HCC-szűrés DNS-metilációval Változások a ctDNS-ben
2024. július 2. frissítette: HKGepitherapeutics
Klinikai vizsgálatok a hepatocelluláris karcinóma kimutatására nem invazív módszerrel, amely a keringő tumor DNS, PBMC és T-sejtek DNS-metilációján alapul
A hepatocelluláris karcinóma (HCC) az ötödik leggyakoribb rák világszerte. Különösen elterjedt Ázsiában, előfordulása azokon a területeken a legmagasabb, ahol a hepatitis B elterjedt, ami lehetséges ok-okozati összefüggésre utal. A magas kockázatú populációk, például a krónikus hepatitisben szenvedők nyomon követése és a krónikus hepatitisről a HCC-re való átmenet korai diagnosztizálása javítaná a gyógyulási arányt. A legtöbb esetben a HCC későn észlelhető, ami megnövekedett mortalitást és morbiditást eredményez.
A tanulmány célja nem invazív biomarkerek kifejlesztése és tesztelése a PBMC-ben és a keringő tumor DNS-ben bekövetkező metilációs változásokon alapuló hepatocelluláris karcinómás betegekben.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Befejezve
Körülmények
Tanulmány típusa
Megfigyelő
Beiratkozás (Tényleges)
403
Kapcsolatok és helyek
Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.
Tanulmányi helyek
-
-
-
Dhaka, Banglades
- Infectious Diseases Division
-
-
Részvételi kritériumok
A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
18 év és régebbi (Felnőtt, Idősebb felnőtt)
Egészséges önkénteseket fogad
Nem
Mintavételi módszer
Nem valószínűségi minta
Tanulmányi populáció
A HCC stádium meghatározását az EASL-EORTC klinikai gyakorlati irányelvei szerint kell diagnosztizálni: Hepatocelluláris karcinóma kezelése.
A betegeket négy csoportra osztják: 0 (1) (n = 100), A (2) (n = 100), B (3) (n = 100) és C+D (4) stádium. (n=100).
Kontrollként krónikus hepatitis B-t (n=100) veszünk fel, amely diagnózist az AASLD krónikus hepatitis B-re vonatkozó gyakorlati irányelvei, valamint az egészséges nemhez és életkorhoz igazodó kontrollcsoportok (n=100) alapján erősítjük meg.
Leírás
Bevételi kritériumok:
- A HCC megerősített diagnózisa az EASL-EORTC irányelvei szerint
- Megerősített hepatitis B diagnózis HepB betegeknél az AASLD gyakorlati irányelvei alapján.
HCC kizárási kritériumai:
- Cirrhosis, bármely más ismert gyulladásos betegség (bakteriális vagy vírusfertőzés, kivéve a hepatitis B vagy C, cukorbetegség, asztma, autoimmun betegség, aktív pajzsmirigybetegség), amely megváltoztathatja a T-sejtek és a monociták jellemzőit
- Egyéb rákos megbetegedések.
A HepB kizárási kritériumai:
- HCC vagy bármely más rák diagnózisa.
Kizárási kritériumok az egészséges kontrollokhoz:
- Bármely ismert gyulladásos vagy fertőző betegség, beleértve a HepB-t és a HepC-t
- Krónikus betegségek,
- Rák
- Gyógyszerek vagy kábítószer-használat
Tanulási terv
Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
krónikus hepatitis B
Ebbe a csoportba 50 hepatitis B-beteg fog tartozni, és a diagnózisok az AASLD gyakorlati irányelvein alapulnak.
|
Diagnosztikai vizsgálat: A ctDNS metilációja és összefüggése a HCC kialakulásával és előrejelzésével
Vérmintát vesznek HCC-s betegektől, egészséges egyénektől és hepatitis B-ben szenvedő egyénektől, és a PBMC-ből kivonják a DNS-t, és a keringő tumor DNS-t biszulfit-konverziónak vetik alá.
A PBMC DNS-ből származó DNS-t az AHNAK-STAP1 génekhez kifejlesztett primerekkel elemzik.
A plazmamintákat EZ közvetlen DNS-extrakciónak és biszulfit-konverziós készletnek vetik alá, és a célrégiók amplifikálására kifejlesztett primerekkel amplifikálják.
A DNS-t használjuk fel a következő PCR-amplifikációhoz specifikus primerrel, hogy PCR-amplikont állítsunk elő a szekvenáláshoz kettős PCR-eljárással.
A PCR-reakció termékét indexált MiSeq Next-Generation szekvenálásnak vetjük alá, amely lehetővé teszi számunkra a DNS metilációs szintjének számszerűsítését.
|
|
HCC tokok
Ez a csoport 350-et fog tartalmazni a hepatocelluláris karcinóma 0, A, B és C+D stádiumában. A HCC stádium meghatározását az EASL-EORTC klinikai gyakorlati irányelvei szerint kell diagnosztizálni: Hepatocelluláris karcinóma kezelése |
Diagnosztikai vizsgálat: A ctDNS metilációja és összefüggése a HCC kialakulásával és előrejelzésével
Vérmintát vesznek HCC-s betegektől, egészséges egyénektől és hepatitis B-ben szenvedő egyénektől, és a PBMC-ből kivonják a DNS-t, és a keringő tumor DNS-t biszulfit-konverziónak vetik alá.
A PBMC DNS-ből származó DNS-t az AHNAK-STAP1 génekhez kifejlesztett primerekkel elemzik.
A plazmamintákat EZ közvetlen DNS-extrakciónak és biszulfit-konverziós készletnek vetik alá, és a célrégiók amplifikálására kifejlesztett primerekkel amplifikálják.
A DNS-t használjuk fel a következő PCR-amplifikációhoz specifikus primerrel, hogy PCR-amplikont állítsunk elő a szekvenáláshoz kettős PCR-eljárással.
A PCR-reakció termékét indexált MiSeq Next-Generation szekvenálásnak vetjük alá, amely lehetővé teszi számunkra a DNS metilációs szintjének számszerűsítését.
|
|
Egészséges
Ebbe a csoportba 50 egészséges nem és életkor megfelelő kontrollcsoport tartozik.
|
Diagnosztikai vizsgálat: A ctDNS metilációja és összefüggése a HCC kialakulásával és előrejelzésével
Vérmintát vesznek HCC-s betegektől, egészséges egyénektől és hepatitis B-ben szenvedő egyénektől, és a PBMC-ből kivonják a DNS-t, és a keringő tumor DNS-t biszulfit-konverziónak vetik alá.
A PBMC DNS-ből származó DNS-t az AHNAK-STAP1 génekhez kifejlesztett primerekkel elemzik.
A plazmamintákat EZ közvetlen DNS-extrakciónak és biszulfit-konverziós készletnek vetik alá, és a célrégiók amplifikálására kifejlesztett primerekkel amplifikálják.
A DNS-t használjuk fel a következő PCR-amplifikációhoz specifikus primerrel, hogy PCR-amplikont állítsunk elő a szekvenáláshoz kettős PCR-eljárással.
A PCR-reakció termékét indexált MiSeq Next-Generation szekvenálásnak vetjük alá, amely lehetővé teszi számunkra a DNS metilációs szintjének számszerűsítését.
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Az M pontszámok és a HCC valószínűségi pontszámok kiszámítása
Időkeret: 6 hónaptól 1 évig
|
Normalizáltuk a 'HCC-detect' (Hepatocellularis Carcinoma Detection) és a 'HCC-spec' (Hepatocellularis Carcinoma Specificity) medián metilációs értékeket (0-100 tartomány).
A „HCC-detect” a CHFR, VASH2, CCNJ és GRID2IP régiókból származik, és célja a HCC széles körű azonosítása.
Az elméleti tartomány -6,6438 és 8,6438 között van, a megfigyelt -3,541 és 7,65 között; a magasabb pontszámok megnövekedett HCC valószínűséget jeleznek.
A „HCC-spec”, amely az F12 régióra összpontosít, megkülönbözteti a HCC-t 31 másik ráktól és normál sejttől, elméleti tartományban -3,3219 és 6,64385 között (megfigyelve: -3,3219 és 6,6297 között).
A magasabb pontszámok nagyobb HCC-specifitást jelentenek.
Mindkét pontszám, logisztikus regresszióval modellezve Prizmában, előrejelzi a HCC valószínűségét, összekapcsolva a magasabb pontszámokat a magasabb HCC valószínűséggel vagy specifitással
|
6 hónaptól 1 évig
|
Együttműködők és nyomozók
Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.
Szponzor
Nyomozók
- Kutatásvezető: Wasif Ali Khan, PhD, nternational Centre for Diarrhoeal Disease Research
Tanulmányi rekorddátumok
Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
2018. augusztus 20.
Elsődleges befejezés (Tényleges)
2020. június 1.
A tanulmány befejezése (Tényleges)
2020. november 1.
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
2018. március 20.
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
2018. március 28.
Első közzététel (Tényleges)
2018. március 30.
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
2024. július 5.
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
2024. július 2.
Utolsó ellenőrzés
2024. július 1.
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- HKG-Bng-HCC-100
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
ELDÖNTETLEN
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Nem
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Nem
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .