、統計的に有意であると見なされました。
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10年
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FMT前、FMT後1週間、FMT後12週間のレシピエント便と比較して、健康なドナー便の微生物組成に対する糞便微生物移植の効果を測定する。
時間枠：10年
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糞便 DNA サンプルは、V3-V4 16S rRNA シーケンスを受けます。
操作上の分類単位 (OTU) は、同一の分類学的割り当てを持つ配列をクラスター化することによって生成されます。
属レベルでの個々の OTU の線形混合モデル分析は、ドナーとレシピエントの FMT 前のサンプルで平均相対存在量が 0.001% 未満の OTU を除外した後、105 個の OTU で実施されます。サンプルのカウントはゼロでした。
FMTの前後の時点で各OTUの相対的存在量を比較するには[移植前のレシピエント、1週間。
FMT 後の受信者、3 か月。
ポスト FMT 受信者] および各疾患グループ、一般化線形混合モデル (GLMM) または一般化推定方程式 (GEE) は、負の二項分布に従うと仮定された結果として各 OTU の実際のカウントを取得することによって使用されます。
p 値は、ボンフェローニ補正またはベンジャミン-ホッホベルグ法 (FDR < 0.05) による多重比較用に調整されます。
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10年
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FMT前、FMT後1週間、FMT後12週間のレシピエント便と比較して、健康なドナー便のショットガンDNAメタゲノムを使用して、微生物機能に対する糞便微生物移植の効果を測定する。
時間枠：10年
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糞便 DNA サンプルは、ショットガン DNA メタゲノミクス シーケンシングを受けます。
ヒト配列を除去した後、個々の細菌タンパク質/酵素および経路について、HUMANN2 ソフトウェアを使用してキロベース遺伝子長あたりの読み取り数 (RKP) を計算します。 .
線形混合モデルを使用して、各時点 (FMT) と各疾患グループ (グループ) の間で経路および個々のタンパク質に関連する RPK を比較します。
0.05 未満の P 値は、統計的に有意であると見なされました。個々の遺伝子および経路に関連する RPK の線形混合モデル分析は、FMT の前後の時点間で線形混合モデルを使用して分析されます [移植前のレシピエント、1 週間。
FMT 後の受信者、3 か月。
ポスト FMT 受信者] および各疾患グループ、一般化線形混合モデル (GLMM) または一般化推定方程式 (GEE) は、負の二項分布に従うと想定される結果として実際の RPK を取ることによって使用されました。
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10年
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細菌のメタトランスクリプトーム配列決定を使用して、微生物機能に対する糞便微生物移植の効果を測定する
時間枠：10年
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糞便 RNA サンプルは、細菌のメタトランスクリプトーム RNA シーケンシングを受けます。
ヒト配列を除去した後、個々の細菌タンパク質/酵素および経路について、キロベース転写物あたりの読み取り数 (RKP) が計算されます。
線形混合モデルを使用して、各時点 (FMT) と各疾患グループ (グループ) の間で経路および個々のタンパク質に関連する RPK を比較します。
0.05 未満の P 値は、統計的に有意であると見なされました。
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10年
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標的メタボロミクスアッセイを使用して、微生物機能に対する糞便微生物移植の効果を測定する。
時間枠：10年
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糞便サンプルは、ガスクロマトグラフィー質量分析法を使用した短鎖脂肪酸 (マイクログラム/グラム便) および液体クロマトグラフィー質量分析法を使用した胆汁酸 (マイクログラム/グラム便) のターゲットメタボロミクス分析のために抽出されます。
線形混合モデルを使用して、各時点 (FMT) と各疾患グループ (グループ) の間でそれぞれ短鎖脂肪酸および胆汁酸代謝物を比較します。
0.05 未満の P 値は、統計的に有意であると見なされました。
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10年
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FMT がレシピエントの糞便カルプロテクチン レベルに統計的に有意な変化を引き起こすかどうかを判断する
時間枠：10年
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糞便カルプロテクチン（マイクログラム/グラム便）レベルは、FMT前のベースライン、FMT後1週間、および12週間でレシピエントと同様に測定されます。
線形混合モデルを使用して、各時点 (FMT) と各疾患グループ (グループ) の間で糞便カルプロテクチン レベルを比較します。
0.05 未満の P 値は、統計的に有意であると見なされました。
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10年
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糞便微生物移植後 1 年以内に C. difficile を再発した C. difficile レシピエントの数を決定する
時間枠：10年
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現在、大腸内視鏡検査 FMT の有効性は、12 週間後に約 90% です。
ただし、炎症性腸疾患を併発している患者では、それが低くなる場合があります。
我々は、炎症性腸疾患を伴わないC.ディフィシル、クローン病を伴うC.ディフィシル、および潰瘍性または不定性大腸炎を伴うC.ディフィシルの患者における、C.ディフィシルの再発に対する糞便微生物移植の有効性を1年以内に定量化する。
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10年
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協力者と研究者
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捜査官
- 主任研究者：Anupama Chawla, MD、Stony Brook Medicine
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