HCC-screening met behulp van DNA-methylatieveranderingen in ctDNA
Klinische onderzoeken naar detectie van hepatocellulair carcinoom met niet-invasieve methode op basis van DNA-methylatie van circulerend tumor-DNA, PBMC en T-cellen
Hepatocellulair carcinoom (HCC) is wereldwijd de vijfde meest voorkomende vorm van kanker. Het komt vooral voor in Azië en komt het meest voor in gebieden waar hepatitis B voorkomt, wat wijst op een mogelijk oorzakelijk verband. Follow-up van risicopopulaties zoals chronische hepatitispatiënten en vroege diagnose van overgangen van chronische hepatitis naar HCC zouden de genezingspercentages verbeteren. In de meeste gevallen wordt HCC laat ontdekt, wat leidt tot verhoogde mortaliteit en morbiditeit.
Het doel van deze studie is het ontwikkelen en testen van niet-invasieve biomarkers op basis van methyleringsveranderingen in PBMC en circulerend tumor-DNA bij hepatocellulaire carcinomenpatiënten.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Dhaka, Bangladesh
- Infectious Diseases Division
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Bevestigde diagnose van HCC door EASL-EORTC-richtlijnen
- Bevestigde hepatitis B-diagnose voor HepB-patiënten met behulp van AASLD-praktijkrichtlijnen.
Uitsluitingscriteria voor HCC:
- Cirrose, elke andere bekende ontstekingsziekte (bacteriële of virale infectie met uitzondering van hepatitis B of C, diabetes, astma, auto-immuunziekte, actieve schildklierziekte) die de kenmerken van T-cellen en monocyten kan veranderen
- Andere kankers.
Uitsluitingscriteria voor HepB:
- Diagnose van HCC of een andere vorm van kanker.
Uitsluitingscriteria voor gezonde controles:
- Elke bekende ontstekings- of infectieziekte, waaronder HepB en HepC
- Chronische ziektes,
- Kanker
- Medicijnen of drugsgebruik
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
chronische hepatitis B
Deze groep zal bestaan uit 50 patiënten met hepatitis B en de diagnoses zullen gebaseerd zijn op de AASLD-praktijkrichtlijn.
|
Diagnostische toets: ctDNA-methylatie in en zijn correlatie met ontwikkeling en voorspelling van HCC
Bloedmonsters van patiënten met HCC, gezonde individuen en individuen met hepatitis B zullen worden verzameld, en DNA zal worden geëxtraheerd uit PBMC en circulerend tumor-DNA zal worden onderworpen aan bisulfietconversie.
DNA van PBMC DNA zal geanalyseerd worden met primers ontwikkeld voor de AHNAK-STAP1 genen.
Plasmamonsters zullen worden onderworpen aan EZ directe DNA-extractie en bisulfietconversiekit en zullen worden geamplificeerd met primers die zijn ontwikkeld om de doelregio's te amplificeren.
DNA zal worden gebruikt voor de daaropvolgende PCR-amplificatie met specifieke primer om PCR-amplicon te genereren voor sequentiebepaling met behulp van een dubbele PCR-procedure.
Het product van de PCR-reactie zal worden onderworpen aan geïndexeerde MiSeq Next-Generation sequencing waarmee we het DNA-methylatieniveau kunnen kwantificeren.
|
|
HCC-gevallen
Deze groep omvat 350 in stadium 0, stadium A, stadium B, stadium C+D van hepatocellulair carcinoom. HCC-stadiëring zal worden gediagnosticeerd volgens de EASL-EORTC Clinical Practice Guidelines: Beheer van hepatocellulair carcinoom |
Diagnostische toets: ctDNA-methylatie in en zijn correlatie met ontwikkeling en voorspelling van HCC
Bloedmonsters van patiënten met HCC, gezonde individuen en individuen met hepatitis B zullen worden verzameld, en DNA zal worden geëxtraheerd uit PBMC en circulerend tumor-DNA zal worden onderworpen aan bisulfietconversie.
DNA van PBMC DNA zal geanalyseerd worden met primers ontwikkeld voor de AHNAK-STAP1 genen.
Plasmamonsters zullen worden onderworpen aan EZ directe DNA-extractie en bisulfietconversiekit en zullen worden geamplificeerd met primers die zijn ontwikkeld om de doelregio's te amplificeren.
DNA zal worden gebruikt voor de daaropvolgende PCR-amplificatie met specifieke primer om PCR-amplicon te genereren voor sequentiebepaling met behulp van een dubbele PCR-procedure.
Het product van de PCR-reactie zal worden onderworpen aan geïndexeerde MiSeq Next-Generation sequencing waarmee we het DNA-methylatieniveau kunnen kwantificeren.
|
|
Gezond
Deze groep zal 50 gezonde, op geslacht en leeftijd afgestemde controles bevatten.
|
Diagnostische toets: ctDNA-methylatie in en zijn correlatie met ontwikkeling en voorspelling van HCC
Bloedmonsters van patiënten met HCC, gezonde individuen en individuen met hepatitis B zullen worden verzameld, en DNA zal worden geëxtraheerd uit PBMC en circulerend tumor-DNA zal worden onderworpen aan bisulfietconversie.
DNA van PBMC DNA zal geanalyseerd worden met primers ontwikkeld voor de AHNAK-STAP1 genen.
Plasmamonsters zullen worden onderworpen aan EZ directe DNA-extractie en bisulfietconversiekit en zullen worden geamplificeerd met primers die zijn ontwikkeld om de doelregio's te amplificeren.
DNA zal worden gebruikt voor de daaropvolgende PCR-amplificatie met specifieke primer om PCR-amplicon te genereren voor sequentiebepaling met behulp van een dubbele PCR-procedure.
Het product van de PCR-reactie zal worden onderworpen aan geïndexeerde MiSeq Next-Generation sequencing waarmee we het DNA-methylatieniveau kunnen kwantificeren.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
DNA-methylatie van gecirculeerd tumor- en PBMC-DNA en de correlatie ervan met ontwikkeling en voorspelling van HCC
Tijdsspanne: 6 maanden tot 1 jaar
|
We zullen het lineaire model en een drempelwaarde ontwikkelen die borstkanker onderscheidt van controle op basis van de trainingsset voor 100 patiënten. Het model wordt ter beschikking gesteld aan de onderzoekers: Methyleringsscore=CG1*b1+CG2*b2+ CG3*b3 + e CG1 is de methyleringswaarde van de eerste CG b1 is de regressiecoëfficiënt voor de eerste CG en e is gelijk aan het snijpunt. We zullen de regressiecoëfficiënt en interceptie ontwikkelen, evenals de DNA-methylatiewaarden voor elke patiënt voor elk CG. We zullen eerst de polygene methylatiescore voor elke patiënt berekenen. Dan, op basis van de computerdrempel op basis van het trainingscohort, zullen de monsters al dan niet leverkanker noemen. |
6 maanden tot 1 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- HKG-Bng-HCC-100
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .
Klinische onderzoeken op Hepatocellulair carcinoom
-
Hospices Civils de LyonWervingKwaadaardige tumoren als Chordoma, Adenoid Cystic Carcinoma en SarcoomFrankrijk
-
CG Oncology, Inc.BeëindigdCarcinoom in Situ | Overgangscelcarcinoom | Blaaskanker | Carcinoma in situ gelijktijdig met papillaire tumorenVerenigde Staten