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Transplantation microbienne fécale pour C. difficile et/ou colite ulcéreuse ou colite indéterminée (FMT)

21 février 2022 mis à jour par: Anupama Chawla, Stony Brook University

Transplantation microbienne fécale chez les patients atteints de Clostridium difficile réfractaire aux médicaments et/ou de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée

La transplantation de microbiote fécal sera offerte aux patients éligibles atteints de C. difficile (ne nécessite pas la désignation de nouveau médicament expérimental) et aux patients éligibles atteints de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée en tant que traitement de nouveau médicament expérimental

Aperçu de l'étude

Statut

Complété

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

L'hypothèse suivante sera testée dans cette étude :

  1. La transplantation de microbiote fécal est une procédure sûre, tolérable et efficace pour les patients atteints de C. difficile et est une procédure sûre et tolérable pour les patients atteints de colite ulcéreuse et de colite indéterminée.
  2. La diversité, la composition et la fonction microbiennes fécales chez les receveurs de selles après la transplantation fécale se transformeront en une diversité, une composition et une fonctionnalité microbiennes similaires à celles trouvées dans les selles du donneur.

Objectifs principaux:

1. Déterminer l'innocuité et la tolérabilité à court terme de la transplantation de microbiote fécal chez les patients atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse réfractaire aux médicaments ou de colite indéterminée jusqu'à 12 semaines après la greffe.

Objectifs secondaires :

1a. Déterminer l'innocuité et la tolérabilité à long terme de la greffe de microbiote fécal jusqu'à 1 an après la greffe chez les patients atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée réfractaire aux médicaments.

1b. Déterminer l'efficacité de la transplantation de microbiote fécal chez les patients atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire défini comme l'absence de récidive de C. difficile dans l'année.

2. Comparer la diversité microbienne dans les selles de donneurs sains par rapport aux selles de receveurs pré-FMT recueillies auprès de patients (receveurs) atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée réfractaire aux médicaments.

3. Comparer la composition microbienne des selles de donneurs sains par rapport aux selles de receveurs pré-FMT de patients (receveurs) atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée réfractaire aux médicaments.

4. Comparer la fonction microbienne dans les selles de donneurs sains par rapport aux selles de receveurs pré-FMT de patients (receveurs) atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée réfractaire aux médicaments.

5. Comparer la diversité microbienne dans les selles de donneurs sains et les selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs 1 semaine après la greffe prélevés sur des patients (receveurs) atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée réfractaire aux médicaments.

6. Comparer la composition microbienne des selles de donneurs sains et des selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs 1 semaine après la greffe prélevés sur des patients (receveurs) atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée réfractaire aux médicaments.

7. Comparer la fonction microbienne dans les selles de donneurs sains et les selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs 1 semaine après la greffe prélevés sur des patients (receveurs) atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée réfractaire aux médicaments.

8. Comparer la diversité microbienne dans les selles de donneurs sains et les selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs 12 semaines après la greffe prélevés sur des patients (receveurs) atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée réfractaire aux médicaments.

9. Comparer la composition microbienne des selles de donneurs sains et des selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs 12 semaines après la greffe prélevés sur des patients (receveurs) atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée réfractaire aux médicaments.

dix. Comparer la fonction microbienne dans les selles de donneurs sains et les selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs 12 semaines après la greffe prélevés sur des patients (receveurs) atteints de Clostridium difficile récurrent ou réfractaire et de colite ulcéreuse ou de colite indéterminée réfractaire aux médicaments.

11. Les niveaux de calprotectine dans les selles seront mesurés chez le receveur au départ avant la FMT, 1 semaine et 12 semaines après la FMT pour déterminer si la FMT provoque un changement statistiquement significatif.

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Réel)

12

Phase

  • Première phase 1

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

  • États-Unis
    • New York
      • Stony Brook, New York, États-Unis, 11794
        • Stony Brook University Hospital

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

7 ans et plus (Enfant, Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

La description

Pour les patients/receveurs de C. difficile uniquement :

Inclusion:

1. Le patient est âgé de 7 ans ou plus. 2. L'un des éléments suivants : 2a. Au moins deux récidives (total de trois infections CDI) de C. difficile léger à modéré (<6 selles diarrhéiques/jour) diagnostiquées par PCR ou EIA positive à la toxine après avoir terminé un traitement médical standard avec du métronidazole, de la vancomycine ou de la fidaxomicine.

2b. Au moins deux épisodes d'infection sévère à C. difficile (>6 selles diarrhéiques/jour nécessitant une hospitalisation et associées à une morbidité importante).

2c. Infection modérée à C. difficile (3 à 6 selles diarrhéiques/jour ne répondant pas aux traitements standard successifs, par ex. métronidazole, vancomycine et/ou fidaxomicine) durant au moins 28 jours.

2d. Colite sévère et/ou fulminante à C. difficile (> 6 selles diarrhéiques/jour) sans réponse au traitement standard après 48 heures.

Exclusion:

  1. moins de 7 ans
  2. prévu pour une chirurgie abdominale dans les 12 prochaines semaines
  3. subi une chirurgie abdominale majeure au cours des 3 derniers mois
  4. grossesse
  5. Hémoglobine < 6 g/dL
  6. nombre absolu de neutrophiles inférieur à 1 500/mm3
  7. diagnostic connu de maladie du greffon contre l'hôte
  8. consommé une drogue expérimentale au cours des 2 derniers mois
  9. utilisé un agoniste du TNFα au cours des 2 dernières semaines
  10. diagnostiqué avec une bactériémie au cours des 4 dernières semaines

Pour les patients atteints de colite ulcéreuse et indéterminée uniquement :

Inclusion:

  1. Le patient est âgé de 7 ans ou plus.
  2. L'un des éléments suivants :

2a. traités par corticothérapie pendant au moins un mois. 2b. traité par thérapie immunomodulatrice pendant au moins un mois 2c. traités par thérapie biologique pendant au moins un mois.

Exclusion:

  1. moins de 7 ans
  2. prévu pour une chirurgie abdominale dans les 12 prochaines semaines
  3. subi une chirurgie abdominale majeure au cours des 3 derniers mois
  4. grossesse
  5. Hémoglobine < 6 g/dL
  6. nombre absolu de neutrophiles inférieur à 1 500/mm3
  7. diagnostic connu de maladie du greffon contre l'hôte
  8. consommé une drogue expérimentale au cours des 2 derniers mois
  9. utilisé un agoniste du TNFα au cours des 2 dernières semaines
  10. diagnostiqué avec une bactériémie au cours des 4 dernières semaines
  11. FMT précédent

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: Traitement
  • Répartition: N / A
  • Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
  • Masquage: Aucun (étiquette ouverte)

Armes et Interventions

Groupe de participants / Bras
Intervention / Traitement
Expérimental: Transplantation microbienne fécale
Traité par transplantation microbienne fécale
Biologique: Transplantation microbienne fécale

La greffe microbienne fécale est proposée comme option de traitement aux patients éligibles. Les donneurs sélectionnés par les patients seront sélectionnés par questionnaire et par des analyses de sang et de selles pour détecter d'éventuels agents pathogènes transmissibles.

Le filtrat de selles sera administré dans l'iléon et/ou le caecum par coloscopie

Autres noms:
  • FMT

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Nombre de participants présentant des événements indésirables liés au traitement, évalués par CTCAE v4.0
Délai: 9 années

Le nombre de participants présentant des événements indésirables liés au traitement de grade supérieur à 2 dans l'année suivant la FMT sera signalé.

La sécurité sera évaluée comme un rapport d'absence de nouvelle condition médicale après la greffe, la tolérance, telle qu'enregistrée par le rapport d'aucun événement indésirable grave après la greffe et l'efficacité de la procédure sera enregistrée comme une amélioration des symptômes cliniques lors de toute coloscopie cliniquement indiquée après la greffe par rapport à avant la greffe

Les patients C. Diff auront un rapport de test C. Diff négatif après la greffe comme mesure de résultat.
9 années

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Mesurer l'effet de la transplantation microbienne fécale sur la diversité microbienne dans les selles de donneurs sains par rapport aux selles des receveurs pré-FMT, 1 semaine après FMT et 12 semaines après FMT.
Délai: 10 années
Les échantillons d'ADN fécal subiront un séquençage d'ARNr V3-V4 16S. Les unités taxonomiques opérationnelles (OTU) seront produites en regroupant des séquences avec des affectations taxonomiques identiques. Indices de diversité alpha (par ex. Chao1, la complexité de Shannon H, la régularité de Shannon H/Hmax) seront calculées par 1000 rééchantillonnages répétés à l'aide d'Explicet. La diversité bêta (distances Bray-Curtis et Jaccard) sera calculée pour le receveur pré-FMT, 1 semaine post-FMT et 12 semaines post-FMT par rapport à leur donneur paré en utilisant la fonction adonis dans le paquet végétalien R au phyla, niveau de la famille et du genre. Un modèle mixte linéaire sera utilisé pour comparer la diversité alpha (ShannonH) et la diversité bêta (distance Bray-Curtis et Jaccard) entre chaque point temporel (FMT) et chaque groupe de maladies (Groupe). Les valeurs de p inférieures à 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives.
10 années
Mesurer l'effet de la transplantation microbienne fécale sur la composition microbienne dans les selles de donneurs sains par rapport aux selles des receveurs pré-FMT, 1 semaine après FMT et 12 semaines après FMT.
Délai: 10 années
Les échantillons d'ADN fécal subiront un séquençage d'ARNr V3-V4 16S. Les unités taxonomiques opérationnelles (OTU) seront produites en regroupant des séquences avec des affectations taxonomiques identiques. Des analyses de modèles mixtes linéaires sur des OTU individuelles au niveau du genre seront menées sur 105 OTU après avoir éliminé les OTU avec une abondance relative moyenne < 0,001 % dans les échantillons donneurs et receveurs pré-FMT, et après avoir rejeté les OTU où plus de 75 % des les échantillons avaient un comptage nul. Pour comparer l'abondance relative de chaque OTU entre les points de temps avant et après FMT [receveur pré-transplantation, 1 semaine. receveur post-FMT, 3 mois. receveur post-FMT] et chaque groupe de maladies, un modèle mixte linéaire généralisé (GLMM) ou une équation d'estimation généralisée (GEE) sera utilisé en prenant les décomptes réels de chaque OTU comme les résultats supposés suivre une distribution binomiale négative. Les p-values ​​seront ajustées pour les comparaisons multiples par la correction de Bonferroni ou par la méthode de Benjamin-Hochberg (FDR < 0,05).
10 années
Mesurer l'effet de la transplantation microbienne fécale sur la fonction microbienne à l'aide de l'ADN métagénomique de fusil de chasse dans les selles de donneurs sains par rapport aux selles des receveurs pré-FMT, 1 semaine après FMT et 12 semaines après FMT.
Délai: 10 années
Les échantillons d'ADN fécal subiront un séquençage métagénomique de l'ADN shotgun. Après avoir retiré les séquences humaines, les lectures par longueur de gène kilobase (RKP) seront calculées à l'aide du logiciel HUMANN2 pour les protéines/enzymes et voies bactériennes individuelles. . Un modèle mixte linéaire sera utilisé pour comparer les RPK associées aux voies et aux protéines individuelles entre chaque point temporel (FMT) et chaque groupe de maladies (Groupe). Les valeurs P inférieures à 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives. Les analyses de modèles mixtes linéaires sur le RPK associé à des gènes et voies individuels seront analysées à l'aide de modèles mixtes linéaires entre les points temporels avant et après FMT [receveur pré-greffe, 1 semaine. receveur post-FMT, 3 mois. receveur post-FMT] et chaque groupe de maladies, un modèle mixte linéaire généralisé (GLMM) ou une équation d'estimation généralisée (GEE) ont été utilisés en prenant le RPK réel comme les résultats qui seront supposés suivre une distribution binomiale négative.
10 années
Mesurer l'effet de la transplantation microbienne fécale sur la fonction microbienne à l'aide du séquençage métatranscriptomique bactérien
Délai: 10 années
Des échantillons d'ARN fécaux subiront un séquençage d'ARN métatranscriptomique bactérien. Après avoir retiré les séquences humaines, le transcrit de lectures par kilobase (RKP) sera calculé pour les protéines/enzymes et voies bactériennes individuelles. Un modèle mixte linéaire sera utilisé pour comparer les RPK associées aux voies et aux protéines individuelles entre chaque point temporel (FMT) et chaque groupe de maladies (Groupe). Les valeurs de p inférieures à 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives.
10 années
Mesurer l'effet de la transplantation microbienne fécale sur la fonction microbienne à l'aide d'essais métabolomiques ciblés.
Délai: 10 années
Des échantillons fécaux subiront une extraction pour une analyse métabolomique ciblée des acides gras à chaîne courte (microgrammes/gramme de selles) par chromatographie en phase gazeuse-spectrométrie de masse, et des acides biliaires (microgramme/gramme de selles) par chromatographie liquide-spectrométrie de masse. Un modèle mixte linéaire sera utilisé pour comparer respectivement les métabolites des acides gras à chaîne courte et des acides biliaires entre chaque point temporel (FMT) et chaque groupe de maladies (Groupe). Les valeurs de p inférieures à 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives.
10 années
Déterminer si la FMT entraîne un changement statistiquement significatif des niveaux de calprotectine fécale du receveur
Délai: 10 années
Les niveaux de calprotectine fécale (microgramme/gramme de selles) seront mesurés comme chez le receveur au départ avant la FMT, 1 semaine et 12 semaines après la FMT. Un modèle mixte linéaire sera utilisé pour comparer les niveaux de calprotectine fécale entre chaque point temporel (FMT) et chaque groupe de maladies (Groupe). Les valeurs de p inférieures à 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives.
10 années
Déterminer le nombre de receveurs de C. difficile qui présentent une récidive de C. difficile dans l'année suivant la greffe microbienne fécale
Délai: 10 années
Actuellement, l'efficacité de la FMT coloscopique est d'environ 90 % après 12 semaines. Cependant, il peut être plus faible chez les patients qui ont également une maladie inflammatoire de l'intestin. Nous quantifierons l'efficacité de la greffe microbienne fécale sur la récidive de C. difficile dans un délai d'un an chez les patients atteints de C. difficile sans maladies inflammatoires de l'intestin, de C. difficile avec la maladie de Crohn et de C. difficile avec colite ulcéreuse ou indéterminée.
10 années

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Stony Brook University

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Anupama Chawla, MD, Stony Brook Medicine

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude

1 novembre 2013

Achèvement primaire (Réel)

15 février 2022

Achèvement de l'étude (Réel)

15 février 2022

Dates d'inscription aux études

Première soumission

22 mars 2016

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

28 août 2017

Première publication (Réel)

31 août 2017

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

22 février 2022

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

21 février 2022

Dernière vérification

1 février 2022

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • 479696

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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