CtDNA の DNA メチル化変化を利用した HCC スクリーニング
2024年7月2日 更新者：HKGepitherapeutics
循環腫瘍DNA、PBMCおよびT細胞のDNAメチル化に基づく非侵襲的方法による肝細胞癌の検出に関する臨床試験
肝細胞癌 (HCC) は、世界で 5 番目に多い癌です。 特にアジアで流行しており、B型肝炎が流行している地域での発生率が最も高く、因果関係の可能性を示しています。 慢性肝炎患者などの高リスク集団を追跡調査し、慢性肝炎から肝細胞癌への移行を早期に診断すれば、治癒率が向上します。 ほとんどの場合、HCC は発見が遅く、その結果、死亡率と罹患率が増加します。
この研究の目的は、肝細胞癌患者における PBMC および循環腫瘍 DNA のメチル化変化に基づく非侵襲性バイオマーカーを開発およびテストすることです。
調査の概要
研究の種類
観察的
入学 (実際)
403
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究場所
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Dhaka、バングラデシュ
- Infectious Diseases Division
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参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
18年歳以上 (大人、高齢者)
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
サンプリング方法
非確率サンプル
調査対象母集団
HCC の病期分類は、EASL-EORTC 臨床実践ガイドライン: 肝細胞癌の管理に従って診断されます。
患者は、ステージ 0 (1) (n=100)、ステージ A (2) (n=100)、ステージ B (3) (n=100)、およびステージ C+D (4) の 4 つのグループに分けられます。 (n=100)。
対照として、慢性 B 型肝炎 (n=100) を採用し、慢性 B 型肝炎の AASLD 実践ガイドラインを使用して診断を確認します。また、健康な性別と年齢が一致した対照 (n=100) を採用します。
説明
包含基準:
- EASL-EORTCガイドラインによるHCCの確定診断
- AASLD 実践ガイドラインを使用して HepB 患者の B 型肝炎診断を確認。
HCC の除外基準:
- 肝硬変、T細胞および単球の特性を変化させる可能性のあるその他の既知の炎症性疾患（B型またはC型肝炎を除く細菌またはウイルス感染、糖尿病、喘息、自己免疫疾患、活動性甲状腺疾患）
- その他のがん。
HepB の除外基準:
- HCCまたはその他のがんの診断。
健全なコントロールの除外基準:
- HepB および HepC を含む既知の炎症または感染症
- 慢性疾患、
- 癌
- 薬や薬物の使用
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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慢性B型肝炎
このグループにはB型肝炎患者50人が含まれ、診断はAASLD診療ガイドラインに基づいて行われる。
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HCC患者、健康な人、B型肝炎患者からの血液サンプルが収集され、PBMCからDNAが抽出され、循環腫瘍DNAが重亜硫酸塩変換されます。
PBMC DNA からの DNA は、AHNAK-STAP1 遺伝子用に開発されたプライマーを使用して分析されます。
血漿サンプルは、EZ 直接 DNA 抽出および亜硫酸水素塩変換キットに供され、標的領域を増幅するために開発されたプライマーを使用して増幅されます。
DNA はその後の特定のプライマーによる PCR 増幅に使用され、ダブル PCR 手順を使用して配列決定用の PCR アンプリコンが生成されます。
PCR 反応の生成物はインデックス付き MiSeq 次世代シークエンシングの対象となり、これにより DNA メチル化レベルを定量化できるようになります。
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HCC の症例
このグループには、肝細胞癌のステージ 0、ステージ A、ステージ B、ステージ C+D の 350 人が含まれます。 HCC の病期分類は、EASL-EORTC 臨床実践ガイドライン: 肝細胞癌の管理に従って診断されます。 |
HCC患者、健康な人、B型肝炎患者からの血液サンプルが収集され、PBMCからDNAが抽出され、循環腫瘍DNAが重亜硫酸塩変換されます。
PBMC DNA からの DNA は、AHNAK-STAP1 遺伝子用に開発されたプライマーを使用して分析されます。
血漿サンプルは、EZ 直接 DNA 抽出および亜硫酸水素塩変換キットに供され、標的領域を増幅するために開発されたプライマーを使用して増幅されます。
DNA はその後の特定のプライマーによる PCR 増幅に使用され、ダブル PCR 手順を使用して配列決定用の PCR アンプリコンが生成されます。
PCR 反応の生成物はインデックス付き MiSeq 次世代シークエンシングの対象となり、これにより DNA メチル化レベルを定量化できるようになります。
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健康
このグループには、性別と年齢が一致した健康な対照 50 人が含まれます。
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HCC患者、健康な人、B型肝炎患者からの血液サンプルが収集され、PBMCからDNAが抽出され、循環腫瘍DNAが重亜硫酸塩変換されます。
PBMC DNA からの DNA は、AHNAK-STAP1 遺伝子用に開発されたプライマーを使用して分析されます。
血漿サンプルは、EZ 直接 DNA 抽出および亜硫酸水素塩変換キットに供され、標的領域を増幅するために開発されたプライマーを使用して増幅されます。
DNA はその後の特定のプライマーによる PCR 増幅に使用され、ダブル PCR 手順を使用して配列決定用の PCR アンプリコンが生成されます。
PCR 反応の生成物はインデックス付き MiSeq 次世代シークエンシングの対象となり、これにより DNA メチル化レベルを定量化できるようになります。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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M スコアと HCC 確率スコアの計算
時間枠：6ヶ月～1年
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「HCC-detect」（肝細胞癌検出）および「HCC-spec」（肝細胞癌特異性）のメチル化中央値（範囲 0 ～ 100）を正規化しました。
「HCC-detect」は、CHFR、VASH2、CCNJ、および GRID2IP 領域に由来し、HCC を広範囲に識別することを目的としています。
理論上の範囲は -6.6438 ～ 8.6438 で、実測値は -3.541 ～ 7.65 です。スコアが高いほど、HCC の可能性が高いことを示します。
F12 領域に焦点を当てた「HCC-spec」は、理論上の範囲が -3.3219 ～ 6.64385 (実測値 -3.3219 ～ 6.6297) で、HCC を他の 31 の癌および正常細胞と区別します。
スコアが高いほど、HCC 特異性が高いことを意味します。
Prism のロジスティック回帰によってモデル化された両方のスコアは、HCC の可能性を予測し、より高いスコアをより高い HCC の可能性または特異性と関連付けます。
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6ヶ月～1年
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
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捜査官
- 主任研究者：Wasif Ali Khan, PhD、nternational Centre for Diarrhoeal Disease Research
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2018年8月20日
一次修了 (実際)
2020年6月1日
研究の完了 (実際)
2020年11月1日
試験登録日
最初に提出
2018年3月20日
QC基準を満たした最初の提出物
2018年3月28日
最初の投稿 (実際)
2018年3月30日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2024年7月5日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2024年7月2日
最終確認日
2024年7月1日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。