使用 ctDNA 中的 DNA 甲基化变化进行 HCC 筛查
2024年7月2日 更新者：HKGepitherapeutics
基于循环肿瘤DNA、PBMC和T细胞DNA甲基化的无创检测肝细胞癌的临床试验
肝细胞癌 (HCC) 是全球第五大常见癌症。 它在亚洲特别普遍，在乙型肝炎流行的地区发生率最高，表明可能存在因果关系。 对慢性肝炎患者等高危人群进行随访，以及对从慢性肝炎向 HCC 转变的早期诊断将提高治愈率。 在大多数情况下，HCC 发现较晚，导致死亡率和发病率增加。
本研究的目的是开发和测试基于 PBMC 甲基化变化和肝细胞癌患者循环肿瘤 DNA 的非侵入性生物标志物。
研究概览
研究类型
观察性的
注册 (实际的)
403
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
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Dhaka、孟加拉国
- Infectious Diseases Division
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
18年 及以上 (成人、年长者)
接受健康志愿者
不
取样方法
非概率样本
研究人群
HCC 分期将根据 EASL-EORTC 临床实践指南：肝细胞癌的管理进行诊断。
患者将被分为四组，包括阶段 0 (1) (n=100)、阶段 A (2) (n=100)、阶段 B (3) (n=100) 和阶段 C+D (4) （n=100）。
作为对照，我们将招募慢性乙型肝炎 (n=100)，其诊断将使用 AASLD 慢性乙型肝炎实践指南以及健康的性别和年龄匹配对照 (n=100) 进行确认。
描述
纳入标准：
- 根据 EASL-EORTC 指南确诊 HCC
- 使用 AASLD 实践指南确认 HepB 患者的乙型肝炎诊断。
HCC 的排除标准：
- 肝硬化，任何其他可能改变 T 细胞和单核细胞特征的已知炎症性疾病（细菌或病毒感染，乙型或丙型肝炎、糖尿病、哮喘、自身免疫性疾病、活动性甲状腺疾病除外）
- 其他癌症。
HepB 的排除标准：
- HCC 或任何其他癌症的诊断。
健康对照的排除标准：
- 任何已知的炎症或传染病，包括 HepB 和 HepC
- 慢性疾病，
- 癌症
- 药物或药物使用
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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慢性乙型肝炎
该组将包括 50 名乙型肝炎受试者，诊断将基于 AASLD 实践指南。
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采集HCC患者、健康人和乙型肝炎患者的血样，提取PBMC的DNA，将循环肿瘤DNA进行亚硫酸氢盐转化。
来自 PBMC DNA 的 DNA 将使用为 AHNAK-STAP1 基因开发的引物进行分析。
血浆样品将接受 EZ 直接 DNA 提取和亚硫酸氢盐转化试剂盒，并将使用为扩增目标区域而开发的引物进行扩增。
DNA 将用于随后的 PCR 扩增，使用特异性引物生成 PCR 扩增子，用于使用双 PCR 程序进行测序。
PCR 反应的产物将进行带索引的 MiSeq 下一代测序，这将使我们能够量化 DNA 甲基化水平。
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肝癌病例
该组将包括 350 名 0 期、A 期、B 期、C+D 期肝细胞癌。 HCC 分期将根据 EASL-EORTC 临床实践指南：肝细胞癌的管理进行诊断 |
采集HCC患者、健康人和乙型肝炎患者的血样，提取PBMC的DNA，将循环肿瘤DNA进行亚硫酸氢盐转化。
来自 PBMC DNA 的 DNA 将使用为 AHNAK-STAP1 基因开发的引物进行分析。
血浆样品将接受 EZ 直接 DNA 提取和亚硫酸氢盐转化试剂盒，并将使用为扩增目标区域而开发的引物进行扩增。
DNA 将用于随后的 PCR 扩增，使用特异性引物生成 PCR 扩增子，用于使用双 PCR 程序进行测序。
PCR 反应的产物将进行带索引的 MiSeq 下一代测序，这将使我们能够量化 DNA 甲基化水平。
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健康
该组将包括 50 名性别和年龄匹配的健康对照。
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采集HCC患者、健康人和乙型肝炎患者的血样，提取PBMC的DNA，将循环肿瘤DNA进行亚硫酸氢盐转化。
来自 PBMC DNA 的 DNA 将使用为 AHNAK-STAP1 基因开发的引物进行分析。
血浆样品将接受 EZ 直接 DNA 提取和亚硫酸氢盐转化试剂盒，并将使用为扩增目标区域而开发的引物进行扩增。
DNA 将用于随后的 PCR 扩增，使用特异性引物生成 PCR 扩增子，用于使用双 PCR 程序进行测序。
PCR 反应的产物将进行带索引的 MiSeq 下一代测序，这将使我们能够量化 DNA 甲基化水平。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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M 分数和 HCC 概率分数的计算
大体时间：6个月至1年
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我们对“HCC-检测”（肝细胞癌检测）和“HCC-spec”（肝细胞癌特异性）的中位甲基化值（范围 0-100）进行了标准化。
“HCC-检测”源自 CHFR、VASH2、CCNJ 和 GRID2IP 区域，旨在广泛识别 HCC。
理论范围为-6.6438至8.6438，观测值为-3.541至7.65；分数越高表明 HCC 可能性越高。
“HCC-spec”专注于 F12 区域，可将 HCC 与 31 种其他癌症和正常细胞区分开来，理论范围为 -3.3219 至 6.64385（观测值 -3.3219 至 6.6297）。
分数越高表示 HCC 特异性越高。
这两个分数均通过 Prism 中的逻辑回归建模，预测 HCC 概率，将较高分数与较高 HCC 可能性或特异性联系起来
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6个月至1年
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
调查人员
- 首席研究员：Wasif Ali Khan, PhD、nternational Centre for Diarrhoeal Disease Research
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2018年8月20日
初级完成 (实际的)
2020年6月1日
研究完成 (实际的)
2020年11月1日
研究注册日期
首次提交
2018年3月20日
首先提交符合 QC 标准的
2018年3月28日
首次发布 (实际的)
2018年3月30日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2024年7月5日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2024年7月2日
最后验证
2024年7月1日
更多信息
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