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HCC-Screening mithilfe von DNA-Methylierungsänderungen in ctDNA

17. Dezember 2020 aktualisiert von: HKGepitherapeutics

Klinische Studien zur Erkennung von hepatozellulärem Karzinom mit einer nicht-invasiven Methode basierend auf der DNA-Methylierung von zirkulierender Tumor-DNA, PBMC und T-Zellen

Das hepatozelluläre Karzinom (HCC) ist weltweit die fünfthäufigste Krebserkrankung. Besonders häufig kommt es in Asien vor, wobei das Vorkommen dort am höchsten ist, wo Hepatitis B vorherrscht, was auf einen möglichen ursächlichen Zusammenhang hindeutet. Die Nachbeobachtung von Hochrisikogruppen wie Patienten mit chronischer Hepatitis und die frühzeitige Diagnose von Übergängen von chronischer Hepatitis zu HCC würden die Heilungsraten verbessern. In den meisten Fällen wird HCC erst spät erkannt, was zu einer erhöhten Mortalität und Morbidität führt.

Der Zweck dieser Studie besteht darin, nicht-invasive Biomarker zu entwickeln und zu testen, die auf Methylierungsänderungen in PBMC und zirkulierender Tumor-DNA bei Patienten mit hepatozellulärem Karzinom basieren.

Studienübersicht

Status

Abgeschlossen

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

403

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

  • Bangladesch
      • Dhaka, Bangladesch
        • Infectious Diseases Division

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre und älter (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Das HCC-Stadium wird gemäß den EASL-EORTC-Richtlinien für die klinische Praxis diagnostiziert: Management von hepatozellulärem Karzinom. Die Patienten werden in vier Gruppen eingeteilt, darunter Stadium 0 (1) (n=100), Stadium A (2) (n=100), Stadium B (3) (n=100) und Stadium C+D (4). (n=100). Als Kontrollen werden wir chronische Hepatitis B (n=100) rekrutieren, deren Diagnose anhand der AASLD-Praxisrichtlinie für chronische Hepatitis B bestätigt wird, sowie gesunde, geschlechts- und altersangepasste Kontrollpersonen (n=100).

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Bestätigte Diagnose von HCC gemäß den EASL-EORTC-Richtlinien
  • Bestätigte Hepatitis-B-Diagnose für HepB-Patienten anhand der AASLD-Praxisrichtlinien.

Ausschlusskriterien für HCC:

  • Zirrhose, jede andere bekannte entzündliche Erkrankung (bakterielle oder virale Infektion mit Ausnahme von Hepatitis B oder C, Diabetes, Asthma, Autoimmunerkrankung, aktive Schilddrüsenerkrankung), die die Eigenschaften von T-Zellen und Monozyten verändern könnte
  • Andere Krebsarten.

Ausschlusskriterien für HepB:

  • Diagnose von HCC oder einer anderen Krebsart.

Ausschlusskriterien für gesunde Kontrollpersonen:

  • Jede bekannte entzündliche oder infektiöse Erkrankung, einschließlich HepB und HepC
  • Chronische Krankheit,
  • Krebs
  • Medikamente oder Drogenkonsum

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
chronische Hepatitis B
Zu dieser Gruppe gehören 50 Hepatitis-B-Patienten und die Diagnosen basieren auf den AASLD-Praxisrichtlinien.
Diagnosetest: ctDNA-Methylierung und ihre Korrelation mit der Entwicklung und Vorhersage von HCC
Es werden Blutproben von Patienten mit HCC, gesunden Personen und Personen mit Hepatitis B entnommen, DNA aus PBMC extrahiert und zirkulierende Tumor-DNA einer Bisulfit-Umwandlung unterzogen. DNA aus PBMC-DNA wird mit Primern analysiert, die für die AHNAK-STAP1-Gene entwickelt wurden. Plasmaproben werden einer EZ-Direkt-DNA-Extraktion und einem Bisulfit-Umwandlungskit unterzogen und mit Primern amplifiziert, die zur Amplifikation der Zielregionen entwickelt wurden. DNA wird für die anschließende PCR-Amplifikation mit spezifischem Primer verwendet, um PCR-Amplifikate für die Sequenzierung mithilfe eines Doppel-PCR-Verfahrens zu erzeugen. Das Produkt der PCR-Reaktion wird einer indizierten MiSeq Next-Generation-Sequenzierung unterzogen, die es uns ermöglicht, den DNA-Methylierungsgrad zu quantifizieren.
HCC-Fälle

Diese Gruppe umfasst 350 im Stadium 0, Stadium A, Stadium B, Stadium C+D des hepatozellulären Karzinoms.

Das HCC-Stadium wird gemäß den EASL-EORTC-Richtlinien für die klinische Praxis diagnostiziert: Management von hepatozellulärem Karzinom
Diagnosetest: ctDNA-Methylierung und ihre Korrelation mit der Entwicklung und Vorhersage von HCC
Es werden Blutproben von Patienten mit HCC, gesunden Personen und Personen mit Hepatitis B entnommen, DNA aus PBMC extrahiert und zirkulierende Tumor-DNA einer Bisulfit-Umwandlung unterzogen. DNA aus PBMC-DNA wird mit Primern analysiert, die für die AHNAK-STAP1-Gene entwickelt wurden. Plasmaproben werden einer EZ-Direkt-DNA-Extraktion und einem Bisulfit-Umwandlungskit unterzogen und mit Primern amplifiziert, die zur Amplifikation der Zielregionen entwickelt wurden. DNA wird für die anschließende PCR-Amplifikation mit spezifischem Primer verwendet, um PCR-Amplifikate für die Sequenzierung mithilfe eines Doppel-PCR-Verfahrens zu erzeugen. Das Produkt der PCR-Reaktion wird einer indizierten MiSeq Next-Generation-Sequenzierung unterzogen, die es uns ermöglicht, den DNA-Methylierungsgrad zu quantifizieren.
Gesund
Zu dieser Gruppe gehören 50 gesunde, geschlechts- und altersangepasste Kontrollpersonen.
Diagnosetest: ctDNA-Methylierung und ihre Korrelation mit der Entwicklung und Vorhersage von HCC
Es werden Blutproben von Patienten mit HCC, gesunden Personen und Personen mit Hepatitis B entnommen, DNA aus PBMC extrahiert und zirkulierende Tumor-DNA einer Bisulfit-Umwandlung unterzogen. DNA aus PBMC-DNA wird mit Primern analysiert, die für die AHNAK-STAP1-Gene entwickelt wurden. Plasmaproben werden einer EZ-Direkt-DNA-Extraktion und einem Bisulfit-Umwandlungskit unterzogen und mit Primern amplifiziert, die zur Amplifikation der Zielregionen entwickelt wurden. DNA wird für die anschließende PCR-Amplifikation mit spezifischem Primer verwendet, um PCR-Amplifikate für die Sequenzierung mithilfe eines Doppel-PCR-Verfahrens zu erzeugen. Das Produkt der PCR-Reaktion wird einer indizierten MiSeq Next-Generation-Sequenzierung unterzogen, die es uns ermöglicht, den DNA-Methylierungsgrad zu quantifizieren.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
DNA-Methylierung von zirkulierender Tumor- und PBMC-DNA und ihre Korrelation mit der Entwicklung und Vorhersage von HCC
Zeitfenster: 6 Monate bis 1 Jahr

Wir werden das lineare Modell und einen Schwellenwert entwickeln, der Brustkrebs von der Kontrollgruppe auf der Grundlage des 100-Patienten-Trainingssatzes unterscheidet. Das Modell wird den Forschern zur Verfügung gestellt:

Methylierungs-Score=CG1*b1+CG2*b2+ CG3*b3 + e

CG1 ist der Methylierungswert des ersten CG, b1 ist der Regressionskoeffizient für den ersten CG und e entspricht dem Achsenabschnitt.

Wir werden den Regressionskoeffizienten und den Schnittpunkt sowie die DNA-Methylierungswerte für jeden Patienten und jeden CG entwickeln. Wir berechnen zunächst den polygenen Methylierungs-Score für jeden Patienten. Basierend auf dem Computerschwellenwert wird die Trainingskohorte dann die Proben als Leberkrebs bezeichnen oder nicht.
6 Monate bis 1 Jahr

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

HKGepitherapeutics

Mitarbeiter

International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

20. August 2018

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

1. Juni 2020

Studienabschluss (Tatsächlich)

1. November 2020

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

20. März 2018

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

28. März 2018

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

30. März 2018

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

21. Dezember 2020

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

17. Dezember 2020

Zuletzt verifiziert

1. Dezember 2020

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • HKG-Bng-HCC-100

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

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UNENTSCHIEDEN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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