HCC-seulonta käyttämällä DNA-metylaatiota Muutokset ctDNA:ssa
tiistai 2. heinäkuuta 2024 päivittänyt: HKGepitherapeutics
Kliiniset tutkimukset hepatosellulaarisen karsinooman havaitsemiseksi ei-invasiivisella menetelmällä, joka perustuu kiertävän kasvain-DNA:n, PBMC:n ja T-solujen DNA-metylaatioon
Hepatosellulaarinen karsinooma (HCC) on viidenneksi yleisin syöpä maailmanlaajuisesti. Se on erityisen yleistä Aasiassa, ja sitä esiintyy eniten alueilla, joilla hepatiitti B on yleistä, mikä viittaa mahdolliseen syy-yhteyteen. Riskiryhmien, kuten kroonista hepatiittia sairastavien, seuranta ja kroonisesta hepatiitista HCC:hen siirtymisen varhainen diagnosointi parantaisivat paranemisastetta. Useimmissa tapauksissa HCC havaitaan myöhään, mikä lisää kuolleisuutta ja sairastuvuutta.
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on kehittää ja testata ei-invasiivisia biomarkkereita, jotka perustuvat PBMC:n ja kiertävän kasvain-DNA:n metylaatiomuutoksiin hepatosellulaarisilla karsinoomapotilailla.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Valmis
Ehdot
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Todellinen)
403
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
Dhaka, Bangladesh
- Infectious Diseases Division
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
HCC-vaihe diagnosoidaan EASL-EORTC Clinical Practice Guidelines: Hepatosellulaarisen karsinooman hoito -ohjeiden mukaisesti.
Potilaat jaetaan neljään ryhmään, mukaan lukien vaihe 0 (1) (n=100), vaihe A (2) (n=100), vaihe B (3) (n=100) ja vaihe C+D (4). (n = 100).
Kontrolleiksi rekrytoimme kroonisen hepatiitti B:n (n=100), jonka diagnoosi vahvistetaan kroonisen hepatiitti B:n AASLD-käytännön ohjeiden mukaisesti sekä terveitä sukupuolta ja ikää vastaavat kontrollit (n=100).
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Vahvistettu HCC-diagnoosi EASL-EORTC-ohjeiden mukaan
- Vahvistettu hepatiitti B -diagnoosi HepB-potilaille AASLD:n käytännön ohjeiden mukaisesti.
HCC:n poissulkemiskriteerit:
- Kirroosi, mikä tahansa muu tunnettu tulehdussairaus (bakteeri- tai virusinfektio, paitsi hepatiitti B tai C, diabetes, astma, autoimmuunisairaus, aktiivinen kilpirauhassairaus), joka voi muuttaa T-solujen ja monosyyttien ominaisuuksia
- Muut syövät.
HepB:n poissulkemiskriteerit:
- HCC:n tai minkä tahansa muun syövän diagnoosi.
Terveiden kontrollien poissulkemiskriteerit:
- Mikä tahansa tunnettu tulehduksellinen tai tartuntatauti, mukaan lukien HepB ja HepC
- Krooniset sairaudet,
- Syöpä
- Lääkkeet tai huumeiden käyttö
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
krooninen hepatiitti B
Tähän ryhmään kuuluu 50 hepatiitti B -potilasta ja diagnoosit perustuvat AASLD:n käytännön ohjeisiin.
|
Verinäyte HCC-potilailta, terveiltä henkilöiltä ja hepatiitti B:tä sairastavilta henkilöiltä kerätään, ja DNA uutetaan PBMC:stä ja kiertävä kasvain-DNA altistetaan bisulfiittikonversiolle.
PBMC-DNA:sta peräisin oleva DNA analysoidaan AHNAK-STAP1-geeneille kehitetyillä alukkeilla.
Plasmanäytteet altistetaan EZ:n suoralle DNA-uutolle ja bisulfiittikonversiopakkaukselle, ja ne monistetaan alukkeilla, jotka on kehitetty monistamaan kohdealueita.
DNA:ta käytetään myöhempään PCR-monistukseen spesifisellä alukkeella PCR-amplikonin muodostamiseksi sekvensointia varten käyttämällä kaksois-PCR-menettelyä.
PCR-reaktion tuotteelle tehdään indeksoitu MiSeq Next-Generation -sekvensointi, jonka avulla voimme kvantifioida DNA:n metylaatiotason.
|
|
HCC-kotelot
Tähän ryhmään kuuluu 350 hepatosellulaarisen karsinooman vaiheessa 0, vaiheessa A, vaiheessa B, vaiheessa C+D. HCC-vaihe diagnosoidaan EASL-EORTC:n kliinisen käytännön ohjeiden mukaisesti: Maksasellulaarisen karsinooman hoito |
Verinäyte HCC-potilailta, terveiltä henkilöiltä ja hepatiitti B:tä sairastavilta henkilöiltä kerätään, ja DNA uutetaan PBMC:stä ja kiertävä kasvain-DNA altistetaan bisulfiittikonversiolle.
PBMC-DNA:sta peräisin oleva DNA analysoidaan AHNAK-STAP1-geeneille kehitetyillä alukkeilla.
Plasmanäytteet altistetaan EZ:n suoralle DNA-uutolle ja bisulfiittikonversiopakkaukselle, ja ne monistetaan alukkeilla, jotka on kehitetty monistamaan kohdealueita.
DNA:ta käytetään myöhempään PCR-monistukseen spesifisellä alukkeella PCR-amplikonin muodostamiseksi sekvensointia varten käyttämällä kaksois-PCR-menettelyä.
PCR-reaktion tuotteelle tehdään indeksoitu MiSeq Next-Generation -sekvensointi, jonka avulla voimme kvantifioida DNA:n metylaatiotason.
|
|
Terve
Tähän ryhmään kuuluu 50 tervettä sukupuolta ja ikää vastaavaa kontrollia.
|
Verinäyte HCC-potilailta, terveiltä henkilöiltä ja hepatiitti B:tä sairastavilta henkilöiltä kerätään, ja DNA uutetaan PBMC:stä ja kiertävä kasvain-DNA altistetaan bisulfiittikonversiolle.
PBMC-DNA:sta peräisin oleva DNA analysoidaan AHNAK-STAP1-geeneille kehitetyillä alukkeilla.
Plasmanäytteet altistetaan EZ:n suoralle DNA-uutolle ja bisulfiittikonversiopakkaukselle, ja ne monistetaan alukkeilla, jotka on kehitetty monistamaan kohdealueita.
DNA:ta käytetään myöhempään PCR-monistukseen spesifisellä alukkeella PCR-amplikonin muodostamiseksi sekvensointia varten käyttämällä kaksois-PCR-menettelyä.
PCR-reaktion tuotteelle tehdään indeksoitu MiSeq Next-Generation -sekvensointi, jonka avulla voimme kvantifioida DNA:n metylaatiotason.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
M-pisteiden ja HCC-todennäköisyyspisteiden laskeminen
Aikaikkuna: 6 kuukaudesta 1 vuoteen
|
Normalisoimme keskimääräiset metylaatioarvot (alue 0-100) 'HCC-detect' (hepatosellular Carcinoma Detection) ja 'HCC-spec' (hepatosellular Carcinoma Spesicity) -spesifisyys.
"HCC-detect" on johdettu CHFR-, VASH2-, CCNJ- ja GRID2IP-alueista, ja sen tarkoituksena on tunnistaa HCC laajasti.
Teoreettinen alue on -6,6438 - 8,6438, havaittu -3,541 - 7,65; korkeammat pisteet osoittavat lisääntyneen HCC-todennäköisyyden.
"HCC-spec", joka keskittyy F12-alueeseen, erottaa HCC:n 31 muusta syövästä ja normaalista solusta teoreettisella alueella -3,3219 - 6,64385 (havaittu -3,3219 - 6,6297).
Korkeammat pisteet merkitsevät suurempaa HCC-spesifisyyttä.
Molemmat pisteet, jotka on mallinnettu logistisella regressiolla Prismassa, ennustavat HCC-todennäköisyyttä ja yhdistävät korkeammat pisteet korkeampaan HCC-todennäköisyyteen tai spesifisyyteen.
|
6 kuukaudesta 1 vuoteen
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Wasif Ali Khan, PhD, nternational Centre for Diarrhoeal Disease Research
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Maanantai 20. elokuuta 2018
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Maanantai 1. kesäkuuta 2020
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Sunnuntai 1. marraskuuta 2020
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Tiistai 20. maaliskuuta 2018
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Keskiviikko 28. maaliskuuta 2018
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Perjantai 30. maaliskuuta 2018
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Perjantai 5. heinäkuuta 2024
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 2. heinäkuuta 2024
Viimeksi vahvistettu
Maanantai 1. heinäkuuta 2024
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- HKG-Bng-HCC-100
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
PÄÄTTÄMÄTÖN
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .