CtDNA의 DNA 메틸화 변화를 이용한 HCC 스크리닝
순환종양 DNA, PBMC 및 T 세포의 DNA 메틸화에 기반한 비침습적 방법으로 간세포암종 검출에 대한 임상 시험
간세포 암종(HCC)은 전 세계적으로 다섯 번째로 흔한 암입니다. 특히 아시아에서 많이 발생하며, B형 간염이 유행하는 지역에서 가장 많이 발생하여 인과관계가 있을 수 있습니다. 만성 간염 환자와 같은 고위험군에 대한 후속 조치와 만성 간염에서 HCC로의 전이에 대한 조기 진단은 치료율을 향상시킬 것입니다. 대부분의 경우 HCC는 늦게 발견되어 사망률과 이환율이 증가합니다.
본 연구의 목적은 간세포암종 환자에서 PBMC 및 순환종양 DNA의 메틸화 변화에 기반한 비침습적 바이오마커를 개발하고 시험하는 것이다.
연구 개요
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Dhaka, 방글라데시
- Infectious Diseases Division
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- EASL-EORTC 가이드라인에 따른 간세포암종 진단 확정
- AASLD 진료 지침을 사용하여 HepB 환자에 대한 B형 간염 진단을 확인했습니다.
HCC에 대한 제외 기준:
- 간경변증, T 세포 및 단핵구 특성을 변화시킬 수 있는 기타 알려진 염증성 질환(B형 또는 C형 간염을 제외한 박테리아 또는 바이러스 감염, 당뇨병, 천식, 자가면역 질환, 활동성 갑상선 질환)
- 기타 암.
HepB에 대한 제외 기준:
- HCC 또는 기타 암의 진단.
건강한 통제를 위한 제외 기준:
- HepB 및 HepC를 포함한 모든 알려진 염증성 또는 전염병
- 만성질환,
- 암
- 약물 또는 약물 사용
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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만성 B형 간염
이 그룹에는 B형 간염 피험자가 있는 50명이 포함되며 진단은 AASLD 진료 가이드라인을 기반으로 합니다.
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HCC 환자, 건강한 개인 및 B형 간염 환자의 혈액 샘플을 수집하고 PBMC에서 DNA를 추출하고 순환하는 종양 DNA를 바이설파이트 전환에 적용할 것입니다.
PBMC DNA의 DNA는 AHNAK-STAP1 유전자용으로 개발된 프라이머로 분석됩니다.
혈장 샘플은 EZ 직접 DNA 추출 및 bisulfite 변환 키트를 거치게 되며 대상 영역을 증폭하기 위해 개발된 프라이머로 증폭됩니다.
DNA는 이중 PCR 절차를 사용하여 시퀀싱을 위한 PCR 증폭물을 생성하기 위해 특정 프라이머로 후속 PCR 증폭에 사용될 것입니다.
PCR 반응의 산물은 DNA 메틸화 수준을 정량화할 수 있는 인덱싱된 MiSeq 차세대 시퀀싱을 받게 됩니다.
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HCC 사례
이 그룹에는 간세포 암종의 0기, A기, B기, C+D기의 350명이 포함됩니다. HCC 병기는 EASL-EORTC 임상 진료 지침: 간세포 암종 관리에 따라 진단됩니다. |
HCC 환자, 건강한 개인 및 B형 간염 환자의 혈액 샘플을 수집하고 PBMC에서 DNA를 추출하고 순환하는 종양 DNA를 바이설파이트 전환에 적용할 것입니다.
PBMC DNA의 DNA는 AHNAK-STAP1 유전자용으로 개발된 프라이머로 분석됩니다.
혈장 샘플은 EZ 직접 DNA 추출 및 bisulfite 변환 키트를 거치게 되며 대상 영역을 증폭하기 위해 개발된 프라이머로 증폭됩니다.
DNA는 이중 PCR 절차를 사용하여 시퀀싱을 위한 PCR 증폭물을 생성하기 위해 특정 프라이머로 후속 PCR 증폭에 사용될 것입니다.
PCR 반응의 산물은 DNA 메틸화 수준을 정량화할 수 있는 인덱싱된 MiSeq 차세대 시퀀싱을 받게 됩니다.
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건강한
이 그룹에는 50개의 건강한 성별 및 연령 일치 컨트롤이 포함됩니다.
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HCC 환자, 건강한 개인 및 B형 간염 환자의 혈액 샘플을 수집하고 PBMC에서 DNA를 추출하고 순환하는 종양 DNA를 바이설파이트 전환에 적용할 것입니다.
PBMC DNA의 DNA는 AHNAK-STAP1 유전자용으로 개발된 프라이머로 분석됩니다.
혈장 샘플은 EZ 직접 DNA 추출 및 bisulfite 변환 키트를 거치게 되며 대상 영역을 증폭하기 위해 개발된 프라이머로 증폭됩니다.
DNA는 이중 PCR 절차를 사용하여 시퀀싱을 위한 PCR 증폭물을 생성하기 위해 특정 프라이머로 후속 PCR 증폭에 사용될 것입니다.
PCR 반응의 산물은 DNA 메틸화 수준을 정량화할 수 있는 인덱싱된 MiSeq 차세대 시퀀싱을 받게 됩니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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순환종양 및 PBMC DNA의 DNA 메틸화와 간세포암종의 발생 및 예측과의 상관관계
기간: 6개월 ~ 1년
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우리는 100명의 환자 훈련 세트를 기반으로 유방암과 대조군을 구별하는 선형 모델과 임계값을 개발할 것입니다. 모델은 연구원에게 제공됩니다. 메틸화 점수 = CG1*b1+CG2*b2+ CG3*b3 + e CG1은 첫 번째 CG의 메틸화 값입니다. b1은 첫 번째 CG의 회귀 계수이고 e는 절편과 같습니다. 우리는 각 CG에 대한 각 환자의 DNA 메틸화 값뿐만 아니라 회귀 계수와 절편을 개발할 것입니다. 먼저 각 환자의 polygenic methylation 점수를 계산합니다. 그런 다음 훈련 코호트를 기반으로 하는 컴퓨터 임계값을 기반으로 샘플을 간암인지 여부를 호출합니다. |
6개월 ~ 1년
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공동 작업자 및 조사자
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
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