HCC screening pomocí DNA methylace Změny v ctDNA
Klinické studie detekce hepatocelulárního karcinomu neinvazivní metodou založenou na methylaci DNA cirkulující nádorové DNA, PBMC a T buněk
Hepatocelulární karcinom (HCC) je celosvětově pátým nejčastějším nádorovým onemocněním. Převládá zejména v Asii a její výskyt je nejvyšší v oblastech, kde převládá hepatitida B, což ukazuje na možnou příčinnou souvislost. Sledování vysoce rizikových populací, jako jsou pacienti s chronickou hepatitidou, a včasná diagnostika přechodu z chronické hepatitidy na HCC by zlepšilo míru vyléčení. Ve většině případů je HCC detekován pozdě, což má za následek zvýšenou mortalitu a morbiditu.
Účelem této studie je vyvinout a otestovat neinvazivní biomarkery založené na metylačních změnách v PBMC a cirkulující nádorové DNA u pacientů s hepatocelulárním karcinomem.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Dhaka, Bangladéš
- Infectious Diseases Division
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Potvrzená diagnóza HCC podle doporučení EASL-EORTC
- Potvrzená diagnóza hepatitidy B u pacientů s HepB pomocí praktických pokynů AASLD.
Kritéria vyloučení pro HCC:
- Cirhóza, jakékoli jiné známé zánětlivé onemocnění (bakteriální nebo virová infekce s výjimkou hepatitidy B nebo C, diabetes, astma, autoimunitní onemocnění, aktivní onemocnění štítné žlázy), které by mohlo změnit vlastnosti T buněk a monocytů
- Jiné rakoviny.
Kritéria vyloučení pro HepB:
- Diagnóza HCC nebo jakékoli jiné rakoviny.
Kritéria vyloučení pro zdravé kontroly:
- Jakékoli známé zánětlivé nebo infekční onemocnění včetně HepB a HepC
- Chronická onemocnění,
- Rakovina
- Léky nebo užívání drog
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
chronická hepatitida B
Tato skupina bude zahrnovat 50 pacientů s hepatitidou B a diagnózy budou založeny na praktických pokynech AASLD.
|
Bude odebrán vzorek krve od pacientů s HCC, zdravých jedinců a jedinců s hepatitidou B a DNA bude extrahována z PBMC a cirkulující nádorová DNA bude podrobena bisulfitové konverzi.
DNA z PBMC DNA bude analyzována pomocí primerů vyvinutých pro geny AHNAK-STAP1.
Vzorky plazmy budou podrobeny EZ přímé extrakci DNA a bisulfitové konverzní soupravě a budou amplifikovány primery vyvinutými pro amplifikaci cílových oblastí.
DNA bude použita pro následnou PCR amplifikaci se specifickým primerem pro vytvoření PCR amplikonu pro sekvenování pomocí postupu double PCR.
Produkt PCR reakce bude podroben indexovanému sekvenování MiSeq Next-Generation, které nám umožní kvantifikovat úroveň metylace DNA.
|
|
Případy HCC
Tato skupina bude zahrnovat 350 ve stadiu 0, stadiu A, stadiu B, stadiu C+D hepatocelulárního karcinomu. Staging HCC bude diagnostikován podle pokynů klinické praxe EASL-EORTC: Léčba hepatocelulárního karcinomu |
Bude odebrán vzorek krve od pacientů s HCC, zdravých jedinců a jedinců s hepatitidou B a DNA bude extrahována z PBMC a cirkulující nádorová DNA bude podrobena bisulfitové konverzi.
DNA z PBMC DNA bude analyzována pomocí primerů vyvinutých pro geny AHNAK-STAP1.
Vzorky plazmy budou podrobeny EZ přímé extrakci DNA a bisulfitové konverzní soupravě a budou amplifikovány primery vyvinutými pro amplifikaci cílových oblastí.
DNA bude použita pro následnou PCR amplifikaci se specifickým primerem pro vytvoření PCR amplikonu pro sekvenování pomocí postupu double PCR.
Produkt PCR reakce bude podroben indexovanému sekvenování MiSeq Next-Generation, které nám umožní kvantifikovat úroveň metylace DNA.
|
|
Zdravý
Tato skupina bude zahrnovat 50 zdravých kontrol podle pohlaví a věku.
|
Bude odebrán vzorek krve od pacientů s HCC, zdravých jedinců a jedinců s hepatitidou B a DNA bude extrahována z PBMC a cirkulující nádorová DNA bude podrobena bisulfitové konverzi.
DNA z PBMC DNA bude analyzována pomocí primerů vyvinutých pro geny AHNAK-STAP1.
Vzorky plazmy budou podrobeny EZ přímé extrakci DNA a bisulfitové konverzní soupravě a budou amplifikovány primery vyvinutými pro amplifikaci cílových oblastí.
DNA bude použita pro následnou PCR amplifikaci se specifickým primerem pro vytvoření PCR amplikonu pro sekvenování pomocí postupu double PCR.
Produkt PCR reakce bude podroben indexovanému sekvenování MiSeq Next-Generation, které nám umožní kvantifikovat úroveň metylace DNA.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Metylace DNA cirkulujícího nádoru a PBMC DNA a její korelace s vývojem a predikcí HCC
Časové okno: 6 měsíců až 1 rok
|
Vyvineme lineární model a prahovou hodnotu odlišující karcinom prsu od kontroly na základě tréninkového souboru 100 pacientů. Model bude poskytnut výzkumníkům: Skóre methylace=CG1*b1+CG2*b2+ CG3*b3 + e CG1 je methylační hodnota prvního CG, b1 je regresní koeficient pro první CG a e se rovná průsečíku. Vypracujeme regresní koeficient a intercept a také hodnoty metylace DNA pro každého pacienta pro každé CG. Nejprve spočítáme skóre polygenní metylace pro každého pacienta. Potom na základě prahu počítače založeného na tréninkové kohortě bude skupina označovat vzorky za rakovinu jater nebo ne. |
6 měsíců až 1 rok
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Spolupracovníci
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- HKG-Bng-HCC-100
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .