艰难梭菌和/或溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎的粪便微生物移植 (FMT)
难治性艰难梭菌和/或溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎患者的粪便微生物移植
研究概览
详细说明
本研究将检验以下假设:
- 粪便微生物群移植对于艰难梭菌患者是一种安全、可耐受且有效的手术,对于溃疡性结肠炎和不确定的结肠炎患者也是一种安全且可耐受的手术。
- 粪便移植后粪便受体的粪便微生物多样性、组成和功能将变为与供体粪便中相似的微生物多样性、组成和功能。
主要目标:
1. 确定粪便微生物群移植对复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或移植后 12 周不确定性结肠炎患者的短期安全性和耐受性。
次要目标:
1a. 确定粪便微生物群移植对复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎患者移植后长达 1 年的长期安全性和耐受性。
1b. 确定粪便微生物群移植对复发性或难治性艰难梭菌患者的疗效,该艰难梭菌定义为一年内艰难梭菌未复发。
2. 将健康供体粪便中的微生物多样性与从患有复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎的患者(接受者)收集的 FMT 前接受者粪便进行比较。
3. 将健康供体粪便中的微生物组成与患有复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎的患者(接受者)的 FMT 前接受者粪便进行比较。
4. 将健康供体粪便中的微生物功能与患有复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎的患者(接受者)的 FMT 前接受者粪便进行比较。
5. 比较健康供体粪便和 FMT 前受体粪便与移植后 1 周从患有复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎的患者(受体)收集的粪便样本中的微生物多样性。
6. 比较健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便中的微生物组成与移植后 1 周收集自患有复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎的患者(接受者)的粪便样本。
7. 将健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便中的微生物功能与从患有复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎的患者(接受者)收集的移植后 1 周接受者粪便样本进行比较。
8. 比较健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便与从患有复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎的患者(接受者)收集的 12 周移植后接受者粪便样本中的微生物多样性。
9. 将健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便中的微生物组成与从患有复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎的患者(接受者)收集的 12 周移植后接受者粪便样本进行比较。
10. 比较健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便中的微生物功能,以及从患有复发性或难治性艰难梭菌和药物难治性溃疡性结肠炎或不确定性结肠炎的患者(接受者)收集的 12 周移植后接受者粪便样本。
11. 将在 FMT 前、FMT 后 1 周和 12 周的基线时测量接受者的粪便钙卫蛋白水平,以确定 FMT 是否会导致统计学上的显着变化。
研究类型
注册 (实际的)
阶段
- 第一阶段早期
联系人和位置
学习地点
-
-
New York
-
Stony Brook、New York、美国、11794
- Stony Brook University Hospital
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-
参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
描述
仅限艰难梭菌患者/接受者:
包含:
1. 患者年满 7 岁。 2. 以下之一: 2a. 在完成甲硝唑、万古霉素或非达霉素的标准药物治疗后,通过阳性毒素 PCR 或 EIA 诊断出至少两次轻度至中度艰难梭菌复发(总共 3 次 CDI 感染)(<6 次腹泻/天)。
2b. 至少两次严重的艰难梭菌感染(>6 次腹泻/天需要住院治疗并伴有显着的发病率)。
2c.中度艰难梭菌感染(3-6 次腹泻/天对连续标准治疗无反应,例如 甲硝唑、万古霉素和/或非达霉素)持续至少 28 天。
2d。 48 小时后对标准治疗无反应的严重和/或暴发性艰难梭菌结肠炎(> 6 次腹泻/天)。
排除:
- 7岁以下
- 计划在未来 12 周内进行腹部手术
- 在过去 3 个月内进行过腹部大手术
- 怀孕
- 血红蛋白 < 6 克/分升
- 中性粒细胞绝对计数小于 1500/mm3
- 已知的移植物抗宿主病诊断
- 在过去 2 个月内使用过研究药物
- 在过去 2 周内使用过 TNFα 激动剂
- 在过去 4 周内被诊断出患有菌血症
仅适用于溃疡性和不确定性结肠炎患者:
包含:
- 患者年满 7 岁。
- 以下之一:
2a.接受类固醇治疗至少 1 个月。 2b. 接受免疫调节治疗至少 1 个月 2c。 接受生物疗法治疗至少一个月。
排除:
- 7岁以下
- 计划在未来 12 周内进行腹部手术
- 在过去 3 个月内进行过腹部大手术
- 怀孕
- 血红蛋白 < 6 克/分升
- 中性粒细胞绝对计数小于 1500/mm3
- 已知的移植物抗宿主病诊断
- 在过去 2 个月内使用过研究药物
- 在过去 2 周内使用过 TNFα 激动剂
- 在过去 4 周内被诊断出患有菌血症
- 以前的裂变材料
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
- 主要用途:治疗
- 分配:不适用
- 介入模型:单组作业
- 屏蔽:无(打开标签)
武器和干预
参与者组/臂 |
干预/治疗 |
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实验性的:粪便微生物移植
粪便微生物移植治疗
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粪便微生物移植可作为符合条件的患者的治疗选择。 患者选择的供体将通过问卷调查以及血液和粪便检测潜在的传染性病原体进行筛查。 粪便滤液将通过结肠镜检查在回肠和/或盲肠中给药
其他名称:
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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根据 CTCAE v4.0 评估的发生治疗相关不良事件的参与者人数
大体时间:9年
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将报告 FMT 后一年内发生大于 2 级的治疗相关不良事件的参与者人数。 安全性将被评估为移植后没有新的医疗状况的报告,耐受性将被记录为移植后没有严重不良事件的报告,并且程序的有效性将被记录为移植后任何有临床指征的结肠镜检查期间临床症状的改善移植与移植前相比 C. Diff 患者在移植后会有阴性 C. diff 测试报告作为结果测量。 |
9年
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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与 FMT 前、FMT 后 1 周和 FMT 后 12 周受体粪便相比,测量粪便微生物移植对健康供体粪便微生物多样性的影响。
大体时间:10年
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粪便 DNA 样本将进行 V3-V4 16S rRNA 测序。
操作分类单元 (OTU) 将通过具有相同分类分配的聚类序列产生。
Alpha 多样性指数(例如
Chao1、Shannon 复杂度 H、Shannon 均匀度 H/Hmax) 将使用 Explicet 通过 1000 次重复重采样推断得出。
Beta 多样性(Bray-Curtis 和 Jaccard 距离)将计算接受者在 FMT 前、FMT 后 1 周和 FMT 后 12 周,与他们使用门的 R vegan 包中的 adonis 函数进行比较的捐助者相比,科和属的水平。
将使用线性混合模型来比较每个时间点(FMT)和每个疾病组(Group)之间的α多样性(ShannonH)和β多样性(Bray-Curtis和Jaccard距离)。
小于 0.05 的 P 值被认为具有统计学意义。
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10年
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与 FMT 前、FMT 后 1 周和 FMT 后 12 周受体粪便相比,测量粪便微生物移植对健康供体粪便中微生物组成的影响。
大体时间:10年
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粪便 DNA 样本将进行 V3-V4 16S rRNA 测序。
操作分类单元 (OTU) 将通过具有相同分类分配的聚类序列产生。
在剔除供体和受体前FMT样本中平均相对丰度<0.001%的OTU,并丢弃超过75%的OTU后,将对105个OTU进行属水平个体OTU的线性混合模型分析。样品计数为零。
比较 FMT 前后时间点之间每个 OTU 的相对丰度 [移植前接受者,1-wk。
FMT 后接受者,3 个月。
FMT后接受者]和每个疾病组,将使用广义线性混合模型(GLMM)或广义估计方程(GEE),将每个OTU的实际计数作为假定服从负二项分布的结果。
将通过 Bonferroni 校正或 Benjamin-Hochberg 方法(FDR < 0.05)针对多重比较调整 p 值。
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10年
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与 FMT 前、FMT 后 1 周和 FMT 后 12 周的受体粪便相比,使用鸟枪法 DNA 宏基因组测量粪便微生物移植对健康供体粪便中微生物功能的影响。
大体时间:10年
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粪便 DNA 样本将进行鸟枪法 DNA 宏基因组测序。
去除人类序列后,将使用 HUMANN2 软件计算单个细菌蛋白质/酶和途径的每千碱基基因长度读数 (RKP)。 .
将使用线性混合模型来比较每个时间点(FMT)和每个疾病组(Group)之间与通路和单个蛋白质相关的RPK。
小于 0.05 的 P 值被认为具有统计学意义。将使用 FMT 前后时间点之间的线性混合模型分析与个体基因和途径相关的 RPK 的线性混合模型分析 [移植前接受者,1 周。
FMT 后接受者,3 个月。
FMT 后接受者]和每个疾病组,使用广义线性混合模型(GLMM)或广义估计方程(GEE),将实际 RPK 作为假设服从负二项分布的结果。
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10年
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使用细菌元转录组测序测量粪便微生物移植对微生物功能的影响
大体时间:10年
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粪便 RNA 样本将进行细菌宏转录组 RNA 测序。
去除人类序列后,将计算单个细菌蛋白质/酶和途径的每千碱基转录本读数 (RKP)。
将使用线性混合模型来比较每个时间点(FMT)和每个疾病组(Group)之间与通路和单个蛋白质相关的RPK。
小于 0.05 的 P 值被认为具有统计学意义。
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10年
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使用靶向代谢组学测定法测量粪便微生物移植对微生物功能的影响。
大体时间:10年
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粪便样本将经过提取,使用气相色谱-质谱法对短链脂肪酸(微克/克粪便)进行靶向代谢组学分析,并使用液相色谱-质谱法对胆汁酸(微克/克粪便)进行靶向代谢组学分析。
将使用线性混合模型分别比较每个时间点(FMT)和每个疾病组(Group)之间的短链脂肪酸和胆汁酸代谢物。
小于 0.05 的 P 值被认为具有统计学意义。
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10年
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确定 FMT 是否会导致受体粪便钙卫蛋白水平发生统计学上的显着变化
大体时间:10年
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粪便钙卫蛋白(微克/克粪便)水平将在 FMT 前、1 周和 FMT 后 12 周的基线时在接受者中测量。
将使用线性混合模型来比较每个时间点(FMT)和每个疾病组(Group)之间的粪便钙卫蛋白水平。
小于 0.05 的 P 值被认为具有统计学意义。
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10年
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确定在粪便微生物移植后一年内有复发性艰难梭菌的艰难梭菌接受者的数量
大体时间:10年
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目前结肠镜下 FMT 的疗效在 12 周后约为 90%。
然而,对于同时患有炎症性肠病的患者,它可能会更低。
我们将量化粪便微生物移植对无炎症性肠病的艰难梭菌患者、患有克罗恩病的艰难梭菌患者和患有溃疡性或不确定性结肠炎的艰难梭菌患者一年内复发艰难梭菌的疗效。
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10年
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员:Anupama Chawla, MD、Stony Brook Medicine
出版物和有用的链接
研究记录日期
研究主要日期
学习开始
初级完成 (实际的)
研究完成 (实际的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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粪便微生物移植的临床试验
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