HCC screening pomocí DNA methylace Změny v ctDNA
2. července 2024 aktualizováno: HKGepitherapeutics
Klinické studie detekce hepatocelulárního karcinomu neinvazivní metodou založenou na methylaci DNA cirkulující nádorové DNA, PBMC a T buněk
Hepatocelulární karcinom (HCC) je celosvětově pátým nejčastějším nádorovým onemocněním. Převládá zejména v Asii a její výskyt je nejvyšší v oblastech, kde převládá hepatitida B, což ukazuje na možnou příčinnou souvislost. Sledování vysoce rizikových populací, jako jsou pacienti s chronickou hepatitidou, a včasná diagnostika přechodu z chronické hepatitidy na HCC by zlepšilo míru vyléčení. Ve většině případů je HCC detekován pozdě, což má za následek zvýšenou mortalitu a morbiditu.
Účelem této studie je vyvinout a otestovat neinvazivní biomarkery založené na metylačních změnách v PBMC a cirkulující nádorové DNA u pacientů s hepatocelulárním karcinomem.
Přehled studie
Postavení
Dokončeno
Podmínky
Intervence / Léčba
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Aktuální)
403
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní místa
-
-
-
Dhaka, Bangladéš
- Infectious Diseases Division
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ne
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
Staging HCC bude diagnostikován podle Směrnic klinické praxe EASL-EORTC: Management hepatocelulárního karcinomu.
Pacienti budou rozděleni do čtyř skupin, včetně stádia 0 (1) (n=100), stádia A (2) (n=100), stádia B (3) (n=100) a stádia C+D (4). (n=100).
Jako kontroly zařadíme chronickou hepatitidu B (n=100), jejíž diagnóza bude potvrzena pomocí praktických pokynů AASLD pro chronickou hepatitidu B, a kontroly zdravého pohlaví a věku (n=100).
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Potvrzená diagnóza HCC podle doporučení EASL-EORTC
- Potvrzená diagnóza hepatitidy B u pacientů s HepB pomocí praktických pokynů AASLD.
Kritéria vyloučení pro HCC:
- Cirhóza, jakékoli jiné známé zánětlivé onemocnění (bakteriální nebo virová infekce s výjimkou hepatitidy B nebo C, diabetes, astma, autoimunitní onemocnění, aktivní onemocnění štítné žlázy), které by mohlo změnit vlastnosti T buněk a monocytů
- Jiné rakoviny.
Kritéria vyloučení pro HepB:
- Diagnóza HCC nebo jakékoli jiné rakoviny.
Kritéria vyloučení pro zdravé kontroly:
- Jakékoli známé zánětlivé nebo infekční onemocnění včetně HepB a HepC
- Chronická onemocnění,
- Rakovina
- Léky nebo užívání drog
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
chronická hepatitida B
Tato skupina bude zahrnovat 50 pacientů s hepatitidou B a diagnózy budou založeny na praktických pokynech AASLD.
|
Bude odebrán vzorek krve od pacientů s HCC, zdravých jedinců a jedinců s hepatitidou B a DNA bude extrahována z PBMC a cirkulující nádorová DNA bude podrobena bisulfitové konverzi.
DNA z PBMC DNA bude analyzována pomocí primerů vyvinutých pro geny AHNAK-STAP1.
Vzorky plazmy budou podrobeny EZ přímé extrakci DNA a bisulfitové konverzní soupravě a budou amplifikovány primery vyvinutými pro amplifikaci cílových oblastí.
DNA bude použita pro následnou PCR amplifikaci se specifickým primerem pro vytvoření PCR amplikonu pro sekvenování pomocí postupu double PCR.
Produkt PCR reakce bude podroben indexovanému sekvenování MiSeq Next-Generation, které nám umožní kvantifikovat úroveň metylace DNA.
|
|
Případy HCC
Tato skupina bude zahrnovat 350 ve stadiu 0, stadiu A, stadiu B, stadiu C+D hepatocelulárního karcinomu. Staging HCC bude diagnostikován podle pokynů klinické praxe EASL-EORTC: Léčba hepatocelulárního karcinomu |
Bude odebrán vzorek krve od pacientů s HCC, zdravých jedinců a jedinců s hepatitidou B a DNA bude extrahována z PBMC a cirkulující nádorová DNA bude podrobena bisulfitové konverzi.
DNA z PBMC DNA bude analyzována pomocí primerů vyvinutých pro geny AHNAK-STAP1.
Vzorky plazmy budou podrobeny EZ přímé extrakci DNA a bisulfitové konverzní soupravě a budou amplifikovány primery vyvinutými pro amplifikaci cílových oblastí.
DNA bude použita pro následnou PCR amplifikaci se specifickým primerem pro vytvoření PCR amplikonu pro sekvenování pomocí postupu double PCR.
Produkt PCR reakce bude podroben indexovanému sekvenování MiSeq Next-Generation, které nám umožní kvantifikovat úroveň metylace DNA.
|
|
Zdravý
Tato skupina bude zahrnovat 50 zdravých kontrol podle pohlaví a věku.
|
Bude odebrán vzorek krve od pacientů s HCC, zdravých jedinců a jedinců s hepatitidou B a DNA bude extrahována z PBMC a cirkulující nádorová DNA bude podrobena bisulfitové konverzi.
DNA z PBMC DNA bude analyzována pomocí primerů vyvinutých pro geny AHNAK-STAP1.
Vzorky plazmy budou podrobeny EZ přímé extrakci DNA a bisulfitové konverzní soupravě a budou amplifikovány primery vyvinutými pro amplifikaci cílových oblastí.
DNA bude použita pro následnou PCR amplifikaci se specifickým primerem pro vytvoření PCR amplikonu pro sekvenování pomocí postupu double PCR.
Produkt PCR reakce bude podroben indexovanému sekvenování MiSeq Next-Generation, které nám umožní kvantifikovat úroveň metylace DNA.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Výpočet skóre M a skóre pravděpodobnosti HCC
Časové okno: 6 měsíců až 1 rok
|
Normalizovali jsme střední hodnoty methylace (rozsah 0-100) pro „HCC-detect“ (detekce hepatocelulárního karcinomu) a „HCC-spec“ (specificita hepatocelulárního karcinomu).
„HCC-detect“ je odvozen z oblastí CHFR, VASH2, CCNJ a GRID2IP s cílem široce identifikovat HCC.
Teoretický rozsah je -6,6438 až 8,6438, s pozorovaným -3,541 až 7,65; vyšší skóre ukazuje na zvýšenou pravděpodobnost HCC.
'HCC-spec' se zaměřením na oblast F12 odlišuje HCC od 31 jiných rakovin a normálních buněk s teoretickým rozsahem -3,3219 až 6,64385 (pozorováno -3,3219 až 6,6297).
Vyšší skóre znamená větší specifitu HCC.
Obě skóre, modelovaná pomocí logistické regrese v Prism, předpovídají pravděpodobnost HCC, spojují vyšší skóre s vyšší pravděpodobností nebo specificitou HCC
|
6 měsíců až 1 rok
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Sponzor
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Wasif Ali Khan, PhD, nternational Centre for Diarrhoeal Disease Research
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
20. srpna 2018
Primární dokončení (Aktuální)
1. června 2020
Dokončení studie (Aktuální)
1. listopadu 2020
Termíny zápisu do studia
První předloženo
20. března 2018
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
28. března 2018
První zveřejněno (Aktuální)
30. března 2018
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
5. července 2024
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
2. července 2024
Naposledy ověřeno
1. července 2024
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- HKG-Bng-HCC-100
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
NEROZHODNÝ
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Ne
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Ne
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Hepatocelulární karcinom
-
Mayo ClinicNáborMnohočetný myelom | Myelodysplastický syndrom | Pokročilý lymfom | Pokročilý maligní solidní novotvar | Pokročilý karcinom pankreatu | Novotvar hematopoetického a lymfoidního systému | Pokročilý karcinom plic | Pokročilý hepatocelulární karcinom | Pokročilý karcinom Merkelových buněk | Pokročilý karcinom prostaty a další podmínkySpojené státy