CtDNA의 DNA 메틸화 변화를 이용한 HCC 스크리닝
2024년 7월 2일 업데이트: HKGepitherapeutics
순환종양 DNA, PBMC 및 T 세포의 DNA 메틸화에 기반한 비침습적 방법으로 간세포암종 검출에 대한 임상 시험
간세포 암종(HCC)은 전 세계적으로 다섯 번째로 흔한 암입니다. 특히 아시아에서 많이 발생하며, B형 간염이 유행하는 지역에서 가장 많이 발생하여 인과관계가 있을 수 있습니다. 만성 간염 환자와 같은 고위험군에 대한 후속 조치와 만성 간염에서 HCC로의 전이에 대한 조기 진단은 치료율을 향상시킬 것입니다. 대부분의 경우 HCC는 늦게 발견되어 사망률과 이환율이 증가합니다.
본 연구의 목적은 간세포암종 환자에서 PBMC 및 순환종양 DNA의 메틸화 변화에 기반한 비침습적 바이오마커를 개발하고 시험하는 것이다.
연구 개요
연구 유형
관찰
등록 (실제)
403
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 장소
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Dhaka, 방글라데시
- Infectious Diseases Division
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
18년 이상 (성인, 고령자)
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
아니
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
HCC 병기는 EASL-EORTC 임상 진료 지침: 간세포 암종 관리에 따라 진단됩니다.
환자는 0기(1)(n=100), A기(2)(n=100), B기(3)(n=100) 및 C+D기(4)의 4개 그룹으로 나뉩니다. (n=100).
대조군으로 우리는 만성 B형 간염에 대한 AASLD 진료 지침을 사용하여 진단할 만성 B형 간염(n=100)과 건강한 성별 및 연령 일치 대조군(n=100)을 모집할 것입니다.
설명
포함 기준:
- EASL-EORTC 가이드라인에 따른 간세포암종 진단 확정
- AASLD 진료 지침을 사용하여 HepB 환자에 대한 B형 간염 진단을 확인했습니다.
HCC에 대한 제외 기준:
- 간경변증, T 세포 및 단핵구 특성을 변화시킬 수 있는 기타 알려진 염증성 질환(B형 또는 C형 간염을 제외한 박테리아 또는 바이러스 감염, 당뇨병, 천식, 자가면역 질환, 활동성 갑상선 질환)
- 기타 암.
HepB에 대한 제외 기준:
- HCC 또는 기타 암의 진단.
건강한 통제를 위한 제외 기준:
- HepB 및 HepC를 포함한 모든 알려진 염증성 또는 전염병
- 만성질환,
- 암
- 약물 또는 약물 사용
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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만성 B형 간염
이 그룹에는 B형 간염 피험자가 있는 50명이 포함되며 진단은 AASLD 진료 가이드라인을 기반으로 합니다.
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HCC 환자, 건강한 개인 및 B형 간염 환자의 혈액 샘플을 수집하고 PBMC에서 DNA를 추출하고 순환하는 종양 DNA를 바이설파이트 전환에 적용할 것입니다.
PBMC DNA의 DNA는 AHNAK-STAP1 유전자용으로 개발된 프라이머로 분석됩니다.
혈장 샘플은 EZ 직접 DNA 추출 및 bisulfite 변환 키트를 거치게 되며 대상 영역을 증폭하기 위해 개발된 프라이머로 증폭됩니다.
DNA는 이중 PCR 절차를 사용하여 시퀀싱을 위한 PCR 증폭물을 생성하기 위해 특정 프라이머로 후속 PCR 증폭에 사용될 것입니다.
PCR 반응의 산물은 DNA 메틸화 수준을 정량화할 수 있는 인덱싱된 MiSeq 차세대 시퀀싱을 받게 됩니다.
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HCC 사례
이 그룹에는 간세포 암종의 0기, A기, B기, C+D기의 350명이 포함됩니다. HCC 병기는 EASL-EORTC 임상 진료 지침: 간세포 암종 관리에 따라 진단됩니다. |
HCC 환자, 건강한 개인 및 B형 간염 환자의 혈액 샘플을 수집하고 PBMC에서 DNA를 추출하고 순환하는 종양 DNA를 바이설파이트 전환에 적용할 것입니다.
PBMC DNA의 DNA는 AHNAK-STAP1 유전자용으로 개발된 프라이머로 분석됩니다.
혈장 샘플은 EZ 직접 DNA 추출 및 bisulfite 변환 키트를 거치게 되며 대상 영역을 증폭하기 위해 개발된 프라이머로 증폭됩니다.
DNA는 이중 PCR 절차를 사용하여 시퀀싱을 위한 PCR 증폭물을 생성하기 위해 특정 프라이머로 후속 PCR 증폭에 사용될 것입니다.
PCR 반응의 산물은 DNA 메틸화 수준을 정량화할 수 있는 인덱싱된 MiSeq 차세대 시퀀싱을 받게 됩니다.
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건강한
이 그룹에는 50개의 건강한 성별 및 연령 일치 컨트롤이 포함됩니다.
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HCC 환자, 건강한 개인 및 B형 간염 환자의 혈액 샘플을 수집하고 PBMC에서 DNA를 추출하고 순환하는 종양 DNA를 바이설파이트 전환에 적용할 것입니다.
PBMC DNA의 DNA는 AHNAK-STAP1 유전자용으로 개발된 프라이머로 분석됩니다.
혈장 샘플은 EZ 직접 DNA 추출 및 bisulfite 변환 키트를 거치게 되며 대상 영역을 증폭하기 위해 개발된 프라이머로 증폭됩니다.
DNA는 이중 PCR 절차를 사용하여 시퀀싱을 위한 PCR 증폭물을 생성하기 위해 특정 프라이머로 후속 PCR 증폭에 사용될 것입니다.
PCR 반응의 산물은 DNA 메틸화 수준을 정량화할 수 있는 인덱싱된 MiSeq 차세대 시퀀싱을 받게 됩니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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M 점수 및 HCC 확률 점수 계산
기간: 6개월~1년
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우리는 'HCC-검출'(간세포 암종 검출) 및 'HCC-spec'(간세포 암종 특이성)에 대한 중앙값 메틸화 값(범위 0-100)을 표준화했습니다.
'HCC-Detect'는 HCC를 광범위하게 식별하는 것을 목표로 CHFR, VASH2, CCNJ 및 GRID2IP 영역에서 파생됩니다.
이론적 범위는 -6.6438 ~ 8.6438이며 관측치는 -3.541 ~ 7.65입니다. 점수가 높을수록 HCC 가능성이 증가함을 나타냅니다.
F12 영역에 초점을 맞춘 'HCC-spec'은 이론적 범위 -3.3219 ~ 6.64385(관측치 -3.3219 ~ 6.6297)로 HCC를 31개의 다른 암 및 정상 세포와 구별합니다.
점수가 높을수록 HCC 특이성이 더 크다는 것을 의미합니다.
Prism의 로지스틱 회귀를 통해 모델링된 두 점수 모두 HCC 확률을 예측하여 높은 점수를 더 높은 HCC 가능성 또는 특이성과 연결합니다.
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6개월~1년
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
수사관
- 수석 연구원: Wasif Ali Khan, PhD, nternational Centre for Diarrhoeal Disease Research
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
2018년 8월 20일
기본 완료 (실제)
2020년 6월 1일
연구 완료 (실제)
2020년 11월 1일
연구 등록 날짜
최초 제출
2018년 3월 20일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2018년 3월 28일
처음 게시됨 (실제)
2018년 3월 30일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2024년 7월 5일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2024년 7월 2일
마지막으로 확인됨
2024년 7월 1일
추가 정보
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