新生児集中治療室における全ゲノム解読

1.0 目的

1.1 研究の目的 この研究プロジェクトの目標は、新生児集中治療室における診断ツールとして全ゲノム配列決定 (WGS) を適用する可能性を評価することです。 新生児集中治療室 (NICU) での治療が必要な新生児は、診断が難しい遺伝子異常を患っていることがよくあります。 研究者らは現在、新生児に影響を与える可能性のある病気を引き起こす可能性のある遺伝子の変異が5000以上あることを知っているため、どの遺伝子が新たな新生児患者の病気の原因となっているかを判断するのは困難を極めている。 しかし、これらの病気の多くは、適時に診断されれば効果的に治療できます。 研究者らは、迅速な分析ツールと組み合わせた新しい配列決定装置を使用して、NICU患者と両親の配列を決定し、患者が既知の疾患遺伝子の1つに新規変異または複合ヘテロ接合性変異を保有しているかどうかを特定することを提案しています。 その場合、その変異は社内の CLIA 検査室で確認され、その結果は 72 時間以内に担当の新生児科医に提供され、治療決定の情報が提供されます。

1.2 主な研究エンドポイント

このプロトコルの主な目的は、WGS が NICU に入院した患者の診断をどの程度改善するかを評価することです。 研究者らは、このプロジェクトの過程で約 50 人の患者の配列決定を行うことを提案しています。 研究者らは、特に患者の登録に使用される最初の選択基準に情報を与えるため、選択した患者における臨床的に対処可能な遺伝的欠陥を特定する成功率を継続的に評価します。 この情報は、そのような配列決定の取り組みが NICU 患者の転帰を改善できるかどうか、また、どのクラスの患者がこの手順から恩恵を受ける可能性が最も高いかを判断するのに役立ちます。

1.3 二次研究エンドポイント

2 番目の目標は、全ゲノム配列決定によって明らかになった遺伝的欠陥を特定する際の、全エクソームまたは 5000 個の遺伝子のパネルの標的配列決定の有効性と、さまざまなアプローチの相対的な費用と時間のコストを評価することです。 これにより、現在他の場所で説明されている方法よりもはるかに効率的でコスト効果の高い方法が得られる可能性があります。

最後に、研究者らは、このデータを使用して、NICU における WGS の費用便益分析の開発を開始することを提案しています。 研究者らは、WGSが新生児科医が当初提案した診断とは異なる診断をどの程度提供したか、また診断の変化が治療計画をどの程度変更したかを評価する予定である。 新しい診断によって実際に治療が変更された場合、研究者は過去のデータを使用して、その変更された治療が患者の NICU 滞在日数にどの程度影響を与えたかを評価します。 その後、研究者は、NICU 滞在日数の節約と NICU 滞在の 1 日あたりのコストと配列決定された患者のコホート全体に対する配列決定の実行コストの積として、コストの節約/損失を見積もることができます。 これはランダム化臨床試験ほど厳密ではありませんが、これがより深く検討する価値のある方法論であるかどうかを示すでしょう。