HCC-screening met behulp van DNA-methylatieveranderingen in ctDNA
2 juli 2024 bijgewerkt door: HKGepitherapeutics
Klinische onderzoeken naar detectie van hepatocellulair carcinoom met niet-invasieve methode op basis van DNA-methylatie van circulerend tumor-DNA, PBMC en T-cellen
Hepatocellulair carcinoom (HCC) is wereldwijd de vijfde meest voorkomende vorm van kanker. Het komt vooral voor in Azië en komt het meest voor in gebieden waar hepatitis B voorkomt, wat wijst op een mogelijk oorzakelijk verband. Follow-up van risicopopulaties zoals chronische hepatitispatiënten en vroege diagnose van overgangen van chronische hepatitis naar HCC zouden de genezingspercentages verbeteren. In de meeste gevallen wordt HCC laat ontdekt, wat leidt tot verhoogde mortaliteit en morbiditeit.
Het doel van deze studie is het ontwikkelen en testen van niet-invasieve biomarkers op basis van methyleringsveranderingen in PBMC en circulerend tumor-DNA bij hepatocellulaire carcinomenpatiënten.
Studie Overzicht
Toestand
Voltooid
Conditie
Interventie / Behandeling
Studietype
Observationeel
Inschrijving (Werkelijk)
403
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studie Locaties
-
-
-
Dhaka, Bangladesh
- Infectious Diseases Division
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
18 jaar en ouder (Volwassen, Oudere volwassene)
Accepteert gezonde vrijwilligers
Nee
Bemonsteringsmethode
Niet-waarschijnlijkheidssteekproef
Studie Bevolking
HCC-stadiëring zal worden gediagnosticeerd volgens de EASL-EORTC Clinical Practice Guidelines: Management of hepatocellular carcinoma.
De patiënten worden verdeeld in vier groepen, waaronder stadium 0 (1) (n=100), stadium A (2) (n=100), stadium B (3) (n=100) en stadium C+D (4). (n=100).
Als controlegroep rekruteren we chronische hepatitis B (n=100), waarvan de diagnose wordt bevestigd aan de hand van de AASLD-praktijkrichtlijn voor chronische hepatitis B, en gezonde, naar geslacht en leeftijd gematchte controles (n=100).
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Bevestigde diagnose van HCC door EASL-EORTC-richtlijnen
- Bevestigde hepatitis B-diagnose voor HepB-patiënten met behulp van AASLD-praktijkrichtlijnen.
Uitsluitingscriteria voor HCC:
- Cirrose, elke andere bekende ontstekingsziekte (bacteriële of virale infectie met uitzondering van hepatitis B of C, diabetes, astma, auto-immuunziekte, actieve schildklierziekte) die de kenmerken van T-cellen en monocyten kan veranderen
- Andere kankers.
Uitsluitingscriteria voor HepB:
- Diagnose van HCC of een andere vorm van kanker.
Uitsluitingscriteria voor gezonde controles:
- Elke bekende ontstekings- of infectieziekte, waaronder HepB en HepC
- Chronische ziektes,
- Kanker
- Medicijnen of drugsgebruik
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
chronische hepatitis B
Deze groep zal bestaan uit 50 patiënten met hepatitis B en de diagnoses zullen gebaseerd zijn op de AASLD-praktijkrichtlijn.
|
Diagnostische toets: ctDNA-methylatie in en zijn correlatie met ontwikkeling en voorspelling van HCC
Bloedmonsters van patiënten met HCC, gezonde individuen en individuen met hepatitis B zullen worden verzameld, en DNA zal worden geëxtraheerd uit PBMC en circulerend tumor-DNA zal worden onderworpen aan bisulfietconversie.
DNA van PBMC DNA zal geanalyseerd worden met primers ontwikkeld voor de AHNAK-STAP1 genen.
Plasmamonsters zullen worden onderworpen aan EZ directe DNA-extractie en bisulfietconversiekit en zullen worden geamplificeerd met primers die zijn ontwikkeld om de doelregio's te amplificeren.
DNA zal worden gebruikt voor de daaropvolgende PCR-amplificatie met specifieke primer om PCR-amplicon te genereren voor sequentiebepaling met behulp van een dubbele PCR-procedure.
Het product van de PCR-reactie zal worden onderworpen aan geïndexeerde MiSeq Next-Generation sequencing waarmee we het DNA-methylatieniveau kunnen kwantificeren.
|
|
HCC-gevallen
Deze groep omvat 350 in stadium 0, stadium A, stadium B, stadium C+D van hepatocellulair carcinoom. HCC-stadiëring zal worden gediagnosticeerd volgens de EASL-EORTC Clinical Practice Guidelines: Beheer van hepatocellulair carcinoom |
Diagnostische toets: ctDNA-methylatie in en zijn correlatie met ontwikkeling en voorspelling van HCC
Bloedmonsters van patiënten met HCC, gezonde individuen en individuen met hepatitis B zullen worden verzameld, en DNA zal worden geëxtraheerd uit PBMC en circulerend tumor-DNA zal worden onderworpen aan bisulfietconversie.
DNA van PBMC DNA zal geanalyseerd worden met primers ontwikkeld voor de AHNAK-STAP1 genen.
Plasmamonsters zullen worden onderworpen aan EZ directe DNA-extractie en bisulfietconversiekit en zullen worden geamplificeerd met primers die zijn ontwikkeld om de doelregio's te amplificeren.
DNA zal worden gebruikt voor de daaropvolgende PCR-amplificatie met specifieke primer om PCR-amplicon te genereren voor sequentiebepaling met behulp van een dubbele PCR-procedure.
Het product van de PCR-reactie zal worden onderworpen aan geïndexeerde MiSeq Next-Generation sequencing waarmee we het DNA-methylatieniveau kunnen kwantificeren.
|
|
Gezond
Deze groep zal 50 gezonde, op geslacht en leeftijd afgestemde controles bevatten.
|
Diagnostische toets: ctDNA-methylatie in en zijn correlatie met ontwikkeling en voorspelling van HCC
Bloedmonsters van patiënten met HCC, gezonde individuen en individuen met hepatitis B zullen worden verzameld, en DNA zal worden geëxtraheerd uit PBMC en circulerend tumor-DNA zal worden onderworpen aan bisulfietconversie.
DNA van PBMC DNA zal geanalyseerd worden met primers ontwikkeld voor de AHNAK-STAP1 genen.
Plasmamonsters zullen worden onderworpen aan EZ directe DNA-extractie en bisulfietconversiekit en zullen worden geamplificeerd met primers die zijn ontwikkeld om de doelregio's te amplificeren.
DNA zal worden gebruikt voor de daaropvolgende PCR-amplificatie met specifieke primer om PCR-amplicon te genereren voor sequentiebepaling met behulp van een dubbele PCR-procedure.
Het product van de PCR-reactie zal worden onderworpen aan geïndexeerde MiSeq Next-Generation sequencing waarmee we het DNA-methylatieniveau kunnen kwantificeren.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Berekening van M-scores en HCC-waarschijnlijkheidsscores
Tijdsspanne: 6 maanden tot 1 jaar
|
We normaliseerden de mediane methyleringswaarden (bereik 0-100) voor 'HCC-detect' (hepatocellulaire carcinoomdetectie) en 'HCC-spec' (hepatocellulaire carcinoomspecificiteit).
'HCC-detect' is afgeleid van CHFR-, VASH2-, CCNJ- en GRID2IP-regio's, met als doel HCC breed te identificeren.
Theoretisch bereik is -6,6438 tot 8,6438, met waargenomen -3,541 tot 7,65; hogere scores duiden op een grotere kans op HCC.
'HCC-specificatie', gericht op het F12-gebied, onderscheidt HCC van 31 andere kankers en normale cellen, met een theoretisch bereik van -3,3219 tot 6,64385 (waargenomen -3,3219 tot 6,6297).
Hogere scores duiden op een grotere HCC-specificiteit.
Beide scores, gemodelleerd via logistische regressie in Prism, voorspellen de HCC-waarschijnlijkheid, waarbij hogere scores worden gekoppeld aan een hogere HCC-waarschijnlijkheid of specificiteit
|
6 maanden tot 1 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Wasif Ali Khan, PhD, nternational Centre for Diarrhoeal Disease Research
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
20 augustus 2018
Primaire voltooiing (Werkelijk)
1 juni 2020
Studie voltooiing (Werkelijk)
1 november 2020
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
20 maart 2018
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
28 maart 2018
Eerst geplaatst (Werkelijk)
30 maart 2018
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
5 juli 2024
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
2 juli 2024
Laatst geverifieerd
1 juli 2024
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- HKG-Bng-HCC-100
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
ONBESLIST
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Nee
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Nee
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .